| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | 1825711 = | 103 (1.120) | 77 (0.840) | 66/594 | 0.5 | 59.7% | intergenic (‑105/+37) | Cgl1731/Cgl1733 | Hypothetical protein/Putative transposase |
| ? | BA000036 | 1828006 = | 1 (0.010) | intergenic (‑1069/+1679) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
TTATATATTTCTTCACGAGCAACATCAGCCTTGTTAATATCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACCGCGCTCCTCAAACACGACCGGAGCCAGATATCTACACCAGGAATGCCGGCGAACCGTGTTGTAACGGGTACACCAGCGGAAGACGTCCCGGCGACAGCACAATTGATTTTCAAAGGTCTTGGAATCCTGCAGGACTTCCCGCTTCATCGCGGCATTGAAAGACTCCGCCAAAGCGTTGTCAGCACTGGTGCCAATTGATCCCATCGACTGCCTGATCCCTAGTTTCTTACACG > BA000036/1825413‑1826010 | ctctaaaagtgacttttgttaatagtcatttaagtaacgattagtggtcgattcaattgtagtttttaaagcctcttaaagcacagttattgcgtagacacttaatcgacacataagtgctcttttaaagccttgtaatagtcagataaagattagtcagttacgtgtctttatttggtcacattaattgccttataatcgttacttaaaggtcaattaaatatgtgtcactcaagagtcaattagttaccttttagaggtcgattaagtgacgattaaaagacaataggggagtgttgg < 1:186195‑M1/2‑1 (MQ=255) acttttgttaatagtcatttaagtaacgattagtggtcgattcaattgtagtttttaaagcctcttaaagcacagttattgcgtagacacttaatcgacacataagtgctcttttaaagccttgtaatagtcagataaagattagtcagttacgtgtctttatttggtcacattaattgccttataatcgttacttaaaggtcaattaaatatgtgtcactcaagagtcaattagttaccttttagaggtcgattaagtgacgattaaaagacaataggggagtgttGGGTCCGAccccc > 2:327931‑M1/288‑300 (MQ=255) gAGCAACATCAGCCTTGTTAATATCGTCCCAGTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGAtg < 2:543303/300‑1 (MQ=255) cAACATCAGCCTGGTTAATATCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGAtggtg < 2:247276/300‑1 (MQ=255) aaCATCAGCCTTGTTAATATCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGACAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTCCGGCCCATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCCATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGGCCGACACCTGGAtggggg > 2:521349/1‑300 (MQ=255) aCATCAGCCTTGTTAATATCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGa < 1:424908/300‑1 (MQ=255) ccTTGTTAATATCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACggag < 2:470816/300‑1 (MQ=255) taacgattagtggtcgattcaattgtagtttttaaagcctcttaaagcacagttattgcgtagacacttaatcgacacataagtgctcttttaaagccttgtaatagtcagataaagattagtcagttacgtgtctttatttggtcacattaattgccttataatcgttacttaaaggtcaattaaatatgtgtcactcaagagtcaattagttaccttttagaggtcgattaagtgacgattaaaagacaataggggagtgttGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTg > 2:542311‑M1/265‑300 (MQ=255) atatCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGAt < 2:313328/300‑1 (MQ=255) tCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCAACTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCGTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCa < 2:225377/299‑1 (MQ=255) 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tcttcAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATACTCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAACTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATGAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCa < 2:425363/299‑1 (MQ=255) tttaaagcctcttaaagcacagttattgcgtagacacttaatcgacacataagtgctcttttaaagccttgtaatagtcagataaagattagtcagttacgtgtctttatttggtcacattaattgccttataatcgttacttaaaggtcaattaaatatgtgtcactcaagagtcgattagttaccttttagaggtcgattaagtgacgattaaaagacaataggggagtgttGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGcagta > 2:3726‑M1/235‑297 (MQ=255) taaagcctcttaaagcacagttattgcgtagacacttaatcgacacataagtgctcttttaaagccttgtaatagtcagataaagattagtcagttacgtgtctttatttggtcacattaattgccttataatcgttacttaaaggtcaattaaatatgtgtcactcaagagtcaattagttaccttttagaggtcgattaagcgacgattacaagaccataggggagtgttGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACcg < 2:22335‑M1/68‑1 (MQ=255) aGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACcg > 1:202829/1‑300 (MQ=255) gcctcttaaagcacagttattgcgtagacacttaatcgacacataagtgctcttttaaagccttgtaatagtcagataaagattagtcagttacgtgtctttatttggtcacattaattgccttataatcgttacttaaaggtcaattaaatatgtgtcactcaagagtcaattagttaccttttagaggtcgattaagtgacgattaaaagacaataggggagtgttGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGAACGCGct < 2:292958‑M1/72‑1 (MQ=255) aCCCTTCAGAAGCTTTTAAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTGGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCGATCCTATTCCGTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACCGCGctcc < 2:133666/298‑1 (MQ=255) 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ccTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGACGCAGATCTCAGGATAGCAGGACCGCGCTCCTCAAACACGACCGGAGCCAGATATATACACCAGGAATGCCGGCGAACCGTGTTGTAACGGGTACACCAGCGGAAGACGTCCCGGCGACAGCACAATTGATTTTCAAAGGTCTTGGAATCCTGCAGGACTTCCCGCTTCATCGCGGCATTGAAAGACTCCGCCAAAGCGTTGTCAGCACTGGTGCCAATTGATCCCATCGACTGCCTGATCCCTAg > 1:160364/1‑300 (MQ=255) tgttGGGTCCGACCCCCGGATGTTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACCGCGCTCCTCAAACACGACCGGAGCCAGATATCGACACCAGGAATGCCGGCGAACCGTGTTGTAACGGGTACACCAGCGGAAGACGTCCCGGCGACAGCACAATTGATTTTCAAAGGTCTTGGAATCCTGCAGGACTTCCCGCTTCATCGCGGCATTGAAAGACGCCGCCAAAGCGTTGTCAGCACTGGTGCCAAGTGATCCCATCGACTGCCTGATCCCTAGTTTCTTa > 1:292958‑M1/5‑300 (MQ=255) gggTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACCGCGCTCCTCAAACACGACCGGAGCCAGATATCTACACCAGGAATGCCGGCGAACCGTGTTGTAACGGGTACACCAGCGGAAGACGTCCCGGCGACAGCACAATTGATTTTCAAAGGTCTTGGAATCCTGCAGGACTTCCCGCTTCATCGCGGCATTGAAAGACTCCGCCAAAGCGTTGTCAGCACTGGTGCCAATTGATCCCATCGACTGCCTGATCCCTAGTTTCTTACACg > 1:432413/1‑300 (MQ=255) | TTATATATTTCTTCACGAGCAACATCAGCCTTGTTAATATCTTCCCATTCAAGAAAATGGTTCTTCAGCTTCCTACCCTTCAGAAGCTTTTCAATATAATCACGTCCATCTGAGCCATCTAATAAACCTACGCAGCATTCATAGCTTGAATGCTGCTCAGAAAGGAACAAGAGAATCAGTTTGTCGGAATACATGCCTCAATTCTCCTATCCTATTCCTTATTTAACTACGGCCTATCGTACAGGGAAGATAAGTCGCCTTATTGATATCGCAGCCCAATACGCGCCCCTGCTTCAGCGGGTCCGACCCCCGGATGGTGGACACGGAGGATTTGATCAGGAAGCAGATCTCAGGATAGCAGGACCGCGCTCCTCAAACACGACCGGAGCCAGATATCTACACCAGGAATGCCGGCGAACCGTGTTGTAACGGGTACACCAGCGGAAGACGTCCCGGCGACAGCACAATTGATTTTCAAAGGTCTTGGAATCCTGCAGGACTTCCCGCTTCATCGCGGCATTGAAAGACTCCGCCAAAGCGTTGTCAGCACTGGTGCCAATTGATCCCATCGACTGCCTGATCCCTAGTTTCTTACACG > BA000036/1825413‑1826010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |