New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3868842 = | 28 (0.690) | 5 (0.130) | 5/320 | NT | 17.6% | coding (1108/1353 nt) | gntT | D‑gluconate transporter |
? | AE015451 | 3868874 = | 20 (0.510) | coding (1140/1353 nt) | gntT | D‑gluconate transporter |
CGCGGCTTCAACCGCCAGCAGATCATGAAGATGCTCGACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAGTACTTCAACATGACCGTGGCAGAAACCTTCAAGACCTGGAGCATGATGGAGACGATCCTGTCCATCGTCGGC > AE015451/3868608‑3869051 | cgcgGCTTCAACCGCCAGCAGATCATGAAGATGCTCGACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCCCCACCAt > 1:375686/1‑236 (MQ=255) ttCAACCGCCAGCAGATCATGAAGATGCTCGACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCg < 1:491205/235‑1 (MQ=255) caacggtcacaccaccagcgacagcaacatgatgaaaatgatgccgacgatggacaggatcgtctccatcatgctccaggtcttgaaggtttctgccacggtcatgttgaagtactgcttcaccagccagaaaccggcatcgttcacatgcgacaggatcagcgagccggcaccggtggccagtaccaacagctcacggttcacccccggcacgagggcgATCACCGGCGCggg < 1:110822‑M1/14‑1 (MQ=255) aTCATGAAGATGCTCGACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTgg < 1:691446/235‑1 (MQ=255) gACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGAc > 2:452077/1‑234 (MQ=255) gACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCt > 1:298791/1‑236 (MQ=255) cACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCg > 1:187999/1‑212 (MQ=255) ccGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGAt > 1:541099/1‑215 (MQ=255) gccgccATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAAc < 1:308435/231‑1 (MQ=255) gccgccATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAAc > 2:308434/1‑231 (MQ=255) catggacaggatcggctccatcatgctccaggtcttgaaggtttctgccccggtcatgttgaagtactgcttcaccagccagaaaccggcatcgttcacatgcgacaggatcagcgagccggcaccggtggccagtaccaacagctcacggttcacccccggcacgaggtcgATCACCGGCGCggg > 2:110822‑M1/173‑186 (MQ=255) cGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCg < 2:381691/204‑1 (MQ=255) gTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGCGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCgg > 1:637342/1‑226 (MQ=255) aaGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCg < 2:568566/157‑1 (MQ=255) cAAGTGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGa < 1:305248/170‑1 (MQ=255) aggtttctgccacggtcatgttgaagtactgcttcaccagccagaaaccggcatcgttcacatgcgacaggatcagcgagccggcaccggtggccagtaccaacagctcacggttcacccccggcacgaggtcgAt > 1:665017‑M1/135‑136 (MQ=255) cgggtggATACCGCGGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCgg < 2:375685/207‑1 (MQ=255) gTAGGCAACGTGATCGTGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATcc < 1:48317/211‑1 (MQ=255) aGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGgcgc < 1:245504/123‑1 (MQ=255) gggCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGCTCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCg < 1:83718/118‑1 (MQ=255) ggCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAg < 1:452078/236‑1 (MQ=255) gCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCCCGACCGGCTCCGCCCCGGTCGCCACCAt > 2:14516/1‑99 (MQ=255) aTTTCTCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCTGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGACGGTTTctggc < 2:703268/202‑1 (MQ=255) tttCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAg < 1:370986/212‑1 (MQ=255) ttCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTg < 2:187998/145‑1 (MQ=255) tgcGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCAGCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAGTACTTCAACATGACCGTGGCa < 1:155887/230‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATcc < 1:98700/167‑1 (MQ=255) cGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGGATCGTGGCACCGGTGATCGAc > 2:115297/1‑104 (MQ=255) aTGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAGTACTTCAACATGACCGTGGCAGAAAccggcatc < 2:387823/234‑7 (MQ=255) ggtggCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGc < 1:159961/132‑1 (MQ=255) gctcacggttcacccccggcacgaggtcgATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGGCCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCt > 1:627577‑M1/30‑117 (MQ=255) gctcacggttcacccccggcacgaggtcgATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCt < 2:627576‑M1/88‑1 (MQ=255) gACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAGTACTTCAACATGACCGTGGCAGAAACCTTCAAGACCTGGAGCATGATGGAGACGATCCTGTCCAtcgtcg < 2:298790/233‑1 (MQ=255) gACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAGTACTTCAACATGACCGTGGCAGAAACCTTCAAGACCTGGAGCATGATGGAGACGATCCTGTCCATCGTCGGc > 1:589428/1‑235 (MQ=255) cggttcacccccggcacgaggtcgATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGaa < 2:560411‑M1/110‑1 (MQ=255) ccACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGa < 2:541098/147‑1 (MQ=255) | CGCGGCTTCAACCGCCAGCAGATCATGAAGATGCTCGACCAGAGCCTGGCACCGACTGCCGCCATCGTGCTGATCGTCGGCGCTGGCGGTGGCTTCAAGCAAATGCTGGTGGATACCGGCGTAGGCAACGTGATCGGGCAGATGGCTGTCCAGGCAGAAATTTCGCCGATCATGCTGGCATGGCTGGTGGCGGCGGTGATCCGCATCGCGACCGGCTCCGCCACGGTCGCCACCATCACCGGCGCGGGTATCGTGGCACCGGTGATCGACCTCGTGCCGGGGGTGAACCGTGAGCTGTTGGTACTGGCCACCGGTGCCGGCTCGCTGATCCTGTCGCATGTGAACGATGCCGGTTTCTGGCTGGTGAAGCAGTACTTCAACATGACCGTGGCAGAAACCTTCAAGACCTGGAGCATGATGGAGACGATCCTGTCCATCGTCGGC > AE015451/3868608‑3869051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |