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Only 100 of 567 total aligned reads displayed.
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< 2:7501520‑M1/140‑117 (MQ=255) ccgccgCCATGCACAGCGCCGCCTCCCACGCCCTTGCCCCCGCCGCCCGCGAACCGCGGCAGCGCTCCGGCCCCACTGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTa < 2:1951917/135‑1 (MQ=12) ccgTAGCCAGGCACAGCGCCGCGACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACCGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAAGGCCAGACCATGGGTa < 1:6611496/140‑1 (MQ=255) gAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAAGCCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCACGCACACCGCCGCCGCCAATGCCAGACCAGGGGTAAc < 1:4497180/140‑1 (MQ=17) aGGCACAGCGCCGCcgccactgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataatacatgtgataacgccctttct < 1:6324369‑M1/140‑127 (MQ=255) gCACAGCGCCGCcgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataatacatgtgataacgccctttctca > 1:3504552‑M1/1‑12 (MQ=255) 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1:2253712/140‑1 (MQ=21) caGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATaa < 1:1796600/140‑1 (MQ=255) gcgcCGCcgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataatacatgtgataacgccctttctcattgta < 1:3044110‑M1/140‑134 (MQ=255) cgccgccgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggat > 1:1634132‑M1/1‑6 (MQ=255) cgccgccgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggat < 2:1634132‑M1/102‑97 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGcc > 1:641780/1‑40 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGcc < 2:641780/40‑1 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGAGACCGa > 2:367509/1‑140 (MQ=255) ccgccgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaacagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataatacatgtgataacgccctttctcattgtaaac < 1:498077‑M1/140‑137 (MQ=255) cgccgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatagaaggatcaacataatacatgtgataacggcctttctcattgtaaact > 2:6175197‑M1/1‑3 (MQ=255) gccgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataatacatgtgataacgccctttctcattgtaaactg < 1:7418673‑M1/140‑139 (MQ=255) gccgccaaggccagcccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataagacatgtgataacgccctttctcattgtaaactg < 1:4746770‑M1/140‑139 (MQ=255) ccgccaatgccagaccatgggtaaccatctggataacgatattcgtattcaaaagcaggccatggctcataaaaatgcccggcaaacatataaggatcaacataatacatgtgataacgccctttctcattgtaaactgt > 1:6158706‑M1/1‑1 (MQ=255) cTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTc > 2:1492734/1‑140 (MQ=255) cTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCAGCCAATGACAGACAATGGGTAACCAACTGGATAACGATATTc > 1:1300635/1‑140 (MQ=255) | CCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTC > NZ_CP034943/767621‑767898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |