| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3409687 = | 67 (0.940) | 4 (0.060) | 4/322 | NT | 5.9% | intergenic (‑253/‑283) | PP_3022/PP_3024 | Transcriptional regulator, AraC family/conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | 3409701 = | 66 (1.010) | intergenic (‑267/‑269) | PP_3022/PP_3024 | Transcriptional regulator, AraC family/conserved protein of unknown function | |||||
GTGAACCCGTACAGTTTTTATCGCTGGCTGTTACTTGACCGCAGGGCCCGGAACCCACCGAAATAGAGGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGCCTGGCGCGCCAGGAGTTCTGGGTGGCGGCCGGCA > AE015451/3409474‑3409928 | gTGAACCCGTACAGTTTTTATCGCTGGCTGTTACTTGACCGCAGGGCCCGGAACCCACCGAAATAGAGGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCtt > 1:1173201/1‑235 (MQ=255) ccGTACAGTTTTTATCGCTGGCTGTTACTTGACCGCAGGGCCCGGAACCCACCGAAATAGAGGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTAACCTTGCCt > 2:599663/1‑233 (MQ=255) tgccgcctgggtgatcgcttgccaccacggtctcgctcacgggtgcgcgccacagttgccaggcgatgtagaacaggtaggccgcgcccaccaccttgatggccaggaataggtattcgctggtatgcaacaccactgccaggcccatcgctgccagggcgatcatgccgcagaaggcaaggatacggccggcgccggccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAg < 1:1097854‑M2/36‑1 (MQ=255) gACCGCAGGGCCCGGAACCCACCGAAATAGAGGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATc < 2:1094048/217‑1 (MQ=255) gAAATAGAGGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGGGGTGTTGCATACCCGc > 1:442173/1‑236 (MQ=255) gagGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCAGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCa < 2:601960/197‑1 (MQ=255) cTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTAtt < 1:1204957/236‑1 (MQ=255) tgttgtCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGcc > 1:1115522/1‑167 (MQ=255) tgttgtCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGcc < 2:1115517/167‑1 (MQ=255) agGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGcc < 2:1173196/233‑1 (MQ=255) aaaCGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCg > 2:833188/1‑162 (MQ=255) cGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAggtg > 1:671319/1‑236 (MQ=255) tGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTc < 2:711383/215‑1 (MQ=255) cTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCgg < 1:1236531/235‑1 (MQ=255) tttCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGcc < 1:489253/236‑1 (MQ=255) tttCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGcc < 1:685583/236‑1 (MQ=255) tttCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCAACGCCTGCGTGGCCGTCGCCGGCCGTATCCTTCCCtt > 2:306700/1‑142 (MQ=255) tctCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAg < 1:882344/178‑1 (MQ=255) 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aGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCGCAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCt < 2:1243423/206‑1 (MQ=255) ctTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAgtggt < 1:249797/170‑1 (MQ=255) ctTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAgtggt > 2:249793/1‑170 (MQ=255) ctTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTAtt < 1:616315/194‑1 (MQ=255) ctTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTAtt > 2:616310/1‑194 (MQ=255) ctTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACa > 1:524081/1‑235 (MQ=255) tttCATCCCTGCCCGCTTCGCCCTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCa < 1:487642/179‑1 (MQ=255) accaccttgatggccaggaataggtattcgctggtatgcaacaccactgccaggcccatcgctgccagggcgatcatgccgcagaaggcaaggatacGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCagtggtgg < 1:374087‑M1/71‑2 (MQ=255) aTCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCGGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCAtt > 1:6958/1‑171 (MQ=255) ccccTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATc < 1:325075/196‑1 (MQ=255) ctgcctgcTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCaa < 1:1241670/236‑1 (MQ=255) gcctgcTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCaa < 2:671314/234‑1 (MQ=255) 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ggCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGGGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGGGGCACGCGa > 1:340464/1‑206 (MQ=255) ggCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGAGCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGGGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATc > 2:593891/1‑156 (MQ=255) gCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGCCCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGCCTGgcgcgc > 1:403959/1‑236 (MQ=255) gcgcACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGCCCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAggcgg > 1:167296/1‑213 (MQ=255) cgcACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTa < 2:547309/146‑1 (MQ=255) gcACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGCCTGGCGCGCCAGGa > 1:825427/1‑235 (MQ=255) aCCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCa > 2:393580/1‑155 (MQ=255) aCCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGgc < 2:472822/163‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGgc > 1:472827/1‑163 (MQ=255) aCCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCgtg > 1:27420/1‑186 (MQ=255) tGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCgtg > 1:109621/1‑180 (MQ=255) gCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCCCCCGTGAGAGCGACCgtg > 2:20359/1‑179 (MQ=255) gTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCGTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGCTGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCAGACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTa < 1:434196/134‑1 (MQ=255) ggcgccggccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAAc > 2:398494‑M2/11‑142 (MQ=255) GGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGCCTGGCGCGCCAGGAGTTc < 2:465790‑M1/222‑1 (MQ=255) gcgccggccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGc < 2:340917‑M2/60‑1 (MQ=255) gcgccggccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGcc < 1:1064983‑M2/195‑1 (MQ=255) cgccggccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGCCTGGCGCGCCAGGAGTTCTGGGTGGCGGCCGGCa > 1:549093‑M2/9‑236 (MQ=255) ccggccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCGGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCAccc < 2:107790‑M2/178‑1 (MQ=255) gccGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTgg < 1:543200‑M2/48‑1 (MQ=255) | GTGAACCCGTACAGTTTTTATCGCTGGCTGTTACTTGACCGCAGGGCCCGGAACCCACCGAAATAGAGGGCTGTTGTCAGAGGAAACGAGAATGGACCTTTCAAGCCTGCTGCTTTTCATCCCTGCCTGCTTCGCCTTGAACATGGCGCCAGGGCCTAACAACCTGTTGTCACTGCACAACGCCAGCCGTTACGGCCTGCGCACCGCCTGCGTGGCCGGCGCCGGCCGTATCCTTGCCTTCTGCGGCATGATCGCCCTGGCAGCGATGGGCCTGGCAGTGGTGTTGCATACCAGCGAATACCTATTCCTGGCCATCAAGGTGGTGGGCGCGGCCTACCTGTTCTACATCGCCTGGCAACTGTGGCGCGCACCCGTGAGCGAGACCGTGGTGGCAAGCGATCACCCAGGCGGCACTTGGCGCCTGGCGCGCCAGGAGTTCTGGGTGGCGGCCGGCA > AE015451/3409474‑3409928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |