New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 941997 = | 40 (0.980) | 3 (0.080) | 3/316 | NT | 8.3% | coding (3625/18933 nt) | PP_0806 | putative Surface adhesion protein |
? | AE015451 | 942200 = | 29 (0.750) | coding (3422/18933 nt) | PP_0806 | putative Surface adhesion protein |
GCACTTGCACGGTAGCGCCGGGCTCGCCGCGACCGGTGAAAGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAGTGTTGCCAGCGGCATCGGTCGCGGTGGCTTGCAGCACTTCGCCGTCAACTTGTGGCG > AE015451/941970‑942419 | gcACTTGCACGGTAGCGCCGGGCTCGCCGCGACCGGTGAAAGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATg > 1:443033/1‑236 (MQ=255) tAGCGCCGGGCTCGCCGCGACCGGTGAAAGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCcgcg < 1:335110/236‑1 (MQ=255) tAGCGCCGGGCTCGCCGCGACCGGTGAAAGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCcgcg > 1:273360/1‑236 (MQ=255) gccgcGACCGGTGAAAGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCa > 1:311955/1‑236 (MQ=255) gCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTc < 2:575171/231‑1 (MQ=255) ccATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCGGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACg < 2:443672/206‑1 (MQ=255) cATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGa > 1:728615/1‑236 (MQ=255) gTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCGGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCt < 2:644725/190‑1 (MQ=255) tCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGGGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACg < 1:499001/184‑1 (MQ=255) ggTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCa < 2:650882/180‑1 (MQ=255) agcaAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCcgcg > 1:208926/1‑162 (MQ=255) agcaAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCcgcg < 2:208925/162‑1 (MQ=255) caAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATGCGTTGCCGGCGGCAGCGGTGAGGGTGACTGGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCa < 2:84440/163‑1 (MQ=255) gTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAgg < 2:735426/217‑1 (MQ=255) gACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAg < 2:273359/233‑1 (MQ=255) ggTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGGGGTa > 1:183907/1‑234 (MQ=255) gaaGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGt < 2:154050/174‑1 (MQ=255) gccgacttgctgccgcctgcacaaccgactgacctggccttggccgatggcgtcactttcaccggtcgcgAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAg < 1:706518‑M2/37‑1 (MQ=255) ccGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGcgcg > 1:160651/1‑207 (MQ=255) ccGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAGTGTTGc > 1:491298/1‑235 (MQ=255) tcgtTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCa > 2:416306/1‑189 (MQ=255) aCGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCAGCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCgg < 2:276029/167‑1 (MQ=255) cGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGGACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCCCCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGt < 1:28598/199‑1 (MQ=255) aGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCGCGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGggtggt > 1:174423/1‑168 (MQ=255) ggTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCgg < 2:443032/185‑1 (MQ=255) gACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTAGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAGTGTTGCCAGCGGCATCGGTCGCGGTGGCTTgca > 1:413782/1‑236 (MQ=255) gTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGGGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAgtg > 1:154144/1‑201 (MQ=255) tGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAGTGTTGCCAGCgg > 1:631428/1‑210 (MQ=255) cgatggcgtcactttcaccggtcgcgAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCAc < 2:174475‑M2/26‑1 (MQ=255) cgatggcgtcactttcaccggtcgcgAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCAc > 1:174476‑M2/27‑52 (MQ=255) cgcgGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAgg < 1:576796/129‑1 (MQ=255) gACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAGTGTTGCCAGCGGCATCGGTCGCGGTGGCTTGCAGCACTTCGCCGTCAACTTGTGGCg > 1:694357/1‑236 (MQ=255) ggtcgcgGGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGAcc < 2:151875‑M2/147‑1 (MQ=255) | GCACTTGCACGGTAGCGCCGGGCTCGCCGCGACCGGTGAAAGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCAGTCGGTTGTGCAGGCGGCAGCAAGTCGGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGATTCAGGGTGACGGTGAAGGTGCCATCCGCGGCGACGGTACCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGTGCCGGCTTCGCCTCGACCACTGAGCTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATATCCGGCGCGGTGACCGAGCTGGTAACGGAAGTGTTGCCAGCGGCATCGGTCGCGGTGGCTTGCAGCACTTCGCCGTCAACTTGTGGCG > AE015451/941970‑942419 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |