New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 605066 | 28 (0.690) | 3 (0.080) | 3/322 | NT | 9.5% | coding (379/969 nt) | thiL | thiamin monophosphate kinase |
? | AE015451 | = 605092 | 30 (0.770) | coding (405/969 nt) | thiL | thiamin monophosphate kinase |
GGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAGCTCACCCTCGGGGCTCTGCTGC > AE015451/604843‑605294 | ggTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCgaacacggtcac < 1:536616‑M1/236‑13 (MQ=255) ctctgctgTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGa < 1:717377/219‑1 (MQ=255) gATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCggccgcg < 1:655111‑M2/235‑8 (MQ=255) ccGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGc < 1:500611/235‑1 (MQ=255) tgctTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGc > 1:359002/1‑236 (MQ=255) gCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCGTgc > 1:543429/1‑236 (MQ=255) ggCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACCCCACGCGCGGCCCGt > 1:108985/1‑176 (MQ=255) ccAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCg < 1:268177/236‑1 (MQ=255) ccTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGa > 2:381255/1‑161 (MQ=255) cTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCaccgtgaccg > 1:214076/1‑156 (MQ=255) tGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCggtggt < 2:655110/232‑1 (MQ=255) aCCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTgcg < 2:109581/164‑1 (MQ=255) aCCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGc < 1:459486/235‑1 (MQ=255) cccTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGc > 2:459485/1‑229 (MQ=255) cctgcctgACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTgcgc < 1:492110/163‑1 (MQ=255) tgACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGGGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGc > 1:698174/1‑230 (MQ=255) cTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAgcgc > 1:476972/1‑236 (MQ=255) ggctggcGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGc > 2:669313/1‑156 (MQ=255) ggctggcGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGc < 1:669314/156‑1 (MQ=255) ggcggcCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCgaacacggtcacggtgatgctcaacgggccgc < 2:67426‑M1/112‑33 (MQ=255) ggcggcCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGGGACACCACGCGCGGCCgaacacggtcacggtgatgctcaacgggccgc > 1:67426‑M1/1‑80 (MQ=255) gtGCCGGCGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCaa < 2:227289/180‑1 (MQ=255) cccgACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACCCCACGCGCGGTCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCg > 2:596134‑M2/2‑96 (MQ=255) ggTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg > 2:239682/1‑133 (MQ=255) ccACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTAc < 1:646779/235‑1 (MQ=255) ttGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGctgctg < 2:315650/220‑1 (MQ=255) gCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGtt > 2:152292/1‑135 (MQ=255) cATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTg > 1:505568/1‑225 (MQ=255) cATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGc > 1:647137/1‑236 (MQ=255) ggtggtGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCg < 2:749925/115‑1 (MQ=255) ggtggtGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCg > 1:749926/1‑115 (MQ=255) ggtggtGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAGCTCAccc < 1:332244/235‑1 (MQ=255) ccacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGGGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGGGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGctgctg > 1:151213/1‑191 (MQ=255) acGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTg < 2:108985/141‑1 (MQ=255) cgcgGCCgaacacggtcacggtgatgctcaacgggccgcgcgtggtgtcaccaccgatcaggctcatgcggcaacggtgggccatgcgaccaaggccgtcggcataggccgccagccagtcagggccaacgtcaggcagggtcagtgcgagggtgaagccgattgcagtcgcgcccatggctgccaggtcactggccgccacagccaacgaacgctggccaagcagcaacggatc < 1:655111‑M1/235‑229 (MQ=255) gcgGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCggccgcgcgtggtgtccccaccgatcaggctcatgcggcaacggtgggccatgcgaccaaggccgtcggcataggccgcc > 1:67426‑M2/1‑32 (MQ=255) gcgGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCggccgcgcgtggtgtcaccaccgatcaggctcatgcggcaacggtgggccatgcgaccaaggccgtcggcataggccgcc < 2:67426‑M2/112‑81 (MQ=255) ggCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAGCTCACCCTCgg > 1:20401/1‑221 (MQ=255) cgaacacggtcacggtgatgctcaacggaccgcgcgtggggtcaccaccgatcaggctcatgcggcaacggtgggccatgcgaccaaggccgtcggg > 2:596134‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCTGACTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAGCTCACCCTCGGGGCTCTGCTGC > AE015451/604843‑605294 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |