New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4029531 = | 39 (0.950) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 8.3% | coding (909/1623 nt) | PP_3553 | AMP‑binding domain protein |
? | AE015451 | 4029566 = | 29 (0.750) | coding (944/1623 nt) | PP_3553 | AMP‑binding domain protein |
GGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGTACCCCGC > AE015451/4029332‑4029768 | ggTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGt < 1:572824/235‑1 (MQ=255) aTCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATc < 2:723260/234‑1 (MQ=255) ccGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTc > 1:265271/1‑236 (MQ=255) gtcggcgaccatcaggccgtcgagggtcgggtagcgcacgccttggcgagacttgatccgcgcacgctcttccagcgaaagcgcatcccattcgtcatgccaggcacacacggtcaccgggccgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgaccttgatgcccatttgctccacggcgccgataaccttggccggtggtgcggcgccgTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:476184‑M2/25‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:729128/236‑1 (MQ=255) tgtTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:17311/217‑1 (MQ=255) gACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCAc < 1:10661/200‑1 (MQ=255) aagaTCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCgtgtg < 1:297034/236‑1 (MQ=255) ccTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGtgtgtg < 2:265270/233‑1 (MQ=255) tGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGGGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTgg < 1:764652/236‑1 (MQ=255) aCCCTGAGCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCa < 1:241935/175‑1 (MQ=255) tGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCAt > 2:252658/1‑233 (MQ=255) ccACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCgg < 2:508919/191‑1 (MQ=255) ccACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGc < 2:735282/233‑1 (MQ=255) ggtgcggtgcgCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTc < 1:106729/148‑1 (MQ=255) cggtgcgCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGAt > 2:426099/1‑214 (MQ=255) gggcgcCGACCGTGCTCAACGCGCTGGTCACCAGGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCACCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCg < 2:208305/177‑1 (MQ=255) cGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAACTGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGa > 2:4609/1‑160 (MQ=255) cGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATc > 1:35946/1‑236 (MQ=255) aggcacacacggtcaccgggccgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgaccttgatgcccatttgctccacggcgccgataaccttggccggtggtgcggcgccgTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCgt > 1:99083‑M2/111‑177 (MQ=255) cAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCgtgtg > 1:72594/1‑174 (MQ=255) acggtcaccgggccgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgaccttgatgcccatttgctccaCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCt > 1:99083‑M1/68‑177 (MQ=255) gcTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGCCTACGGCCCGGTGACCgtg > 1:208971/1‑166 (MQ=255) cgtagacctcggtcaggccataggtgtgggtgcccttgatgcccatttgctccaCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCa < 2:99083‑M1/50‑1 (MQ=255) ccATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCCCCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCt < 1:113503/229‑1 (MQ=255) aTCGAGCACCCGGTGCCGGCCATGGTCGCAGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGCCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGCCCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGTATGCGCTTTCGCCGGAAGAGc > 2:575842/1‑175 (MQ=255) aTCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGc < 1:117585/236‑1 (MQ=255) gtgaccttgatgcccatttgctccaCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGAc < 1:476184‑M1/211‑1 (MQ=255) cACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTAGGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGAccc < 1:240337/236‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGc > 2:745707/1‑234 (MQ=255) ggTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACCCCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGaacg > 2:32064/1‑139 (MQ=255) gTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAAc < 1:426100/236‑1 (MQ=255) gTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAAc < 1:396394/236‑1 (MQ=255) tgcccatttgctccacggcgccgataaccttggccggtggtgcggcgccgTGGAGCAAATGGGCATCAAGGGCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACg < 2:99083‑M2/54‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGt < 1:745708/236‑1 (MQ=255) cGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTc > 1:405324/1‑193 (MQ=255) GGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATgg < 2:498797‑M1/202‑1 (MQ=255) GCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGTAcccc < 2:637343‑M1/234‑1 (MQ=255) CGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGTACCCcgc < 1:492622‑M1/235‑1 (MQ=255) CGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGTACCCcg > 2:709540‑M1/1‑234 (MQ=255) gTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAACCCCTTCAGc > 2:185264‑M2/2‑193 (MQ=255) tGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCt < 2:33715/154‑1 (MQ=255) tGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCt > 1:33715/1‑154 (MQ=255) | GGTGCTACCCCTGGACCATCACCGCCCTGGCCGGCACCCATGTGTTCCTGCGCCGGGTCGACCCGCAGAAGATCCTGACCCTGATCCGCGAGCACAAAGTCAGCCACCTGTGCGGTGCGCCGATCGTGCTCAACGCGCTGGTCAACATGCCCGAGGCGGCCAAGGCAGCCATCGAGCACCCGGTGCAGGCCATGGTCGCCGGCGCCGCACCACCGGCCAAGGTTATCGGCGCCGTGGAGCAAATGGGCATCAAGGTCACCCACACCTATGGCCTGACCGAGGTCTACGGCCCGGTGACCGTGTGTGCCTGGCATGACGAATGGGATGCGCTTTCGCTGGAAGAGCGTGCGCGGATCAAGTCTCGCCAAGGCGTGCGCTACCCGACCCTCGACGGCCTGATGGTCGCCGACCCGCAAACCCTTCAGCCAGTACCCCGC > AE015451/4029332‑4029768 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |