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GCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCAGGCCATGGCTCATAAAAATGCCCGGCAAACATATAAGGATCAACATAATACATGTGATAACGCCCTTTCTCATTGTAAA < 1:5168440/140‑1 CGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCAGGCCATGGCTCATAAAAATGCCCGGCAAACATATAAGGATCAACATAATACATGTGATAACGCCCTTTCTCATTGTAAACT > 1:3040375/1‑140 GCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCAGGCCATGGCTCATAAAAATGCCCGGCAAACATATAAGGATCAACATAATACATGTGATAACGCCCTTTCTCATTGTAAACTG < 1:346041/140‑1 CCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCAGGCCATGGCTCATAAAAATGCCCGGCAAACATATAAGGATCAACATACTCCATGTGATAACGCCCTTTCTCATTGTAAACTGT > 1:6913338/1‑140 GCGCACCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP034943/767592‑767759‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgccgccgaagccaggcacagcgccgcCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCAGGCCATGGCTCATAAAAATGCCCGGCAAACATATAAGGATCAACATAATACATGTGATAACGCCCTTTCTCATTGTAAACTGT > NZ_CP034943/767856‑767994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |