| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 4,053,617 | IS4 (+) +12 bp | 65.7% | intergenic (+27/‑179) | typA → / → yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4053617 = | 23 (0.370) | 47 (0.680) | 45/276 | NT | 65.1% | intergenic (+27/‑190) | typA/yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | 4491907 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | CP009273 | = 4053628 | 23 (0.370) | 41 (0.600) | 40/276 | NT | 61.9% | intergenic (+38/‑179) | typA/yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | = 4493332 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATA > CP009273/4493184‑4493481 | gaAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTaa < 2:790725/150‑1 (MQ=255) aaGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgc > 1:1008298‑M2/1‑148 (MQ=255) aaGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAAt > 2:541093/1‑150 (MQ=255) aaGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAAt < 2:822026/150‑1 (MQ=255) aGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgcc > 1:1059993‑M2/1‑147 (MQ=255) aGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTgg > 2:1088021/1‑150 (MQ=255) gggTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTc > 1:994461/1‑150 (MQ=255) aCGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcag > 2:315800‑M2/1‑135 (MQ=255) aCGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGgt < 1:537451/149‑1 (MQ=255) cGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGgtgt > 1:163579/1‑150 (MQ=255) cGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGgtgt > 1:636490/1‑150 (MQ=255) cGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGgtgt > 2:314762/1‑150 (MQ=255) gCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGtt < 2:1100932/150‑1 (MQ=255) gCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGtt < 2:676960/150‑1 (MQ=255) agagAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTg > 1:377605/1‑150 (MQ=255) gagaATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttt < 2:376652‑M2/150‑21 (MQ=255) agaATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggtttttt > 1:1043587‑M2/1‑129 (MQ=255) aTCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACa < 1:851246/150‑1 (MQ=255) gTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgac > 1:395764‑M2/1‑123 (MQ=255) gTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAAc < 2:423349/150‑1 (MQ=255) cGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaa > 1:65735‑M2/1‑119 (MQ=255) gggATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTAt > 2:15546/1‑148 (MQ=255) gggATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAATGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTATCTGATCAGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaa > 2:28075‑M2/1‑118 (MQ=255) gATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGc < 2:377605/150‑1 (MQ=255) aTACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCt < 2:218024/150‑1 (MQ=255) cAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaat < 1:91203‑M2/150‑40 (MQ=255) gATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaatta > 2:396602‑M2/1‑109 (MQ=255) gATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaatt < 1:539853‑M2/149‑41 (MQ=255) tCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACCCAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaat > 2:641469‑M2/1‑107 (MQ=255) tCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACaaaaa > 1:590511/1‑149 (MQ=255) aaGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAata < 2:1047882/149‑1 (MQ=255) agagCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgt > 1:737540‑M2/1‑104 (MQ=255) agagCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATg > 1:1145594/1‑150 (MQ=255) agCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtct < 1:203355‑M2/150‑49 (MQ=255) agCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCt > 2:1023216/1‑150 (MQ=255) gCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctt > 2:895749‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggt < 2:390453‑M2/150‑55 (MQ=255) ccAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTtg > 2:747937/1‑150 (MQ=255) cAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTtgt < 2:520824/150‑1 (MQ=255) cAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTtgt > 1:842883/1‑150 (MQ=255) gtgCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcgg < 1:1086235‑M2/150‑61 (MQ=255) tgCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACa < 1:49676/149‑1 (MQ=255) tgCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACAt < 2:127401/150‑1 (MQ=255) cATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggtt > 1:253210‑M2/1‑87 (MQ=255) cATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACAt > 1:806377/1‑148 (MQ=255) cATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCa < 1:419496/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaTCCGGAAACAAGCGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGCCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcg < 1:963097‑M2/150‑67 (MQ=255) aaaaaaTCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTaa > 1:202998/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcg < 1:192818‑M2/150‑69 (MQ=255) tCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAAc < 1:1148186/150‑1 (MQ=255) cGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCATTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacg > 1:944689‑M2/1‑75 (MQ=255) ggAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAAcgcg > 2:714225/1‑150 (MQ=255) gAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGt > 2:683146/1‑150 (MQ=255) aaCAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgt < 1:833555‑M2/150‑80 (MQ=255) aaCAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGttt < 2:99162/150‑1 (MQ=255) aCAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGtttt > 1:403602/1‑150 (MQ=255) aaGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgtttt < 1:447779‑M2/150‑83 (MQ=255) aaGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGt < 1:176456/150‑1 (MQ=255) aaGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGt < 1:708131/150‑1 (MQ=255) gTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTa > 2:208857/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgt < 2:960393‑M2/149‑87 (MQ=255) gCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTAtgtg > 2:371878/1‑150 (MQ=255) cGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTAtgtg > 2:61061/1‑149 (MQ=255) gTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgtt < 1:164828‑M2/140‑81 (MQ=255) tttCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttt > 2:164828‑M2/1‑59 (MQ=255) cGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacg < 1:559635‑M2/150‑96 (MQ=255) cGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGc < 1:1023216/149‑1 (MQ=255) gATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtt < 1:1054814‑M2/150‑98 (MQ=255) aTTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtt < 1:1084960‑M2/149‑98 (MQ=255) tCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttac < 2:583243‑M2/150‑101 (MQ=255) cacaGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGa < 1:208857/150‑1 (MQ=255) caGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacg > 1:960393‑M2/1‑43 (MQ=255) caGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTAC‑AAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCt < 2:901667/150‑1 (MQ=255) cACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacgga < 2:374938‑M2/148‑110 (MQ=255) aCTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGta > 1:886692/1‑150 (MQ=255) cTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGta > 2:28974/1‑149 (MQ=255) gATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagagg > 1:534559‑M2/1‑34 (MQ=255) gATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagag > 1:572009‑M2/1‑34 (MQ=255) gATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAGTTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATaa > 2:288548/1‑149 (MQ=255) gATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATaa < 2:397671/149‑1 (MQ=255) ggTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAgg < 2:243318/149‑1 (MQ=255) gTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGta > 1:343988/1‑150 (MQ=255) gTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGta < 1:541093/150‑1 (MQ=255) cAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagt < 2:425674‑M2/149‑123 (MQ=255) aaCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGtata > 2:914793/1‑149 (MQ=255) aaCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGtata > 1:849697/1‑149 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcac < 1:132009‑M2/150‑126 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcac < 1:159154‑M2/150‑126 (MQ=255) cTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcact > 1:259505‑M2/1‑24 (MQ=255) aaCTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccag > 2:743289‑M2/1‑15 (MQ=255) aaCTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAg < 1:371878/149‑1 (MQ=255) aCTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccagt > 2:1084960‑M2/1‑14 (MQ=255) gATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccagttcgt < 2:718300‑M2/150‑140 (MQ=255) tCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccagttcgtca < 2:965623‑M2/150‑142 (MQ=255) cGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccagttcgtcat < 2:637008‑M2/150‑143 (MQ=255) ggCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCaaa < 1:734069/150‑1 (MQ=255) gCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAg < 2:202998/150‑1 (MQ=255) ttAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGaaa < 2:343988/150‑1 (MQ=255) tAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccagttcgtcatcatcga < 2:110607‑M2/150‑149 (MQ=255) agccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggcgacgtttacgaatacggatagaggtcggagtcacttctaccagttcgtcatcatcgat < 2:289832‑M2/150‑150 (MQ=255) | GAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATA > CP009273/4493184‑4493481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |