New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BA000036 | = 1115809 | NA (NA) | 102 (1.110) | 92/594 | 0.0 | 98.1% | intergenic (+13/+20) | Cgl1066/Cgl1067 | Transposase/Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |
? | BA000036 | 1413166 = | 2 (0.020) | intergenic (‑250/+399) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TAATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGC‑ATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BA000036/1115511‑1115809 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGC > BA000036/1413166‑1413463 TAATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGC‑ATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCG > 1:532447/1‑300 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CCGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAACTGTGATGCAAATCATCATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTTCGC > 2:201700/1‑300 CCGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATCATAATACCCCCGTACCATGAAGATGTTACGGGGGGATTATTTCGC > 2:114290/1‑300 CCGGTTATCTCGAAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTGGCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTGTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATGTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGGAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGC < 2:219297/300‑1 TAATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGC‑ATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BA000036/1115511‑1115809 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGC > BA000036/1413166‑1413463 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |