| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 2986915 = | NA (NA) | 5 (0.070) | 4/334 | NT | 10.4% | coding (1484/2991 nt) | PP_2612 | conserved membrane protein of unknown function |
| ? | AE015451 | 2986959 = | 45 (0.630) | coding (1440/2991 nt) | PP_2612 | conserved membrane protein of unknown function | |||||
TTTCTCGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAGGCTGTAGGGGTTA > AE015451/2986725‑2987163 | ggctgcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttc < 1:1112312‑M2/1‑1 (MQ=255) ttCTCGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACgg < 1:945556/236‑1 (MQ=255) ctgcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttc > 2:1082905‑M2/233‑233 (MQ=255) ctgcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCgg > 1:1283705‑M2/233‑235 (MQ=255) ctgcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCg > 2:786001‑M2/233‑234 (MQ=255) ctgcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGgc > 1:790018‑M2/233‑236 (MQ=255) tcGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGgcg < 1:575722/235‑1 (MQ=255) gcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgcttcgatcggcaccttgttCGgcgc > 1:129155‑M2/231‑236 (MQ=255) gcggcactggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatctcactggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGgcgc > 1:702385‑M2/231‑236 (MQ=255) cGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGgcg > 2:575717/1‑234 (MQ=255) actggcctgttacgaccgcgacgaacgcacctccgcccgcggtctggaaatatcactggcgttgctgcttcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggccggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCg > 1:548550‑M2/226‑227 (MQ=255) 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(MQ=255) gcgcTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGc < 1:76142/236‑1 (MQ=38) gcgcTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGc < 1:1225126/236‑1 (MQ=39) gcggCCAGCTGCGCCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGgcg < 2:418082/214‑1 (MQ=255) ccTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTgg < 1:145045/236‑1 (MQ=38) ccgcccgcggtctggaaatctccctggcgttgctgattcacccaatgggccagccgacacccggcacagaagatcatgaccggcgtttcaaacgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGc < 1:381968‑M2/43‑1 (MQ=255) tCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGcc > 2:516049/1‑217 (MQ=38) 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tATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACTCCGGTCATGAtcttc > 1:373653/1‑214 (MQ=18) gACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTgg > 2:651670/1‑233 (MQ=33) gACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGt > 1:931295/1‑235 (MQ=33) gACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGACGAACAAGGTACCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGAGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGcc > 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ggCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGGgagg > 1:560530/1‑223 (MQ=14) gcaatggccggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGc < 1:238195‑M2/43‑1 (MQ=255) cGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTTGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGa > 2:954762/1‑152 (MQ=14) cGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACcgcg > 2:684446/1‑234 (MQ=31) cGACCGGCGAGCCCTTCGAACACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGgtgt < 1:427664/176‑1 (MQ=14) ggCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGt > 1:1100409/1‑235 (MQ=31) gCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTtc < 1:267952/236‑1 (MQ=31) tttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCgg < 2:1003529‑M2/3‑1 (MQ=255) tttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCgg > 1:1003534‑M2/65‑67 (MQ=255) accgcctgggcgccgttcaccccgttcaaggacaaagccgattcgctcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGAtc < 1:1054489‑M2/78‑1 (MQ=255) ccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCtgt > 2:1266584‑M2/48‑131 (MQ=255) ccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCtgt < 1:1266589‑M2/84‑1 (MQ=255) aggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGgc > 1:1254765‑M2/32‑35 (MQ=255) agCGGCGCCAAGGCGCTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAGGCTGTAGGGGTTa < 1:393709‑M2/205‑1 (MQ=255) | TTTCTCGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAGGCTGTAGGGGTTA > AE015451/2986725‑2987163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |