New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4932141 | 37 (0.910) | 3 (0.080) | 3/322 | NT | 6.9% | coding (77/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 (sigma F) factor for class III flagellar operons |
? | AE015451 | = 4932230 | 45 (1.150) | coding (818/834 nt) | PP_4342 | flagellar synthesis regulator, putative ATPase |
CCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTGAAGGCCAGCGCGCACTTGGAGCGAGGGAAGGCTTCGTAGACGGCA > AE015451/4931942‑4932373 | ccAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg > 1:524155/1‑229 (MQ=255) ccAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCt > 1:586389/1‑236 (MQ=255) tttGCGCTCTTCGTCCAGCATGGCCGCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGcgggacccgtactatgaacgccagcg < 1:221310‑M1/217‑27 (MQ=255) gcgcACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCgg > 1:370667/1‑235 (MQ=255) gCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCt < 1:286031/236‑1 (MQ=255) ccGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGtt < 2:650800/163‑1 (MQ=255) cGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcgccg < 1:439539/192‑1 (MQ=255) aaaGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGAAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGt > 2:424872/1‑209 (MQ=255) gCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCggg > 1:67784/1‑136 (MQ=255) gCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCggg < 2:67784/136‑1 (MQ=255) gcCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCaa > 1:610109/1‑236 (MQ=255) cTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACgg < 2:649679/204‑1 (MQ=255) gtATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGt > 2:544808/1‑185 (MQ=255) cACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTc < 2:442033/135‑1 (MQ=255) cACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGcc > 1:653130/1‑236 (MQ=255) cagcagGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCcgcgcg > 1:404184/1‑235 (MQ=255) cagcagGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCgg > 1:189053/1‑236 (MQ=255) gCCGAGCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTGGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGAGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATc < 2:104894/106‑1 (MQ=255) gATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATtggctg > 1:583649/1‑235 (MQ=255) gATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTCGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGAGGCGCTTGACCCGCGGGGc > 2:125775/1‑90 (MQ=255) aTCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCCTAGTACGGGTCCCGcgctggcg < 2:240795‑M2/182‑9 (MQ=255) cATGCCGGCCTGGATCAGGGCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCt < 2:286625/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTg > 2:53303/1‑132 (MQ=255) tGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaa < 1:562098‑M1/135‑55 (MQ=255) tGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaa > 2:562097‑M1/1‑81 (MQ=255) ccGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGcgct > 2:22745‑M2/1‑168 (MQ=255) cTGGATCAGGTCGTCGACCTGCACGTGGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGcgctggt > 2:116709‑M2/1‑163 (MQ=255) ggATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACaaa > 2:502180/1‑192 (MQ=255) ggATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACaaa < 1:502181/192‑1 (MQ=255) ggATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGGCCcg > 2:205363/1‑161 (MQ=255) cAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTTGCAGCGGCCAGCTGTc > 1:234021/1‑233 (MQ=255) ggTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCt > 1:492458/1‑236 (MQ=255) ccTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCtt > 2:636247/1‑234 (MQ=255) cgcGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGTACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGGAGCGGcc < 2:752516/209‑1 (MQ=255) cGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCt > 1:471098/1‑236 (MQ=255) tgggCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTg < 2:24824/210‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTGAAg > 1:306942/1‑236 (MQ=255) cGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTggg > 2:331481/1‑143 (MQ=255) aaGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTGAAGGCCAg > 1:617819/1‑235 (MQ=255) ccAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGt < 1:168815/105‑1 (MQ=255) ccAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAgc < 2:440092/143‑1 (MQ=255) aGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGAt > 2:36893/1‑164 (MQ=255) gCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCTGccc > 2:519902/1‑64 (MQ=255) tggcgcgcttgaCCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGcgctcgtc < 2:53903‑M2/111‑9 (MQ=255) cGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGCTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGCACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGCTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGACgg > 2:97306/1‑151 (MQ=255) gATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGGACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCa > 2:259297/1‑176 (MQ=255) cgcTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTGAAGGCCAgcgcgc > 1:604024/1‑213 (MQ=255) gACGAGCGcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcgcca < 2:53903‑M1/115‑108 (MQ=255) cgccagCGcgggacccgtactaggaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgcttgccggccaacgtgcaggtcgaggacctgatccaggccggcatgat < 2:240795‑M1/180‑175 (MQ=255) aCCAGCGcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgcttgccggcccacgtgcaggtcgacgacctgatccag > 2:116709‑M1/1‑7 (MQ=255) cAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTG‑AGGCCAGCGCGCACTTGGAGCGAGGGAAGGCTTCGTAGACGGCa < 1:310396/236‑1 (MQ=255) aGCGcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgcttgccggccaacgtgcaggtcgaggacctgatccaggccgg > 2:22745‑M1/1‑4 (MQ=255) aGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTGAAGGCCAgcgcgc > 1:1395/1‑204 (MQ=255) | CCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACCAAGCGCTCGACAAAGAACTCCAGATGGCCGCGCGGATTGGCTGGCAGCGGCCAGCTGTCAACCTTCTGGGCAATCGCCTTGAAGGCCAGCGCGCACTTGGAGCGAGGGAAGGCTTCGTAGACGGCA > AE015451/4931942‑4932373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |