| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 2130415 = | 86 (1.200) | 4 (0.060) | 3/332 | NT | 5.1% | coding (1784/2496 nt) | fimD | Type 1 pili subunit FimD |
| ? | AE015451 | 2130513 = | 68 (1.000) | coding (1686/2496 nt) | fimD | Type 1 pili subunit FimD | |||||
GCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGT > AE015451/2130298‑2130742 | gCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTg > 2:1001001/1‑234 (MQ=255) cTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTa > 1:78124/1‑236 (MQ=255) cTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTa > 1:952344/1‑236 (MQ=255) tCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTaa > 1:669334/1‑236 (MQ=255) aTAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCa > 1:818491/1‑236 (MQ=255) tAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCa > 1:21105/1‑235 (MQ=255) aGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCa > 2:777998/1‑234 (MQ=255) gggggCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTg > 2:893610/1‑217 (MQ=255) tGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAc < 1:893615/217‑1 (MQ=255) gCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGCTCATTGc > 2:110896/1‑206 (MQ=255) gCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGc < 1:769848/234‑1 (MQ=255) aGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGt < 1:270222/232‑1 (MQ=255) gcagCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAgg > 2:695158/4‑220 (MQ=255) tCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAAcggtcg < 1:187840/197‑1 (MQ=255) cgtGCGGGCGTGTTCGGCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGAt < 2:218021/177‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAgg < 1:1233960/210‑1 (MQ=255) cGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATg < 1:693854/236‑1 (MQ=255) ggCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATtgtg < 2:1249433/203‑1 (MQ=255) tgtTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTggg > 1:978668/1‑235 (MQ=255) gtTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGAt < 1:1010012/228‑1 (MQ=255) ttCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGGCGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGAttt > 2:1010007/1‑194 (MQ=255) cGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCg < 2:1013484/200‑1 (MQ=255) aCGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACt < 2:331478/155‑1 (MQ=255) gcctcacaatcgttgaccgaccgttacggcaatgatcgtcagcttggcctgagcgtgacggtacccttgcatttcggtcaccgcgccaatgcgaccttcgacctgcagcacaacgccaacggctacagccagcgtgccacgctcagGCCaaa < 2:1037563‑M2/6‑1 (MQ=255) ggCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGtt < 1:1104286/235‑1 (MQ=255) ggCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGtt > 1:568473/1‑235 (MQ=255) cTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGAt < 2:559243/217‑1 (MQ=255) aGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTCAcg > 2:23242/1‑167 (MQ=255) gCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTg < 2:651456/234‑1 (MQ=255) tGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGc < 1:157881/192‑1 (MQ=255) cagcgacAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTGGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCGACGATTGTGAGGCGAACAGGtt > 1:1211007/7‑186 (MQ=255) cgccgcgcgcgcgcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCg < 2:185274/170‑1 (MQ=255) cTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGc < 1:1025192/187‑1 (MQ=255) cTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGc > 2:1025187/1‑187 (MQ=255) cTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGt > 2:1182043/1‑214 (MQ=255) cTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTgg > 2:1037392/1‑234 (MQ=255) cTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGt > 1:371389/1‑236 (MQ=255) tCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCg < 2:892783/196‑1 (MQ=255) aGCGCGCGCGGGGTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCg < 2:134595/171‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGCGGCGAACAGGTTGTAga > 2:329484/1‑181 (MQ=255) gcgcgcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACa > 1:1042308/1‑170 (MQ=255) gcgcgcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAg > 2:157878/1‑178 (MQ=255) gcgcgcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGGTGTAGc > 2:812260/1‑179 (MQ=255) cgcgcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATtgc < 1:778003/235‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGGCCGAAATGCAAGGGTACCGTCAAGCTCAGGCGAAAGTGACGATCATTGCCg > 2:932159/1‑135 (MQ=255) gcTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCCCGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCg < 2:334465/183‑1 (MQ=255) gCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATtg < 1:913944/223‑1 (MQ=255) tttggcCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAGCTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGc < 2:1037563‑M1/146‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATtgt < 1:296183/147‑1 (MQ=255) ccGCTGCGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGGCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCg < 2:334203/150‑1 (MQ=255) ctggctgTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTg < 1:345154/175‑1 (MQ=255) ctgTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGGTGa > 2:1119528/1‑172 (MQ=255) gTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGc > 1:357802/1‑223 (MQ=255) tAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCg < 1:1001006/235‑1 (MQ=255) ggCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTcc < 1:167177/236‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCt > 1:298652/1‑236 (MQ=255) cggtgtgCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTg < 2:21104/233‑1 (MQ=255) ttGTGCGGCAGGACGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAggg < 2:263095/217‑1 (MQ=255) tgtgCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGccc < 1:878655/236‑1 (MQ=255) gggctgcAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGGGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTGGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTgcgc < 2:45168/185‑1 (MQ=255) ctgcAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCagtagt > 1:2301/1‑191 (MQ=255) gTCGCAGGGCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTgcgc < 2:507704/178‑1 (MQ=255) gTCGAAGGTCCCATTGGCGCGGTGACCGAATTGCAAGGGTACGGTCACGCTCAGGGCAAACTGACGATCATTGCCGGAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCg < 2:934902/126‑1 (MQ=255) aGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTggg > 1:204403/1‑213 (MQ=255) aGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGAcc > 1:81610/1‑236 (MQ=255) aGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGAc > 1:1135133/1‑235 (MQ=255) cgttGGCGCGGTGACCGAAACGCAAGGGTACCGGCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTg < 2:1116173/132‑1 (MQ=255) cATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGAcc < 2:978663/230‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTc > 1:387236/1‑236 (MQ=255) gcacaacgccaacggctacagccagcgtgccacgctcagGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGc > 2:658407‑M2/40‑87 (MQ=255) gcacaacgccaacggctacagccagcgtgccacgctcagGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGc < 1:658412‑M2/48‑1 (MQ=255) gcacaacgccaacggctacagccagcgtgccacgctcagGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGccc > 1:1054016‑M2/40‑211 (MQ=255) aCCGACATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTGGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGCCAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTg < 1:350906/193‑1 (MQ=255) gccacgctcggGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGccc < 2:765467‑M2/172‑1 (MQ=255) cacgctcagGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTa > 1:1127918‑M2/10‑235 (MQ=255) acgctcagGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCg < 2:653689‑M2/217‑1 (MQ=255) gctcagGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAgtgt < 1:1037397‑M2/230‑1 (MQ=255) | GCACTCACGCTGGCATAGGGGGCCTGATGGCCGAGCGACAGTGCCGCTGTCTTGCGGGCGTGTTCGTCACGGCTCAGGCTGGTGCTGTAGCTCAGCGCGCGCGCGCTGTCGCTGCCGCTGAGCGTGGCACGCTGGCTGTAGCCGTTGGCGTTGTGCTGCAGGTCGAAGGTCGCATTGGCGCGGTGACCGAAATGCAAGGGTACCGTCACGCTCAGGCCAAACTGACGATCATTGCCGTAACGGTCGGTCAACGATTGTGAGGCGAACAGGTTGTAGCCTACACCCCGATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGT > AE015451/2130298‑2130742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |