| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | CP009273 | 4,303,167 | Δ450 bp | 100% | coding (1‑450/450 nt) | rpiB → | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP009273 | 4303167 | 4303616 | 450 | 80 [0] | [0] 80 | rpiB | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4303166 | 0 (0.000) | 76 (0.940) | 65/270 | NT | 100% | intergenic (‑358/‑1) | alsR/rpiB | d‑allose‑inducible als operon transcriptional repressor; autorepressor; repressor of rpiR/ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| ? | CP009273 | 4303617 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑68) | rpiB/yjdP | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase/putative periplasmic protein | |||||
TGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/4303021‑4303166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGAC > CP009273/4303617‑4303762 TGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATT > 1:1428777/1‑150 GTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATC > 2:1268979/1‑149 CTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCAC > 1:1057756/1‑150 TTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTA > 2:1272129/1‑150 TTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTA > 1:1446352/1‑150 TTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTA > 1:683199/1‑150 TAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTAC > 1:1286332/1‑150 TAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACT < 2:1352430/148‑1 CGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTG < 2:887299/150‑1 TATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCAT > 1:299099/1‑150 TTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCAT < 1:390419/148‑1 GCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGA < 1:648294/149‑1 CGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGAT < 2:380366/149‑1 GCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGA < 1:503061/150‑1 GCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGA < 1:275463/150‑1 CTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAG < 1:489555/150‑1 GTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGT > 1:1316920/1‑149 ATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGAT > 2:1241895/1‑150 TAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAA > 1:971600/1‑150 AACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAAT > 2:531319/1‑150 CTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGT < 2:495936/150‑1 TGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGA > 1:368950/1‑150 TAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATA < 2:1446352/150‑1 TAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGA < 1:775997/148‑1 AAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAG < 2:1327558/149‑1 CAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTT > 2:1451616/1‑150 GATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTC > 1:141465/1‑150 CAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTT > 2:878899/1‑150 AGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTGTCTTTT < 2:683199/150‑1 AGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGAGGATAGAGTTTCTTTT > 2:19563/1‑150 AGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAG > 2:461341/1‑150 AGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAG < 2:887676/150‑1 GGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGG > 1:485595/1‑150 GGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGG < 2:1067706/150‑1 GCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGT > 2:880638/1‑150 GCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGT > 2:1199849/1‑150 GTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTG < 2:1057756/150‑1 ATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGC > 2:50636/1‑149 TCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGA < 2:299099/150‑1 CGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGA > 1:752335/1‑149 GATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAA > 2:730237/1‑150 GATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAA < 2:739766/149‑1 ATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAAC < 2:1428777/150‑1 TTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACG < 2:1036124/150‑1 TGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCT < 2:1445746/149‑1 TGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCT < 2:1316920/149‑1 GGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGTTGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTC < 1:167832/150‑1 GGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTT < 1:83330/149‑1 GTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCC < 1:1034780/150‑1 TGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCG > 1:269995/1‑150 GTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGC > 1:29164/1‑150 TTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTA < 2:1271958/149‑1 TTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTAT < 2:1012809/149‑1 TAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTT > 2:948279/1‑150 TAATTAATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTT > 2:261796/1‑150 TTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTT < 1:1227067/150‑1 TTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTT < 1:1268979/150‑1 ATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTA < 1:1401358/150‑1 ATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTT < 2:1286332/149‑1 ATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTT < 1:138053/149‑1 TTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTAT > 1:1211882/1‑150 CATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCAC > 1:194076/1‑150 ATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACC > 2:233159/1‑150 ATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACC > 1:60234/1‑150 ACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTG < 1:1234226/150‑1 ACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGGTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCT < 2:971600/149‑1 TGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCAC > 1:1111544/1‑150 GTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACG > 2:1240292/1‑150 TTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGC > 1:186037/1‑150 TTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTG > 2:621933/1‑150 TTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCT < 2:141465/149‑1 ATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCAC > 1:266768/1‑150 TTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACC < 1:1320111/150‑1 TTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACC < 1:935966/150‑1 TGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCG > 1:1058981/1‑150 GTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGT > 2:162684/1‑150 GTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGT > 2:134699/1‑150 AAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATC > 2:208297/1‑150 AAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATC < 1:948279/150‑1 ATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGAC > 2:955745/1‑150 TGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/4303021‑4303166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGAC > CP009273/4303617‑4303762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |