| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | = 1115809 | NA (NA) | 96 (1.040) | 81/594 | 0.1 | 100% | intergenic (+13/+20) | Cgl1066/Cgl1067 | Transposase/Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |
| ? | BA000036 | 1413166 = | 0 (0.000) | intergenic (‑250/+399) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AGGGCGGTAGAGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTT > BA000036/1412867‑1413465 | gaataagcgtgaagagaagaagcaaatgtggaccggtattgatcggcttcgggtgttgaaggggccgaataagtaactggcgctgttgggtcgtagtttgtaaaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagagatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccg < 2:257776‑M2/1‑1 (MQ=255) 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aaaacaggaagagccGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTCCCCCAGAATTTTCAGCCACAAGCGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACggg > 1:252880‑M2/16‑300 (MQ=255) aaacaggaagagccGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACg < 2:66458‑M2/283‑1 (MQ=255) aaacaggaagagccGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAAGTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCGCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCGAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACgggg < 1:494910‑M2/286‑1 (MQ=255) 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AGGGCGGTAGAGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTT > BA000036/1412867‑1413465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |