| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | = 1115809 | NA (NA) | 102 (1.110) | 92/594 | 0.0 | 98.1% | intergenic (+13/+20) | Cgl1066/Cgl1067 | Transposase/Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |
| ? | BA000036 | 1413166 = | 2 (0.020) | intergenic (‑250/+399) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CGGTAGAGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTT > BA000036/1412871‑1413465 | cGGTAGAGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTa < 1:442198/300‑1 (MQ=255) agcgtgaagcgaagaagaaaatgcggaccattattgatcagcttcgggtgttgaaggggccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccGGTTAt > 1:413222‑M2/295‑300 (MQ=255) tgaagcgaagaagaaaatgcggaccattattgatcagcttcgggtgttgaaggggccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccGGTTATCTCg > 1:282696‑M2/291‑300 (MQ=255) gaagcgaagaagaaaatgcggaccattcttgatcagcttcgggtgttgaaggggccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccGGTTATCTCg > 1:419849‑M2/290‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |