| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 374,639 | +GCCC | 100% | coding (389/1110 nt) | frmA ← | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 374639 | 1 (0.020) | 43 (0.740) +GCCC |
40/258 | NT | 97.8% | coding (389/1110 nt) | frmA | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
| ? | CP009273 | 374640 = | 1 (0.020) | coding (388/1110 nt) | frmA | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase | |||||
GTGTACCGCGCCAATACCGGTGGTCACGCCACAGCCCAGCAGGCAGACGTGTTCATGGTTTGCTTCTGGATTAATTTTTGCCAGAGACACTTCCGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAG > CP009273/374491‑374789 | accgcgccaataccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccg > 1:662303‑M2/150‑150 (MQ=255) cctcgccaataccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccgc < 2:5179‑M2/2‑1 (MQ=255) aatactggaggtcacgccacagcccagcaggccgacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattccctgtatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGGTg > 2:924723‑M2/142‑149 (MQ=255) ataccggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTa < 2:653825‑M2/10‑1 (MQ=255) accggtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGt > 1:831947‑M2/139‑147 (MQ=255) gtggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGaaaaa < 2:770801‑M2/16‑1 (MQ=255) tggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAAc > 1:1035675‑M2/134‑150 (MQ=255) ccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGggtggt < 1:758038‑M2/25‑1 (MQ=255) 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gattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAAcc > 1:533347‑M2/86‑150 (MQ=255) taatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGc > 1:494718‑M2/83‑149 (MQ=255) gccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACaga < 2:662303‑M2/75‑1 (MQ=255) gagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTa < 2:102355‑M2/80‑1 (MQ=255) agacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAg > 1:540421‑M2/70‑150 (MQ=255) acacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGttt > 2:619083‑M2/68‑150 (MQ=255) ccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGc > 1:172327‑M2/62‑148 (MQ=255) acggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGa > 1:187484‑M2/54‑148 (MQ=255) cggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGAc < 1:436346‑M2/96‑1 (MQ=255) ggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAg > 2:46050‑M2/52‑149 (MQ=255) gtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGaa > 2:847280‑M2/51‑150 (MQ=255) tattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACt > 1:7397‑M2/48‑149 (MQ=255) attcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTca > 1:219783‑M2/47‑150 (MQ=255) actgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCacac < 2:831947‑M2/107‑1 (MQ=255) gaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcgc > 1:877478‑M2/40‑150 (MQ=255) gaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcgc > 2:367918‑M2/40‑150 (MQ=255) aatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcg < 2:274594‑M2/110‑1 (MQ=255) caccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCcgc > 1:115936‑M2/30‑150 (MQ=255) ccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGgtg > 1:454625‑M2/26‑150 (MQ=255) atgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTa < 2:265391‑M2/127‑1 (MQ=255) ataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGa < 2:532925‑M2/135‑1 (MQ=255) aaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGAt > 1:122873‑M2/14‑149 (MQ=255) ggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATg > 2:503589‑M2/9‑150 (MQ=255) ggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATg < 1:367918‑M2/142‑1 (MQ=255) gctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATgg > 1:855831‑M2/8‑150 (MQ=255) gctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATgg > 1:765788‑M2/8‑150 (MQ=255) ctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGt > 2:352693‑M2/7‑150 (MQ=255) cccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCg < 2:219783‑M2/146‑1 (MQ=255) ccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGcc < 2:839160‑M2/148‑1 (MQ=255) gCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAg > 2:577188/1‑150 (MQ=255) | GTGTACCGCGCCAATACCGGTGGTCACGCCACAGCCCAGCAGGCAGACGTGTTCATGGTTTGCTTCTGGATTAATTTTTGCCAGAGACACTTCCGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAG > CP009273/374491‑374789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |