| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | 1114357 = | NA (NA) | 74 (0.790) | 62/594 | 0.8 | 97.4% | intergenic (+35/‑129) | Cgl1065/Cgl1066 | Permeases of the major facilitator superfamily/Transposase |
| ? | BA000036 | = 1413173 | 2 (0.020) | intergenic (‑257/+392) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu | |||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TAGAGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTTAATGCC > BA000036/1412874‑1413471 | agaCCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTggc > 2:162583‑M2/1‑297 (MQ=255) aCCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCGCAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGGACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTggccc > 1:515758‑M2/1‑295 (MQ=255) cgaagaagaaagtgcggagcagtattgatcagcttggggtgttgaaggtgccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccagaagatcaatgcactcgaaaacaggaagagccGGTTATCTCGCAGTg < 2:373193‑M2/15‑1 (MQ=255) gaagaagaaaatgcggaccattattgatcagcttcgggtgttgaaggggccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccGGTTATCTCGCAGTgg < 1:117316‑M2/16‑1 (MQ=255) 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TAGAGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTTAATGCC > BA000036/1412874‑1413471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |