| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | BA000036 | = 1413173 | 4 (0.040) | intergenic (‑257/+392) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu | |||||
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AGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTTA > BA000036/1412877‑1413466 | gaagcgaagaagaaaatgcggaccattcttgatcagcttcgggtgttgaaggggccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccGGTTATCTCg > 1:419849‑M2/290‑299 (MQ=255) tAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTggcccttcc > 1:200075‑M2/1‑291 (MQ=255) tAGCAAGGAAGAGTTCGGGCAACACCCACAACACCAGTCGTGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGGGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTggcccttcc > 1:200068‑M2/1‑291 (MQ=255) agaagaaaattcggaccattattgatcaggttcgggtggtgaaggggccgaataaggaactcgcgcagttgggtcgtagtttgtttaaacgacttggtgatgtgttggcgtatttcgatgttggtgtctccaacggtccggtcgaagcgatcaacggacggttggagcatttgcgtgggattgctctaggtttccgtaatttgaaccactacattctgcggtgccttatccattcagggcagttggtccataagatcaatgcactctaaaacaggaagagccGGTTATCTCGCAGTgg < 1:148726‑M2/16‑1 (MQ=255) 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ccGGTTATCTCGAAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTGGCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTGTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATGTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGGAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTgcgc < 2:219297‑M2/298‑1 (MQ=255) ggtTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGCATTGCCCCCATGTGGGCGGCAAGAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGATCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTACAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCtt < 2:5339/300‑1 (MQ=255) ggtTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCtt < 2:394026/300‑1 (MQ=255) | AGACCATAGCCAGTAAGATTCCGGTCAACACCCACAACACCAGTCGGGCAGTTTGAGTGACATCACCACCGGCCAGCAGATAGGCACCACCTGTACCTAGCGCAAGTAGTAAGAGAACAATCGCCTGCCAGGTAAGATATATGCCTCTGATACGGTGATTCTCGATGACAGTAATAAGCTAAGTGTCAAGCCCGTGTACTGCTTATATTGTACGGAACTGATTCCGTCCGTATAGCTCAGACACGTGAACGAGTTAGTAATTTTTTTATGCTTTTTTGTACTGCCGGGTGGTTATCTCGCAGTGGAATATAAATTCGATTGCGAGTTTTTTTCAGGCTCTCAGAATTGCCCCCATGTGGGCGGAAAAAAGGTGAATAAATTCCCTTTTTTACCCCAGAATTTTCAGCCACAAGAGGGGTGCGGATTGGGGTCAAGAATCATATTTCAGTCACAGCTGCGGGTGTAAAAAAATGGCTCATGTCCGGTGATGGAGCTACGAAACCGGGGTAGCGGTGGCGTTCTAAAATGTGATGCAAATCATAATAATACCCCCGTAACATGAAGATGTTACGGGGGTATTATTGCGCTTA > BA000036/1412877‑1413466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |