| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607515 = | 179 (0.950) | 10 (0.050) +GGT |
3/264 | 10.1 | 6.0% | coding (358/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607637 | 142 (0.760) | coding (480/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607648‑607515‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTC < NZ_CP034943/607637‑607500 ||| GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCGGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCGGGTGCGGCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCGCGCCCGTCGCTCCGGCTGG > 1:540643/1‑140 CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCcgg > 1:2193365/1‑137 CTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTGGCTCCCGTGGCTGCCGCTGGGCCGGCTGCGCCGGTGGCT > 2:63554/1‑140 CCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCGGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCGCCTCTCGCTCCGGGCGCTCCGGATGGTCCTGCTGCGCCGGGAGCGCCggg > 2:2102196/1‑137 cccgGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGCTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGCTCCGGCTTCCCCACTAGCCCCTGTGGCTCCCTTGGCACGGGTTGGTCAGGCTTCCCCGTTAGCTCCTGTCGCTCCCG < 1:1355307/136‑1 cccgGTCGCTCCCGGCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTCTCTCCTCTCGCTCCCGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCG < 1:27188/136‑1 CTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACTTCCCCAGT > 2:1704781/1‑70 CCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCG > 2:580778/1‑85 CTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCCCCGGATGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCA < 1:1128561/140‑1 CCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACTTCCCCAGT > 1:619501/1‑59 GGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCG > 1:1522618/1‑46 GGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCG < 2:1522618/46‑1 GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCCGCTGGTCCAGCTTC < 2:1557560/140‑1 GTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTC > 1:1557560/1‑140 ||| GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607648‑607515‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTC < NZ_CP034943/607637‑607500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |