New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 949238 = | 32 (0.780) | 4 (0.100) | 4/318 | NT | 12.8% | coding (80/507 nt) | dsbB | disulfide bond formation protein B |
? | AE015451 | 949363 = | 24 (0.620) | coding (205/507 nt) | dsbB | disulfide bond formation protein B |
CCATCGAAGGAACCGGCAATGAACGAACAAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCTGCCACTGGCAAAGCTGTGGCCACTGGCGTTTCAGGTCGACGGCTTCTGCAGCACGCCGTATCCGCCGATCCTCGGCCTGTCGCTGGCGCAATGG > AE015451/949141‑949593 | ccATCGAATGAGCCGGCAATGAACGAACAAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACcttctt < 1:233505/236‑1 (MQ=255) cATCGAAGGAACCGGCAATGAACGAACAAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACcttctt < 1:276780/235‑1 (MQ=255) aTCGAAGGAACCGGCAATGAACGAACAAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACcttctt < 1:255713/234‑1 (MQ=255) gccgcaacgattccgccaatggcactgagcaccaccaacgcctcgaagaaggtcaggctgcggcgcccgggcatcgccgcagcgatgaaggcaaacacggcaatgaacagcaacgcataacgctgcaggatgcacagcgggcagggtgcctcgccgagcaccacctgcatgtagagggcgccgcAGCCTGACCTTCTTCGAg > 1:266981‑M2/185‑202 (MQ=255) cGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCa < 1:686510/235‑1 (MQ=255) tttCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCAtg > 1:472846/1‑235 (MQ=255) tGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGta < 1:732947/235‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGc < 2:544653/222‑1 (MQ=255) ctgGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTgcggcg > 2:539179/1‑213 (MQ=255) gggCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGcc > 1:670236/1‑234 (MQ=255) gggCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCCGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGc > 2:272494/1‑233 (MQ=255) gCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGTGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAAcc > 1:419985/1‑236 (MQ=255) ctcgaagaaggtcaggctGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTgcggc > 1:266981‑M1/19‑202 (MQ=255) cgaagaaggtcaggctgcggcgcccgggcatcgccgcagcgatgaaggcaaacacggcaatgaacagcaacgcataacgctgcaggatgcacagcgggcagggtgcctcgccgagcaccacctgcatgtagagggcgccgcAGCCt < 2:266980‑M2/5‑1 (MQ=255) aggctGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCg < 2:266980‑M1/141‑1 (MQ=255) ggcggcGCGCTCTACAGGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCTCCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAAcccc < 1:245374/216‑1 (MQ=255) ggcggcGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGa > 1:266810/1‑236 (MQ=255) tcgccgcagcgatgaaggcaaacacggcaatgaacagcaacgcataacgctgcaggatgcacagcgggcagggtgcctcgccgagcaccacctgcatgtagagggcgccgcAGCCTGACCTTCTTCGAgg < 2:673300‑M2/19‑1 (MQ=255) aTGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCCACCATGTGTATATACTCGCCAAccc > 2:29513/1‑200 (MQ=255) ggtgCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTgg > 2:417700/1‑233 (MQ=255) ctgCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATAcc < 1:37582/209‑1 (MQ=255) cGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCaa < 1:611942/162‑1 (MQ=255) cacggcaatgaacagcaacgcataacgctgcaggatgcacagcgggcagggtgcctcgccgagcaccacctgcatgtagagggcgccgcAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCaa > 2:3473‑M2/90‑154 (MQ=255) cacggcaatgaacagcaacgcataacgctgcaggatgcacagcgggcagggtgcctcgccgagcaccacctgcatgtagagggcgccgcAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCaa < 1:3473‑M2/65‑1 (MQ=255) cTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCt < 1:65306/222‑1 (MQ=255) gCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAAcc > 2:530852/1‑146 (MQ=255) tGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCTGCCACTGGCAAAGCTGTGGc > 1:524519/1‑215 (MQ=255) gCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCAt > 1:110955/1‑126 (MQ=255) tGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATAcc > 1:616520/1‑164 (MQ=255) gcgATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCTGCCACTGGCAAAGCTGTGGCCACTGGCGTTTCAGGTCGACGGCTTCTGCAGCACGCCGTATc < 2:266809/217‑1 (MQ=255) aTGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCTGCCACTGGCAAAGCTGTGGCCACTGGCGTTTCAGGTCGACGGCTTCTGCAGCACGCCGTATCCGCCGATCCTCGGCCTGTCGc < 1:669650/235‑1 (MQ=255) gccgcAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCTGCCACTGGCAAAGCTGTGGCCACTGGCGTTTCAGGTCGACGGCTTCTGCAGCACGCCGTATCCGCCGATCCTCGGCCTGTCGCTGGCGCAATgg > 1:498528‑M2/6‑236 (MQ=255) | CCATCGAAGGAACCGGCAATGAACGAACAAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTTGCGGTATCGATACCCTGCAGCCGATCGTGGATGACCTGCCACTGGCAAAGCTGTGGCCACTGGCGTTTCAGGTCGACGGCTTCTGCAGCACGCCGTATCCGCCGATCCTCGGCCTGTCGCTGGCGCAATGG > AE015451/949141‑949593 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |