| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | 1114358 = | NA (NA) | 100 (1.090) | 84/592 | 0.1 | 100% | intergenic (+36/‑128) | Cgl1065/Cgl1066 | Permeases of the major facilitator superfamily/Transposase |
| ? | BA000036 | = 1693264 | 0 (0.000) | coding (655/660 nt) | Cgl1598 | Pentose‑5‑phosphate‑3‑epimerase | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GTGATGACGAAACACCCCAGGTTGGGAGCATTCTGGGCAGGTGGAGGTGTAGTCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BA000036/1114656‑1114358‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATCGCACACGTGTT < BA000036/1693264‑1692966 GTGATGACGAAACACCCCAGGTTGGGAGCATTCTGGGCAGGTGGAGGTGTAGTCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCC > 1:50577/1‑300 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TGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTC < 1:467496/299‑1 GTACCCCAAGACGGGAAGTGGCAGTAAATGGATGGGGCGCACGCGTTAGTGCTGGCCCACCACGGGCCAGAGCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCGAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTGGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAGGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGAC < 2:399285/300‑1 aacccgacagtCCAGTAACTTGTTGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGTTCAAGTCCGAGGCACCACCCGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATC < 2:411599/289‑1 AACCGGAAGGGCCAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATC > 1:31135/1‑300 AACCGGAAGGGCCAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCGGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATC < 1:128935/300‑1 CGGAAGGGCCAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTACCGACGCCGGGGTCGga > 1:293104/1‑298 GGCCATTAAATGGATGTGGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACTACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGGGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGTCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATCGCACACGTG < 1:272805/300‑1 CCAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTCGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCAGGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATCGCACACGTGTT > 1:115763/1‑300 CCAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATCGCACACGTGTT > 1:426490/1‑300 GTGATGACGAAACACCCCAGGTTGGGAGCATTCTGGGCAGGTGGAGGTGTAGTCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BA000036/1114656‑1114358‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGTAAATGGATGTTGCGCACGCGTTAGATCTGGCCCACCACGTGTCAGATCAAGTCCGAGGCACCACCAGCCCTAATCCGCCAGTCGGCGCTGTCATTTTGGACGCCGACGGCGAGGTCGTTGGCGTTGGCGCCACGGCACCTCCTGGTGGCCCGCACGCCGAAGTGGTGGCGCTTGCAGCTGCCGGAGTGCGTGCCAACGGGGGCACGGCGGTGGTCACCCTCGAGCCGTGCAACCATTACGGCCGCACGGGTCCATGTTCCAAGGCGCTTCTCGACGCCGGGATCGCACACGTGTT < BA000036/1693264‑1692966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |