New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 4355162 | 70 (0.980) | 3 (0.040) | 3/334 | NT | 4.2% | coding (362/681 nt) | modB | Molybdenum transport system permease protein ModB |
? | AE015451 | = 4355227 | 69 (1.010) | coding (427/681 nt) | modB | Molybdenum transport system permease protein ModB | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAGGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGAGCCAGCCCATGGGATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCTGGTGTTCTCTTTCCTGGTGCT > AE015451/4355004‑4355435 | cGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAGGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGAGCCAGCCCATGGGATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGgccc < 1:890199/233‑1 (MQ=255) cACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAGGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGAGCCAGCCCATGGGATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCcgc > 2:706020‑M2/1‑211 (MQ=255) 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gccCATGGGATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCTGGTGTTCTCTTTCCTg < 1:902999/236‑1 (MQ=255) cATGGGATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCTGGTGTTCTCTTTCCTgg < 1:1190514/234‑1 (MQ=255) ggATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTg < 1:58341/92‑1 (MQ=255) gATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACg < 1:152440/163‑1 (MQ=255) tACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCGCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGA‑TTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCt < 1:244611/209‑1 (MQ=255) tACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCTGGTGTTCTCTTTCCTg < 1:333105/226‑1 (MQ=255) ttCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGCTCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGCGCAg > 2:183562/1‑144 (MQ=255) tCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCActggct < 1:76403/186‑1 (MQ=255) tCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCActggct > 2:76402/1‑186 (MQ=255) aTGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTcc > 2:281373/1‑152 (MQ=255) ggtgCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGAAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCTGGTGTTCTCTTTCCTGGtgct > 2:691936/1‑216 (MQ=255) gtgCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCt < 1:71237/194‑1 (MQ=255) | CGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAGGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGAGCCAGCCCATGGGATACCTTCGTTCATGTGGTGCTGCCGCTGGCCCGCCCTGGCTTCGTCACTGCCAGCATCCTCGGCTTTGCCCACACGGTGGGCGAGTTTGGCGTCGTACTGATGATCGGCGGCAACATCCCCGACAAGACTCGCGTGGTTTCGGTGCAGATTTTCGATCACGTCGAAGCCATGGAGTATTCGCAGGCCCACTGGCTGGCCGGTGCCATGCTGGTGTTCTCTTTCCTGGTGCT > AE015451/4355004‑4355435 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |