New junction evidence | |||||||||||
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? | NZ_CP034943 | = 3756494 | 335 (1.200) | coding (126/678 nt) | EO946_RS19340 | CidB/LrgB family autolysis modulator | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 398 total aligned reads displayed.
GAGAAAAAACATACGTGTTCATCGGAATTGTAAGTTTGTTTTTAACAGTTTTGGTGTATATAGGAGCAAAAAAGGTATATCAACGCTTTCCGCGTGTCTATACGTCGCCGCTATTGGTGACGCCCGCTGTGTTAGTCGGTCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTGG > NZ_CP034943/3756355‑3756633 | gagaAAAAACATACGTGTTCATCGGAATTGTAAGTTTGTTTTTAACAGTTTTGGTGTATATAGGAGCAAAAAAGGTATATCAACGCTTTCCGCGTGTCTATACGTCGCCGCTATTGGTGACGCCCGCTGTGTTAGTCGGt < 1:669072/140‑1 (MQ=255) cATACGTGTTCATCTGAATTGTAAGTTTGTTTTTAACAGTTTTGGTGTATATAGGCGCAAAAAAGGTATATCAACGCTTTCCGCGTTTCTATACGTCGCCGCTATTGGTGACGCCCGCTGTGTTAGTCGGTatgctgctg > 2:492517‑M2/1‑131 (MQ=255) tACGTGTTCATCGGAATTGTAAGTTTGTTTTTAACAGTTTTGGTGTATATAGGAGCAAAAAAGGTATATCAACGCTTTCCGCGTGTCTATACGTCGCCGCTATTGGTGACGCCCGCTGTGTTAGTCGGTctgctgctgct < 1:530178/140‑1 (MQ=255) gtTCATCGGAATTGTAAGTTTGTTTTTAACAGTTTTTGTGTATATAGGAGCAAAAAAGGTATATCAACGCTTTCCGCGTGTCTATACGTCGCCGCTATTGGTGACGCCCGCTGTGTTAGTCGGTCTGCTGCTGCTGGTGa < 2:2971051/140‑1 (MQ=255) 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aGTCGGTCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACg < 1:3373712/140‑1 (MQ=255) aGTCGGTCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACg < 2:220314/140‑1 (MQ=255) aGTCGGTCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACg < 1:4446641/140‑1 (MQ=255) tCGGTCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCa > 1:1355647/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACTAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTCACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTACCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTgt > 1:3808449/1‑139 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCt < 1:3599656/57‑1 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCt > 2:3599656/1‑57 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGACATACGCAGTgg > 2:1289298/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTgg > 1:3539740/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTgg > 1:2149079/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTgg > 1:3138109/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTgg > 1:2688970/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTgg > 1:105831/1‑140 (MQ=255) | GAGAAAAAACATACGTGTTCATCGGAATTGTAAGTTTGTTTTTAACAGTTTTGGTGTATATAGGAGCAAAAAAGGTATATCAACGCTTTCCGCGTGTCTATACGTCGCCGCTATTGGTGACGCCCGCTGTGTTAGTCGGTCTGCTGCTGCTGGTGAATGTCCCGTACGAGTCATATAATCTCGGCGGCGGATTGCTGACCGATATGCTTCAGCCGGCCACCGTGGCATTCGCGATCCCGCTTTATAAATATTTCCCTGTTTTAAAGAAATACGCAGTGG > NZ_CP034943/3756355‑3756633 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |