New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 5965018 = | 92 (1.290) | 3 (0.040) | 3/330 | NT | 3.3% | coding (212/696 nt) | had | putative (S)‑2‑haloacid dehalogenase |
? | AE015451 | 5965067 = | 87 (1.290) | coding (261/696 nt) | had | putative (S)‑2‑haloacid dehalogenase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TCGACGATACCCTGTGGGACACCGCGCCGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGCCCTGTGCGCCGAGGACCTGGGCATTGGCAAGCCAGACCCGGCGCCGTTCCTCGAAG > AE015451/5964835‑5965299 | gACACCGCGCCGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACg > 2:1076426/1‑232 (MQ=255) gcCGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGgcg > 2:560504/1‑214 (MQ=255) gcCGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAg > 2:653157/1‑236 (MQ=255) cGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGc > 2:746299/1‑227 (MQ=255) cGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGa > 1:861494/1‑232 (MQ=255) cgGAAGTCGTGCTGCGCGCCTGGCTCGAGGCCAACGCACCACCCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACGCCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCg < 1:216623/235‑1 (MQ=255) tCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAg < 1:1162422/236‑1 (MQ=255) cGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAg < 1:1276503/235‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGCAGGCGTCGAAGTGTGCCTGCCTGCCCGccaccgg > 1:251666/1‑232 (MQ=255) tgcGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGga < 1:653162/235‑1 (MQ=255) cTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTc < 1:1250287/235‑1 (MQ=255) 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gCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGcc > 2:469624/1‑233 (MQ=255) ccGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAAc < 2:1113687/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAAc > 1:1113692/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCa < 1:585775/236‑1 (MQ=255) ccGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCa < 1:495667/236‑1 (MQ=255) ggTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCa < 2:578257/234‑1 (MQ=255) acCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTg < 1:1122764/236‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAAt > 1:1264404/1‑212 (MQ=255) tCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCtt > 2:951714/1‑197 (MQ=255) agatctccacctggtggcgggcatgcaggaacacttcgaagccttcgttggccagcgcctgtGCGTGCTGGTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGaa < 2:710661‑M1/77‑1 (MQ=255) gcgAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGc > 2:1142869/1‑147 (MQ=255) gcCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCg < 2:1056493/148‑1 (MQ=255) gcCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCg > 1:1056498/1‑148 (MQ=255) 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tGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGCTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGcc > 1:466713/1‑236 (MQ=255) cgcAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGCCCt < 1:470903/236‑1 (MQ=255) gcAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGGGCTCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGc > 1:259289/1‑138 (MQ=255) gcAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGCCCtc > 2:906267/1‑235 (MQ=255) 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TGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGcc < 1:745348‑M1/189‑1 (MQ=255) TGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGcc > 2:745343‑M1/1‑189 (MQ=255) TGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGt < 1:740646‑M1/198‑1 (MQ=255) TGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGAtt < 2:1203891‑M1/207‑1 (MQ=255) 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2:817473‑M2/227‑1 (MQ=255) agcacgcACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGACATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGCCCTGTGCGCCGAGGACCTGGGCATTGGCAAGCCAGACCCGGCGCCg > 1:301844‑M2/8‑230 (MQ=255) cacgcACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGc < 2:1144572‑M2/46‑1 (MQ=255) ccgcACAGGCGCTGGCCACCGACGGCTTCGAAGTGTCCCCGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTgg < 2:266849‑M2/152‑1 (MQ=255) gcacAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGACGTGTCCCCGCATGCCCGCCACCAGGt > 2:20369/1‑56 (MQ=255) gcACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGCCCTGTGCGCCGAGGACCTGGGCATTGGCAAGCCAGACCCGGCGCCGTTCCTCGAAg > 1:206967‑M2/3‑235 (MQ=255) | TCGACGATACCCTGTGGGACACCGCGCCGGTGATTGCCACCGCGGAAGTCGTGCTGCGCGACTGGCTCGAGGCCAACGCACCAACCCTCGGCAGCGTGCCGGTGGAACACCTGTTCGCCATCCGCGAGCGCCTGGTGCAAGCAGAGCCCGGCCTCAAGCACCGCATCAGCGCCCTGCGCAGGCGCGTGCTGTTTCATGCCCTGGAAGAGGTCGGCTACAGCGAACAGCACGCACAGGCGCTGGCCAACGAAGGCTTCGAAGTGTTCCTGCATGCCCGCCACCAGGTGGAGATCTTCCCAGAGGTGCAGCCGGTGCTTGAAATCTTGCGCCATCAATACATCCTGGGGGTGGTCACCAACGGCAATGCCGACGTCAGCCGGCTGGGGTTGGCCGATTACTTCCGCTTTGCCCTGTGCGCCGAGGACCTGGGCATTGGCAAGCCAGACCCGGCGCCGTTCCTCGAAG > AE015451/5964835‑5965299 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |