| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 374,639 | +GCCC | 100% | coding (389/1110 nt) | frmA ← | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 374639 | 0 (0.000) | 51 (0.910) +GCCC |
43/258 | NT | 100% | coding (389/1110 nt) | frmA | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
| ? | CP009273 | 374640 = | 0 (0.000) | coding (388/1110 nt) | frmA | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase | |||||
TGTACCGCGCCAATACCGGTGGTCACGCCACAGCCCAGCAGGCAGACGTGTTCATGGTTTGCTTCTGGATTAATTTTTGCCAGAGACACTTCCGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGC > CP009273/374492‑374786 | ccgcgccaataccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccgc < 1:469432‑M2/2‑1 (MQ=255) cgccaataccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccgcccg > 1:866699‑M2/146‑150 (MQ=255) ataccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGt > 2:965888‑M2/141‑149 (MQ=255) ccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCcgttgaaga < 1:342099‑M2/12‑5 (MQ=255) acgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGggt < 1:479518‑M2/22‑1 (MQ=255) acgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGggtg < 2:880208‑M2/22‑1 (MQ=255) cacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGc < 2:952949‑M2/26‑1 (MQ=255) agcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCg > 2:718842‑M2/122‑150 (MQ=255) cccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCt < 2:718781‑M2/31‑1 (MQ=255) cagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTg > 2:231057‑M2/118‑150 (MQ=255) aggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATc < 1:401458‑M2/37‑1 (MQ=255) ttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTAcc > 1:391837‑M2/103‑150 (MQ=255) atggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTAccc < 2:221591‑M2/50‑1 (MQ=255) tggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTgg < 1:405400‑M2/52‑1 (MQ=255) ttctggattaatttttgccagagtcacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgatatagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTcgc > 2:126656‑M2/91‑150 (MQ=255) ttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTcgc > 2:805110‑M2/91‑149 (MQ=255) ttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTcgc > 2:147378‑M2/91‑149 (MQ=255) gattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAAcc > 2:654997‑M2/86‑150 (MQ=255) aatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCaa > 2:701094‑M2/82‑150 (MQ=255) aatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCaa > 2:755617‑M2/82‑149 (MQ=255) aatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCaa > 2:415382‑M2/82‑149 (MQ=255) ttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACag < 2:102075‑M2/73‑1 (MQ=255) tgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACagag > 1:959947‑M2/76‑150 (MQ=255) gagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTa < 2:490826‑M2/80‑1 (MQ=255) agacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGt > 2:759229‑M2/70‑150 (MQ=255) gacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGt > 2:653803‑M2/69‑150 (MQ=255) gacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGt > 1:766987‑M2/69‑150 (MQ=255) cacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGtttt < 1:805110‑M2/84‑1 (MQ=255) acttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGtttt < 2:246956‑M2/85‑1 (MQ=255) acttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTg > 1:976522‑M2/66‑150 (MQ=255) ttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGc > 2:983699‑M2/64‑149 (MQ=255) ccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCa < 2:97764‑M2/88‑1 (MQ=255) cgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAg < 1:714435‑M2/89‑1 (MQ=255) gactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAAc < 1:890655‑M2/93‑1 (MQ=255) ggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAg > 1:576550‑M2/52‑149 (MQ=255) ggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGaa > 2:671983‑M2/52‑150 (MQ=255) ttcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTca > 1:101797‑M2/46‑149 (MQ=255) ttcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTcac < 2:208830‑M2/104‑1 (MQ=255) cactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCacac > 2:750085‑M2/44‑150 (MQ=255) cactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCacac > 2:129864‑M2/44‑150 (MQ=255) aatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcgc < 2:866699‑M2/110‑1 (MQ=255) tagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCAAACTCGCCGCAc < 1:965888‑M2/116‑1 (MQ=255) gagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTcc < 1:415814‑M2/118‑1 (MQ=255) gcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCcgc > 2:520462‑M2/31‑150 (MQ=255) caccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCcgc > 2:214183‑M2/30‑150 (MQ=255) accccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCcgcg > 1:676200‑M2/29‑150 (MQ=255) accccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCcgcg < 2:904957‑M2/122‑1 (MQ=255) ccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGgt < 1:643596‑M2/123‑1 (MQ=255) gtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCg > 1:122623‑M2/19‑150 (MQ=255) gtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCg > 2:812397‑M2/19‑150 (MQ=255) gataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGa > 1:813000‑M2/17‑150 (MQ=255) taaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATc < 1:415382‑M2/136‑1 (MQ=255) aagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATcac < 1:48583‑M2/138‑1 (MQ=255) aagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATcac < 2:976522‑M2/138‑1 (MQ=255) aagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATca > 1:930013‑M2/13‑149 (MQ=255) gcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATcaca < 2:743749‑M2/140‑1 (MQ=255) gcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATcaca < 2:101797‑M2/140‑1 (MQ=255) cggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATg > 1:259242‑M2/10‑150 (MQ=255) tgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTc > 1:583459‑M2/6‑150 (MQ=255) cccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGc > 1:113801‑M2/4‑150 (MQ=255) | TGTACCGCGCCAATACCGGTGGTCACGCCACAGCCCAGCAGGCAGACGTGTTCATGGTTTGCTTCTGGATTAATTTTTGCCAGAGACACTTCCGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGC > CP009273/374492‑374786 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |