New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3398276 = | 48 (1.170) | 4 (0.100) | 4/318 | NT | 7.8% | coding (757/819 nt) | PP_3002 | shikimate dehydrogenase‑related enzyme |
? | AE015451 | 3398411 = | 49 (1.270) | coding (69/438 nt) | aroQ‑III | 3‑dehydroquinate dehydratase 3, type II |
CGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTGGGGGCACAGGTCGAGAGCTTCCAGAGCAACTTCGAG > AE015451/3398091‑3398507 | cGAGCCTGACCGCGGACTTGGCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCGCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCCTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACg > 2:461977/1‑233 (MQ=255) aGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGAtt > 2:328468/1‑234 (MQ=255) tGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGAt < 1:328469/236‑1 (MQ=255) cgccCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGAc < 2:461295/211‑1 (MQ=255) gccCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGa < 1:236430/209‑1 (MQ=255) tgCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGAtgct < 1:98635/236‑1 (MQ=255) ggggcggcCTTGGCCTACGGGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGc < 2:662326/179‑1 (MQ=255) gAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACg > 2:8339/1‑164 (MQ=255) aGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCa < 1:544367/235‑1 (MQ=255) gcggcCTGGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATg < 1:312943/230‑1 (MQ=255) gcCTTGGCCTACGGGCTGGCCTATGGCAACGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGAt < 1:290310/201‑1 (MQ=255) aCGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCacaac < 2:468584/231‑1 (MQ=255) gCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCgg > 1:69218/1‑235 (MQ=255) gctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACg < 1:353786‑M1/26‑1 (MQ=255) gctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACg > 2:353785‑M1/114‑139 (MQ=255) tATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACAAGTGCGGTGATCAATCAGCTGCCGATTcccc > 1:62013/1‑165 (MQ=255) gCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGAtt < 1:455923/158‑1 (MQ=255) aGGCCTCACGCCTGTCCGGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGGGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCcg < 1:216993/233‑1 (MQ=255) gCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCCACCacaa > 2:322256/1‑209 (MQ=255) gCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCa > 1:669121/1‑236 (MQ=255) ccTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGa > 1:559608/1‑226 (MQ=255) aCGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGAc < 2:93285/143‑1 (MQ=255) aCGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTAc < 1:579797/179‑1 (MQ=255) ccggcgcCGGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGAtgct < 2:338421/175‑1 (MQ=255) gcCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGGCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTa < 1:107347/145‑1 (MQ=255) tCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCcgcg > 1:307898/1‑208 (MQ=255) cgAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTg < 2:592991/130‑1 (MQ=255) aGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCg < 1:678852/235‑1 (MQ=255) cAGGGCCAGGCGCGCCTGTCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCTTGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGAcc < 1:467173/236‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGt > 1:339269/1‑236 (MQ=255) cgcCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACAt < 1:506959/219‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCa < 1:168120/223‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCcgcgac > 2:133750/1‑184 (MQ=255) gCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATCCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGcaca > 1:92576/1‑196 (MQ=255) aTGGCGGCGGCATGCTGGTGGGGCGGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCga < 1:332167/236‑1 (MQ=255) tGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATgg < 2:684076/142‑1 (MQ=255) tgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATg > 1:385703‑M1/43‑137 (MQ=255) tgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATg < 2:385702‑M1/95‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTa > 1:152603/1‑176 (MQ=255) gCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTa < 2:152602/176‑1 (MQ=255) gCATGCCGGTGGAGCAGGCCGCCGGGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCGATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGAccc < 2:583082/190‑1 (MQ=255) cgggtggAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCGGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTgggg < 2:545727/230‑1 (MQ=255) cTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACg > 2:619044/1‑173 (MQ=255) tggtggAGCAGGCCGCCGCGGCGGTTGCCTGGTGGCGAGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTggggg < 1:227448/232‑1 (MQ=255) ggtggAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCTGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGtt < 1:412637/205‑1 (MQ=255) ggtggAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGAGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGAGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGc > 2:248038/1‑106 (MQ=255) gccgccGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCACTGGGCGAGGAGCt > 2:736889/1‑216 (MQ=255) gccgAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTa < 1:712143/80‑1 (MQ=255) gccgAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTa > 2:712142/1‑80 (MQ=255) gccgAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCaa < 2:654637/138‑1 (MQ=255) ggCGTTTGCCGGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCcg < 2:36252/143‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGAccc < 1:499871/158‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGGGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAg < 2:69218/183‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTGGGGGCACAGGTCGAGAGCTTCCAGAGCAACTTCGAg > 1:753892/1‑236 (MQ=255) | CGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTGGGGGCACAGGTCGAGAGCTTCCAGAGCAACTTCGAG > AE015451/3398091‑3398507 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |