| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | BA000036 | = 1828008 | 0 (0.000) | intergenic (‑1071/+1677) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein | |||||
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CTAGAACCTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTA > BA000036/1827709‑1828300 | cTAGAACCTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAACCAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTCCTGGCTTTTAACAGGCTATTAAAGAac > 2:347128/1‑300 (MQ=255) 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CTAGAACCTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTA > BA000036/1827709‑1828300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |