| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 917510 = | 509 (1.620) | 1216 (3.900) +G |
4/250 | NT | 73.0% | intergenic (+294/‑1) | EO946_RS04665/EO946_RS04670 | nucleotidyltransferase‑like protein/16S ribosomal RNA |
| ? | NZ_CP034943 | 2982587 = | 398 (1.270) | intergenic (‑68/‑606) | EO946_RS15435/thiT | 16S ribosomal RNA/energy‑coupled thiamine transporter ThiT | |||||
Only 100 of 1838 total aligned reads displayed.
TAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTGTAA > NZ_CP034943/917371‑917648 | aGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCg > 1:1006392/1‑140 (MQ=40) aCAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGga < 1:1829631/140‑1 (MQ=40) aTTCATTTTTATAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTc > 1:1749114/1‑140 (MQ=40) gCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTggcggc < 1:201530/140‑1 (MQ=37) gCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTggcggc < 1:5224160/140‑1 (MQ=37) gCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTggcggc < 1:2177455/140‑1 (MQ=37) cacaGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGgcggcg > 2:177643/1‑140 (MQ=37) cacaGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGgcggcg > 2:4042999/1‑140 (MQ=37) cacaGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGgcggcg > 1:4150874/1‑140 (MQ=37) tgatctttgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTaa < 1:1318502‑M1/52‑1 (MQ=255) aTGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTaa > 1:3364579/1‑140 (MQ=37) atctttgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGACCGCTGGCGGCGTGCCTAATa < 2:2495526‑M1/54‑1 (MQ=255) atctttgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATa > 2:3504609‑M1/87‑140 (MQ=255) tctttgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATAc < 2:4389657‑M1/55‑1 (MQ=255) ctttgaaaactaaacaagacaaaacgtagctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACa < 2:4882806‑M1/56‑1 (MQ=255) tttgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACAt < 2:4461175‑M1/57‑1 (MQ=255) ttgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATg > 1:615286‑M1/83‑140 (MQ=255) tgaaaactaaacaagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGTACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGc < 2:2300580‑M1/59‑1 (MQ=255) agtcagtcAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTTATCCTGGCTCAGGACGAACCCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCa > 1:3922415/1‑140 (MQ=255) agtcagtcAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCa > 2:567092/1‑140 (MQ=37) tcagtcaAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAg > 2:3273780/1‑140 (MQ=37) gtcaAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCgg < 1:2083192/83‑1 (MQ=255) gtcaAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCg > 2:3346758/1‑140 (MQ=37) gtcaAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCg > 1:1601534/1‑140 (MQ=37) aaacaagacaaaacgtacctcttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAg > 2:4316390‑M1/74‑140 (MQ=255) aagacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGa > 2:1664231‑M1/70‑140 (MQ=255) gacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaatctagGTTGTCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCGGACTACGTGCCAGTCGAGCGGACa < 2:5192317‑M1/73‑1 (MQ=255) gacaaaacgtacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACa < 2:1139417‑M1/73‑1 (MQ=255) aGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAg > 2:1945153/1‑140 (MQ=37) aGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAg > 2:3959446/1‑140 (MQ=37) acacggacctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATg > 2:2776716‑M1/64‑140 (MQ=255) acctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGa > 2:3586872‑M1/58‑128 (MQ=255) acctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCt < 2:2580885‑M1/83‑1 (MQ=255) acctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCt < 2:2711345‑M1/83‑1 (MQ=255) cctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCtt > 1:3507649‑M1/57‑140 (MQ=255) cctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCtt > 2:4556200‑M1/57‑140 (MQ=255) cctgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCtt > 2:2012157‑M1/57‑140 (MQ=255) tgttaattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGa < 1:3075729‑M1/71‑1 (MQ=255) taattcatttttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGTACAGATGGGAGCTTGCTcc > 2:2101318‑M1/52‑140 (MQ=255) aGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGa > 2:660799/1‑122 (MQ=32) gTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCt > 2:2866624/1‑140 (MQ=32) acaGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGGGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGt > 2:3877538/1‑140 (MQ=17) acaGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGt > 2:1250339/1‑140 (MQ=32) acaGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGt > 2:4215088/1‑140 (MQ=32) ttataaaatcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAg > 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ccgcAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATGTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACCTGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGa < 2:4976083/140‑1 (MQ=17) atcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGa > 1:3297729‑M1/35‑140 (MQ=255) atcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGa > 2:1031662‑M1/35‑140 (MQ=255) atcgcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGa > 1:4682139‑M1/35‑140 (MQ=255) gcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACgg > 1:3755397‑M1/32‑140 (MQ=255) gcacagcgatgtgcgtagtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACgg > 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agtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTggg < 2:1870956‑M1/125‑1 (MQ=255) agtcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTggg < 1:3449014‑M1/125‑1 (MQ=255) tcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTg > 2:307311‑M1/14‑105 (MQ=255) tcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTa < 1:2267770‑M1/127‑1 (MQ=255) tcagtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTa < 1:4385958‑M1/127‑1 (MQ=255) agtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAc > 1:735072‑M1/12‑140 (MQ=255) gtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcc < 1:111602‑M1/130‑1 (MQ=255) gtcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcc < 2:2964943‑M1/130‑1 (MQ=255) tcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 1:3189117‑M1/10‑140 (MQ=255) tcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct < 2:4750651‑M1/131‑1 (MQ=255) tcaaactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 2:3408266‑M1/10‑140 (MQ=255) gtgATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 1:2640325/1‑140 (MQ=32) gtgATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 1:2409990/1‑140 (MQ=32) gtgATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 2:5087123/1‑140 (MQ=32) gtgATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 1:235011/1‑140 (MQ=32) gtgATCAATTTTATCGGATAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGTCGGCTTGCATAATACATGCAAGTCGATCGGACAGATGGGAGATTGCTCCCTGATGTTAGCTGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcct > 1:514920/1‑140 (MQ=11) aactacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTcc < 1:4956373‑M1/89‑1 (MQ=255) aTCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGa < 1:298777/112‑1 (MQ=32) ctacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcctgcctg > 2:1442590‑M1/5‑140 (MQ=255) ctacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAAcctgcctg > 2:3781880‑M1/5‑140 (MQ=255) tacTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGa > 1:1513767‑M1/4‑74 (MQ=255) cATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTACCCTGCCTGt > 2:4636853/1‑140 (MQ=17) | TAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAAGACCTGCACGACGTAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAACTTAACCTGTGATCCATTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTGTAA > NZ_CP034943/917371‑917648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |