| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | 1825711 = | 103 (1.120) | 77 (0.840) | 66/594 | 0.5 | 59.7% | intergenic (‑105/+37) | Cgl1731/Cgl1733 | Hypothetical protein/Putative transposase |
| ? | BA000036 | 1828006 = | 1 (0.010) | intergenic (‑1069/+1679) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein | |||||
TAAGAAACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BA000036/1826006‑1825711‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTAGAG > BA000036/1828006‑1828303 TAAGAAACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCACTTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGCGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTCGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCAACATCCGGGGGTCGGACCCAACA > 1:292958/1‑300TAAGAAACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCATGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACA > 1:292963/1‑300 GATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCGGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATGGTGCTGTCGCCGGTACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGT < 1:82537/300‑1 GATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGT < 1:450871/300‑1 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AGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGT > 1:225535/1‑300 GTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTCTTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTACAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGT > 1:244759/1‑299 CAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGCGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACA > 1:541382/1‑299 AATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCTTGTCCACCATCCGTGGGTCGGACCCATCACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATA > 1:466594/1‑300 ATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCCAGACCTTTGACAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATAT < 2:508604/300‑1 TGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATT < 1:309032/300‑1 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ATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAA > 1:444620/1‑299 ATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTTGCCTGCATTCCTGGTGTAGATCTCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGTCAATTAATGTGACTAAATA > 1:341183/1‑297 ATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATTCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATA > 1:164829/1‑297 TTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGA < 2:436143/300‑1 GTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCAGTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACA < 2:320581/300‑1 GACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATTTGACCAAATAAAGACACGTAACTAACTAc > 1:479507/1‑299 ACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTCAAAGGTACCTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGCCCTTTAAGTAACGATTATAAGGCCATTAATGTGACCACATAAAGACACGTAACTGACTAAT > 2:173075/1‑300 ACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGCCCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGCCCAAATAAAGACACGTAACTGACTAAT > 2:173061/1‑300 TCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCCACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGTTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCACTTAATGTGACCAAATAAAAACACGTAACTGACTAATCTTTAT > 1:466918/1‑300 CGCTGGTGTACCAGTTACAACACGTATCGCCGGCATTCCTAGTGGAGATATCTGGCTCCGGGCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCGGCTATCCTGAGAGCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCGTTATC < 2:240213/299‑1 GGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAAAACCCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTTACTCTTG‑AGTGAAAACTATTTAATTGACCTTTAAATAACGATTATAATGAAATTAATGTGACCAAATAAAGACCAGTAACTGACTAATCTTTATCTGAat > 1:10836/1‑298 GTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAG > 1:516231/1‑300 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CTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGA > 1:243415/1‑300 CTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCG < 1:445437/299‑1 AGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGAGTAAGTG < 1:488821/300‑1 CGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAAC < 1:475089/300‑1 CGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAAC > 2:352611/1‑300 GTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGCTCTGCTTCCTGCTCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGGCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTG < 2:307023/300‑1 GTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTT < 2:7617/300‑1 AGCGCGTTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGC < 2:292958/300‑1 AGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTTTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGC < 2:292963/300‑1 CGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATGGTCTTGTAATCGTCGCTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTA < 2:22335/300‑1 taCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATCGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAA > 2:3726/3‑299 AGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAAT < 2:225535/300‑1 CTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCG < 2:164829/295‑1 CAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTA > 2:542311/1‑300 CTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAATGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAA < 1:221390/300‑1 GGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGT > 2:327931/1‑300 GGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCA < 2:444620/300‑1 CGGACCCAACGCTCCACTATTGACTGTTAATCGTCACATAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGAAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAAACTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCAACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTT < 2:466594/300‑1 CCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTAGAG < 1:186195/300‑1 TAAGAAACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BA000036/1826006‑1825711‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTG‑AGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTAGAG > BA000036/1828006‑1828303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |