| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1485085 | 55 (0.920) | 39 (1.050) +GTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC |
35/170 | NT | 69.7% | intergenic (‑115/‑74) | gapC/cybB | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment)/cytochrome b561 |
| ? | CP009273 | = 1857027 | 0 (0.000) | intergenic (‑341/‑1) | msrB/gapA | methionine sulfoxide reductase B/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A | |||||
GACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1484940‑1485085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACTCTTCCTT < CP009273/1857027‑1856880 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGA > 2:438825/1‑150 CCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATG > 1:937065/1‑150 AAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCT < 2:327642/150‑1 AACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTCTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGC > 2:413282/1‑150 ACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGC > 1:341775/1‑149 TTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACT < 1:293003/150‑1 TAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACT > 2:830806/1‑149 ATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:911044/1‑150 ATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:542579/149‑1 CAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:530583/1‑150 ACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 2:145662/150‑1 CTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 2:357042/1‑148 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1:1026048/150‑1 CTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:253611/1‑150 TCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:852753/1‑150 CCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 1:258186/1‑150 CTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 2:524355/148‑1 GTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 2:821370/1‑129 TCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:541437/150‑1 TCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:467142/149‑1 TCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:821370/129‑1 CGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:937065/150‑1 GATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCC < 1:529480/150‑1 ATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCT < 1:270076/150‑1 ATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCT < 1:83705/150‑1 ATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGC > 2:789433/1‑149 GATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTAT < 2:116746/149‑1 TCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTG > 1:31673/1‑150 TTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAG > 1:998422/1‑150 CTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAA < 1:911044/150‑1 CAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTG < 2:153823/150‑1 CAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTG > 1:289278/1‑150 CAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTG < 1:438825/150‑1 AGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGC > 2:714856/1‑150 GGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCC > 2:429810/1‑150 ATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTG < 2:1033850/150‑1 TGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGT < 1:401872/150‑1 GCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTA < 1:696674/149‑1 GATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATT < 2:750392/150‑1 ATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTA > 2:686129/1‑150 GGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAA < 2:258186/150‑1 TCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCT > 2:541304/1‑149 ATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACG < 1:791281/150‑1 TTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACG > 2:102419/1‑149 CAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTC < 1:10185/150‑1 AGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTC > 1:613256/1‑149 TGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAG < 2:31673/150‑1 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1:726820/149‑1 TGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCT > 1:193825/1‑148 ATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGC < 1:429810/150‑1 AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATT < 1:1008325/149‑1 GTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTAC > 1:59261/1‑150 GTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTA < 2:41762/149‑1 TGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACG < 1:102419/150‑1 TGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACG < 1:686129/150‑1 TATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGC < 2:852753/149‑1 ATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACT < 1:781901/149‑1 ATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACT < 1:357042/149‑1 GTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCG > 2:860208/1‑150 TTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCC > 2:583368/1‑150 TTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAATCCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATAGTGTCGATCATTGCGACAAATCAAGCCTGTGTCTAAGCATTACGCTACTGACTCGCC < 2:60730/149‑1 CATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACTCTTCCTT < 2:929061/149‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1484940‑1485085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACTCTTCCTT < CP009273/1857027‑1856880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |