New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4029531 = | 39 (0.950) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 8.3% | coding (909/1623 nt) | PP_3553 | AMP‑binding domain protein |
? | AE015451 | 4029566 = | 29 (0.750) | coding (944/1623 nt) | PP_3553 | AMP‑binding domain protein |
TGGACGTTGCCAATGTTCCACTGCAACGGCTGGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGT > AE015451/4029301‑4029761 | tgGACGTTGCCAATGTTCCACTGCAACGGCTGGTGCTACCCCTGGACCAGCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGgcg < 1:42439/235‑1 (MQ=255) gTTGCCAATGTTCCACTGCAACGGCTGGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGcac > 1:40462/1‑236 (MQ=255) cAATGTTCCACTGCAACGGCTGGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGcacccc > 1:228205/1‑232 (MQ=255) cACTGCACCGGCTGGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGca < 1:8364/222‑1 (MQ=255) ggTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGt < 1:572824/235‑1 (MQ=255) gctgaaggggttgcgggtcggcgaccatcaggccgtcgagggtcgggtagcgcacgccttggcgagacttgatccgcgcacgctcttccagcgaaagcgcatcccattcgtcatgccaggcacacacggtcaccgggccgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgaccttgatgcccatttgctccac > 2:185264‑M1/193‑193 (MQ=255) aTCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATc < 2:723260/234‑1 (MQ=255) ccGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTc > 1:265271/1‑236 (MQ=255) gCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:729128/236‑1 (MQ=255) ccATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGgcg < 2:228204/167‑1 (MQ=255) tgtTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:17311/217‑1 (MQ=255) gACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:10661/200‑1 (MQ=255) aagaTCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCgtgtg < 1:297034/236‑1 (MQ=255) ccTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCgg < 2:226771/143‑1 (MQ=255) ccTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGtgtgtg < 2:265270/233‑1 (MQ=255) tGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGGGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTgg < 1:764652/236‑1 (MQ=255) aCCCTGAGCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCa < 1:241935/175‑1 (MQ=255) tGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCAt > 2:252658/1‑233 (MQ=255) aGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCaccacc > 2:22456/1‑124 (MQ=255) ccACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCgg < 2:508919/191‑1 (MQ=255) ccACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGc < 2:735282/233‑1 (MQ=255) ggtgcggtgcgCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTc < 1:106729/148‑1 (MQ=255) cggtgcgCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGAt > 2:426099/1‑214 (MQ=255) gggcgcCGACCGTGCTCAACGCGCTGGTCACCAGGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCACCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCg < 2:208305/177‑1 (MQ=255) cGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAACTGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGa > 2:4609/1‑160 (MQ=255) cGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATc > 1:35946/1‑236 (MQ=255) cAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCgtgtg > 1:72594/1‑174 (MQ=255) acggtcaccgggccgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgaccttgatgcccatttgctccaCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCt > 1:99083‑M1/68‑177 (MQ=255) gcTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGCCTACGGCCCGGTGACCgtg > 1:208971/1‑166 (MQ=255) aCATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTAt > 1:270595/1‑82 (MQ=255) aCATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTAt < 2:270594/82‑1 (MQ=255) cgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgcccttgatgcccatttgctccaCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCa < 2:99083‑M1/50‑1 (MQ=255) ccATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCCCCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCt < 1:113503/229‑1 (MQ=255) aTCGAGCACCCGGTGCCGGCCATGGTCGCAGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGCCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGCCCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGTATGCGCTTTCGCCGGAAGAGc > 2:575842/1‑175 (MQ=255) aTCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCg < 2:560330/58‑1 (MQ=255) aTCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCg > 1:560331/1‑58 (MQ=255) aTCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGc < 1:117585/236‑1 (MQ=255) gtgaccttgatgcccatttgctccaCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGAc < 1:476184‑M1/211‑1 (MQ=255) cACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCgg < 2:686884/40‑1 (MQ=255) cACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCgg > 1:686885/1‑40 (MQ=255) cACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTAGGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGAccc < 1:240337/236‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGc > 2:745707/1‑234 (MQ=255) ggTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACCCCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGaacg > 2:32064/1‑139 (MQ=255) gTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAAc < 1:396394/236‑1 (MQ=255) gTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAAc < 1:426100/236‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGt < 1:745708/236‑1 (MQ=255) cGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTc > 1:405324/1‑193 (MQ=255) | TGGACGTTGCCAATGTTCCACTGCAACGGCTGGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGT > AE015451/4029301‑4029761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |