Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | CP009273 | 4,053,617 | IS4 (+) +12 bp | 65.7% | intergenic (+27/‑179) | typA → / → yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4053617 = | 23 (0.370) | 47 (0.680) | 45/276 | NT | 65.1% | intergenic (+27/‑190) | typA/yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
? | CP009273 | 4491907 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
* | ? | CP009273 | = 4053628 | 23 (0.370) | 41 (0.600) | 40/276 | NT | 61.9% | intergenic (+38/‑179) | typA/yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
? | CP009273 | = 4493332 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGC > CP009273/4491758‑4492055 | aTCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTa < 1:523168/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcag > 1:1162678/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCca < 1:260247/148‑1 (MQ=255) agaaagcaattaacggcgtatgactttgcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCcagtcagt > 1:196769‑M2/137‑150 (MQ=255) cGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtcag < 2:654157/148‑1 (MQ=255) aaagcaattaacggcgtatgactttgcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTa < 1:763638‑M2/16‑1 (MQ=255) gCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAg < 1:1069646/150‑1 (MQ=255) cATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGc < 1:326966/150‑1 (MQ=255) aTGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGc > 2:57637/1‑149 (MQ=255) tGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCaa > 1:969856/1‑150 (MQ=255) aacggcgtatgactttgcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactga > 1:206590‑M2/126‑150 (MQ=255) acggcgtatgactttgcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgac > 2:1122268‑M2/125‑150 (MQ=255) aTGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgac > 1:450792/1‑150 (MQ=255) tCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgactg < 1:340655/149‑1 (MQ=255) cAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCtt > 1:423177/1‑150 (MQ=255) gactttgcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCttt > 1:691947‑M2/116‑150 (MQ=255) ctttgcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCttttt > 1:834676‑M2/114‑150 (MQ=255) gcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCggg > 1:577661‑M2/110‑150 (MQ=255) gcagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCggg > 2:724279‑M2/110‑150 (MQ=255) cagataattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCggg < 1:1035262‑M2/41‑1 (MQ=255) aattgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCtgtg > 2:329097‑M2/104‑150 (MQ=255) ttgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTgg > 1:1058973‑M2/103‑150 (MQ=255) attgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCtgtg < 2:334692‑M2/47‑1 (MQ=255) attgtgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTgg < 1:352354‑M2/48‑1 (MQ=255) ttGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTa < 1:452599/150‑1 (MQ=255) tgacaaagctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTa > 1:1003787‑M2/99‑150 (MQ=255) tGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTAt > 2:613724/1‑150 (MQ=255) aCGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTAttt < 1:612685/150‑1 (MQ=255) gTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTc > 1:785866/1‑148 (MQ=255) tCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAg < 1:258714/150‑1 (MQ=255) ctctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAgg > 1:254311‑M2/91‑150 (MQ=255) tctctattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAggg > 2:77638‑M2/90‑150 (MQ=255) aGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAggg > 1:674498/1‑150 (MQ=255) aGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAggg < 2:403248/150‑1 (MQ=255) tattgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGc < 1:724279‑M2/62‑1 (MQ=255) ttgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCct < 2:1066134‑M2/64‑1 (MQ=255) ttgacgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCtctc > 2:1183256‑M2/84‑150 (MQ=255) ggggACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCtctc > 1:647752/1‑150 (MQ=255) gACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCtt < 2:737893/150‑1 (MQ=255) acgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCtt < 2:1136540‑M2/70‑1 (MQ=255) cgtaaccacagacttataagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt < 1:36473‑M2/71‑1 (MQ=255) aCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt < 1:154679/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAcc < 1:98554/150‑1 (MQ=255) aacgCTCAGTATTCTCGCCGGCAACCAGATAATCTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGCAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCCTTTTCGGGGCTGTGGGGCATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCAc > 2:822317/4‑150 (MQ=255) aGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCgg < 1:492493/149‑1 (MQ=255) gTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCggg > 1:634140/1‑149 (MQ=255) gTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGa < 2:647752/150‑1 (MQ=255) tATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCggg > 2:502191/1‑148 (MQ=255) aTTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAg > 1:617626/1‑150 (MQ=255) aTTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAg > 2:444454/1‑150 (MQ=255) taagggagatactcgcattggtgtgcgctgacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCAAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTTCTTTAACACTCTCGGGAAg < 2:554762‑M2/86‑1 (MQ=255) taagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAgg < 2:196769‑M2/87‑1 (MQ=255) taagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAgg > 1:490600‑M2/64‑150 (MQ=255) aagggagatactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGc > 2:919853‑M2/63‑150 (MQ=255) tGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTc > 1:1095151/1‑150 (MQ=255) ggCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTc < 1:57637/149‑1 (MQ=255) atactcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTcc > 1:495498‑M2/56‑150 (MQ=255) gCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTcc < 1:170392/149‑1 (MQ=255) cAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCct > 1:990453/1‑150 (MQ=255) ctcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCctt > 2:430256‑M2/53‑150 (MQ=255) tcgcattggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCcttc > 2:40404‑M2/52‑150 (MQ=255) ccAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCcttct > 2:65942/1‑150 (MQ=255) ccAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCcttct < 1:860775/150‑1 (MQ=255) cAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCTCTCTCGGGAAGGCCCTTTCCcttctt < 2:1032187/150‑1 (MQ=255) attggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGt < 2:957465‑M2/103‑1 (MQ=255) ggtgtgcgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCg < 1:395905‑M2/105‑1 (MQ=255) aTTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCgg > 1:939565/1‑149 (MQ=255) tttAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTa < 2:89539/150‑1 (MQ=255) cgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAAttt > 1:10749‑M2/39‑150 (MQ=255) cgctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAAtt < 1:301824‑M2/111‑1 (MQ=255) gctcacgacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCGCTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTc < 2:304434‑M2/113‑1 (MQ=255) aGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTca > 1:12818/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTca > 1:746723/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTca > 1:595334/1‑149 (MQ=255) ttGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTcaca < 2:421491/150‑1 (MQ=255) gacaggcaaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGt > 1:1112463‑M2/32‑150 (MQ=255) aTGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGt > 1:480955/1‑150 (MQ=255) cTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCGCTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGt < 1:547605/150‑1 (MQ=255) cTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTg < 2:1097331/149‑1 (MQ=255) aaaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCa > 1:613791‑M2/25‑150 (MQ=255) aaaaaaaacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCa > 1:631393‑M2/24‑149 (MQ=255) aCGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCa > 2:117965/1‑149 (MQ=255) aCGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCAt < 1:65942/150‑1 (MQ=255) aaTAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACtt < 1:989719/150‑1 (MQ=255) aTAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTg < 1:967077/150‑1 (MQ=255) tAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTg > 2:1104138/1‑149 (MQ=255) aacctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGc < 1:802481‑M2/133‑1 (MQ=255) acctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGc > 2:286347‑M2/17‑149 (MQ=255) cctgccatcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCaa < 2:573036‑M2/135‑1 (MQ=255) tCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGc > 2:968282/1‑144 (MQ=255) catcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATcg < 2:577661‑M2/140‑1 (MQ=255) ttGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATcgc > 1:464195/1‑150 (MQ=255) atcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATGCTTGCAAGAgcgc < 2:495498‑M2/141‑1 (MQ=255) atcgctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATcgc > 1:1174314‑M2/10‑150 (MQ=255) ggTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATcgc < 2:939565/148‑1 (MQ=255) ggTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATc < 1:328679/146‑1 (MQ=255) ctggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGCATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCAt > 2:206511‑M2/6‑150 (MQ=255) gcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAg > 2:450923‑M2/3‑150 (MQ=255) gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGc > 2:930229/1‑150 (MQ=255) cTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGc > 2:298900‑M2/2‑150 (MQ=255) | GATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGC > CP009273/4491758‑4492055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |