New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4656864 = | 41 (1.000) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 7.4% | coding (257/678 nt) | nuoB | NADH‑quinone oxidoreductase subunit B |
? | AE015451 | 4656948 = | 36 (0.920) | coding (341/678 nt) | nuoB | NADH‑quinone oxidoreductase subunit B |
TCTTCATGGGCAAACTTGAAGATGTGCTGCGTGGCGCGGTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGT > AE015451/4656720‑4657179 | tCTTCATGGGCAAACTTGAAGATGTGCTGCGTGGCGCGGTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCa < 1:530445/235‑1 (MQ=255) cTTCATGGGCAAACTTGAAGATGTGCTGCGTGGCGCGGTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGGTCATCCAg > 1:119926/1‑235 (MQ=255) ttCATGGGCAAACTTGAAGATGTGCTGCGTGGCGCGGTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAgcg < 1:310949/236‑1 (MQ=255) gcGTGGCGCGGTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTAc > 1:624656/1‑217 (MQ=255) ggTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCct > 2:705580/1‑204 (MQ=255) aCTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTa > 2:276671/1‑202 (MQ=255) cAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCa > 2:581261/1‑183 (MQ=255) ccTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACt < 1:586291/236‑1 (MQ=255) tGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCA‑TTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCgg < 1:323491/235‑1 (MQ=255) aaCTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATg > 2:398059/1‑207 (MQ=255) aaCTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCa > 2:289867/1‑220 (MQ=255) aaCTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACt > 2:287313/1‑223 (MQ=255) aaCTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACt < 1:287314/223‑1 (MQ=255) ggCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCg < 1:399846/220‑1 (MQ=255) tCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCg < 2:552394/177‑1 (MQ=255) ctACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGtt > 1:452829/1‑235 (MQ=255) gaaatgacccatttcggctcgagcatctgctcgtagaggcgctggatgaTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAgca < 1:342442‑M1/118‑2 (MQ=255) aaatgacccatttcggctcgagcatctgctcgtagaggcgctggatgaTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGGCGGTACCTGCTTCGTGAAGACGGCGCCGat < 2:660363‑M1/85‑1 (MQ=255) tGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCTCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGCAGATGGCGCCGCTCATCCAgc > 1:237511/1‑138 (MQ=255) aaaTGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTc < 1:341146/236‑1 (MQ=255) ccatttcggctcgagcatctgctcgtagaggcgctggatgaTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCAGTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCCTCCAGCGCCTCTACGCGCAGATGCTCg < 1:581308‑M1/114‑1 (MQ=255) tgctcgagcatctgctcgtagaggcgctggatgatcggcgccatcttcacgaagcaggtaccggcaatgaccatgaagtcggcctgacgcggcgaggcccggatgacttcggcgccgaTCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTc < 1:342442‑M2/49‑1 (MQ=255) cgagcatctgcgcgtagaggcgctggaggatcggcgccatcttcacgaagcaggtaccggcactgaccatgaagtcggcctgacgcggcgaggcccggatgacttcggcgccgaTCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATgg < 1:581308‑M2/41‑1 (MQ=255) aCCCCACGCCATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGt < 2:176593/164‑1 (MQ=255) cccACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGt > 1:352087/1‑145 (MQ=255) cccACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGt < 2:352086/145‑1 (MQ=255) ccGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAgcg > 1:116852/1‑99 (MQ=255) ccGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAgcg < 2:116852/99‑1 (MQ=255) ccGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTc > 2:543922/1‑199 (MQ=255) gCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTg < 1:159155/162‑1 (MQ=255) atcggcgccgtcttcacgaagcaggtaccgccaatgaccatgaagtcggcctgacgcggcgaggcccggatgacttcggcgccgaTCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCAttt < 2:660363‑M2/48‑1 (MQ=255) TCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCg > 2:301555‑M1/1‑119 (MQ=255) GGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTc > 1:9001‑M1/1‑192 (MQ=255) aTCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCg < 2:491992/142‑1 (MQ=255) aTCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGc < 1:417729/236‑1 (MQ=255) cTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCag > 2:167250/1‑140 (MQ=255) cgtgaaGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCt > 1:55549/6‑236 (MQ=255) tCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGcc > 2:306820/1‑178 (MQ=255) gCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCgg > 1:435809/1‑236 (MQ=255) ccGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGAtgctgc > 2:462026/1‑219 (MQ=255) gCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAacg > 1:656304/1‑235 (MQ=255) cGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATTGGTTAGTg > 2:507748/1‑78 (MQ=255) cGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCCCGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCaa > 2:553644/1‑226 (MQ=255) cGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGGGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCACCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCg > 2:399062/1‑217 (MQ=255) ccgaTCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTc < 1:716545‑M2/199‑1 (MQ=255) cgaTCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTc < 2:547627‑M2/170‑1 (MQ=255) cgaTCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCtgggc > 1:224855‑M2/4‑234 (MQ=255) | TCTTCATGGGCAAACTTGAAGATGTGCTGCGTGGCGCGGTCAACTGGGGCCGCAAGAACTCCCTCTGGCCGTACAACTTCGGCCTGTCCTGCTGCTACGTGGAAATGACCACGGCCTTCACGGCACCCCACGACATCGCCCGCTTCGGCGCCGAAGTCATCCGGGCCTCGCCGCGTCAGGCCGACTTCATGGTCATTGCCGGTACCTGCTTCGTGAAGATGGCGCCGATCATCCAGCGCCTCTACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGTGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGT > AE015451/4656720‑4657179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |