Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | CP009273 | 982,570 | IS5 (–) +4 bp | 24.4% | intergenic (‑132/+468) | ompF ← / ← asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 683307 = | NA (NA) | 11 (0.170) | 11/276 | NT | 18.2% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | CP009273 | = 982573 | 48 (0.770) | intergenic (‑135/+468) | ompF/asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase | |||||
* | ? | CP009273 | = 684501 | NA (NA) | 20 (0.310) | 20/276 | NT | 28.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | CP009273 | 982570 = | 48 (0.770) | intergenic (‑132/+471) | ompF/asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTAC > CP009273/684360‑684650 | aaGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTaa > 1:696363/1‑150 (MQ=31) gAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACa > 1:137680/1‑150 (MQ=32) aaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACAtt > 1:390136/1‑150 (MQ=33) aTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTa < 2:114910/150‑1 (MQ=35) ttttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGtt < 1:723149/148‑1 (MQ=38) tttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTgg > 1:40401/1‑150 (MQ=40) ttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTg < 2:337486/149‑1 (MQ=255) ttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTg < 2:970754/148‑1 (MQ=39) ttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTg < 2:1014007/148‑1 (MQ=39) tGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTa > 2:1043189/1‑149 (MQ=255) gTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTaaa < 2:890079/150‑1 (MQ=255) gTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTaaa < 2:523453/149‑1 (MQ=255) tCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATg < 1:200819/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTaaa < 2:1039769/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAg < 2:1062452/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAg < 1:360922/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTa > 1:614562/1‑146 (MQ=255) gcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGata > 1:399224/1‑150 (MQ=255) cTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGatat < 1:594861/150‑1 (MQ=255) ttACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTg > 1:852806/1‑150 (MQ=255) ctgctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCt < 2:166403/149‑1 (MQ=255) ctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTg < 1:452503/148‑1 (MQ=255) ctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGt < 1:90406/148‑1 (MQ=255) gAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGata > 1:96665/1‑139 (MQ=255) gAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTa > 2:992612/1‑150 (MQ=255) aaTTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGatat < 2:96665/139‑1 (MQ=255) aaTTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAt < 2:616233/150‑1 (MQ=255) ttCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttg < 1:326189/150‑1 (MQ=255) aCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgttt > 1:630624/1‑150 (MQ=255) aCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgttt < 1:403339/150‑1 (MQ=255) aCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgttt > 1:20116/1‑150 (MQ=255) aCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgttt < 1:240171/150‑1 (MQ=255) aCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgttt < 1:471104/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgttt > 1:849945/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgtttg > 1:776966/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgtttg > 2:759794/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgtttgt > 2:541400/1‑150 (MQ=255) tCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttgtttgt < 1:235590/148‑1 (MQ=255) tCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATtgtttgtt < 2:188590/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGttttt < 1:861757/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc > 1:119446/1‑147 (MQ=255) tgatgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGcgccg > 1:258029/1‑150 (MQ=255) cTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCAt < 1:541400/150‑1 (MQ=255) tCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCAtt > 1:396305/1‑150 (MQ=255) tgatgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTcc < 2:605725/150‑1 (MQ=255) gatgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTcc > 2:319350/1‑149 (MQ=255) gatgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCg > 1:519549/1‑149 (MQ=255) cTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCtt < 2:630624/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAAt < 1:1043189/149‑1 (MQ=255) cTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATg > 2:47048/1‑149 (MQ=255) cTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGc < 2:40401/150‑1 (MQ=255) tCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCa > 1:530585/1‑150 (MQ=255) cAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCAct > 2:732798/1‑150 (MQ=255) aGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCActc < 1:47048/150‑1 (MQ=255) tGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCttt < 1:236069/150‑1 (MQ=255) aCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCttt > 1:350557/1‑148 (MQ=255) cAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAg < 2:20116/150‑1 (MQ=255) aaCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTg < 1:992612/150‑1 (MQ=255) aaCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTg < 2:696363/150‑1 (MQ=255) aTGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTa > 2:113961/1‑150 (MQ=255) aTGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTa < 1:769162/150‑1 (MQ=255) tGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTAc < 2:1011503/150‑1 (MQ=255) aTCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCg > 1:521286/1‑150 (MQ=255) ctcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCt > 2:1045904/1‑150 (MQ=255) gggACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtg < 1:759794/150‑1 (MQ=255) gACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtgtg < 1:83984/150‑1 (MQ=255) ttGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtggtg > 2:1056426/1‑150 (MQ=255) cGCACCTTCCTTAAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc > 2:78791/1‑150 (MQ=255) cGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc < 1:623539/149‑1 (MQ=255) aCCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAgg < 2:137680/150‑1 (MQ=255) cttcctt‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGtt < 2:519549/150‑1 (MQ=255) cttcctt‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGtt > 2:485728/1‑150 (MQ=255) cctt‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGt < 2:530585/149‑1 (MQ=255) ctt‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTAc < 2:756764/150‑1 (MQ=255) | AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT‑AGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTAC > CP009273/684360‑684650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |