| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | = 1115809 | NA (NA) | 96 (1.040) | 81/594 | 0.1 | 100% | intergenic (+13/+20) | Cgl1066/Cgl1067 | Transposase/Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |
| ? | BA000036 | 1413166 = | 0 (0.000) | intergenic (‑250/+399) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu | |||||
TAATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGACCGCGGATTTAAGAGCAGAGGCTGCCACGAGCGCATCTTCACGGCTGTGTGTTGTACTAAAAGTACAGCGCACAGCCGTTCGTGCTTGATCCTCCTCAAGCCCCAACGCCAGCAACACATGGGATACCTCTCCGGAACCACAGGCAGAACCAGGGGAGCACACAATGCCTTGGCGTTCCAATTCCAGAAGAACAGTTTCAGATCCTATGCTGTCGAAGAGAAAAGATGCGTGTCCATCAATGCGCATCCTAGGATGTCC > BA000036/1115511‑1116107 | taatacGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGccc > 1:355749/1‑300 (MQ=11)taataaGCGTGAAGCGAAGAAGGAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGGGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGGTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTTGTGTCTCGAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGccc < 2:280491/300‑1 (MQ=2) taaGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATGATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTa < 1:323006/300‑1 (MQ=14) cGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCAATATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGTCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAAcc < 1:119962/300‑1 (MQ=17) 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gAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTACAACAGGAGGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGACCGCGGATTTAAGAGCagc > 1:505517/1‑299 (MQ=255) gAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGACCGCGGATTTAAGAGCa > 1:505502/1‑298 (MQ=255) ccGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGTTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTACAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACACTCTGCTTAAGGCGACCGCGGGTTTACGAGCAGAGGCTGcc > 2:378124/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |