BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NZ_CP034943	2071641 =	101 (0.620)	31 (0.190)	5/264	8.1	23.9%	coding (2652/7377 nt)	EO946_RS10385	NTTRR‑F1 domain
*	?	NZ_CP034943	= 2072009	NA (NA)	31 (0.190)	5/264	8.1	23.9%	coding (2284/7377 nt)	EO946_RS10385	NTTRR‑F1 domain
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

Only 100 of 101 total aligned reads displayed.

TTACTCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGT  >  NZ_CP034943/2071520‑2071772

ttactcccgttactcccgTTGCGCCAGTTTCCCCGGGTGCACCAGTTGCTCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTcctgttgatcctgttgatcctgttgat                                                                                                                   <  2:828617/140‑1 (MQ=17)

 tactcccgttactcccgtTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCctgttgatcctgttgatcctgttgatc                                                                                                                  >  1:1089503/1‑140 (MQ=33)

 tactcccgttactcccgtTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCctgttgatcctgttgatcctgttgatc                                                                                                                  >  1:1497543/1‑140 (MQ=33)

 tactcccgttactcccgtTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCctgttgatcctgttgatcctgttgatc                                                                                                                  >  1:1811472/1‑140 (MQ=33)

    tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGttgatcctgttgatcctgttgatcctg                                                                                                               >  1:2008178/1‑140 (MQ=35)

     cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTtgatcctgttgatcctgttgatcctgt                                                                                                              >  1:593851/1‑140 (MQ=37)

       cgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGttt                                                                                                            >  1:884894/1‑140 (MQ=38)

        gttgatcccgttACGCCAGTTGCTCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCGCCAGTTGGTCCTGTAGATCCTGTTTCACCGGTTGCACCAGTTAATCCAGTGGCTCCAGTTgatcctgttgctcctgttgatcctgttgc                                                                                                           >  2:801677/6‑138 (MQ=11)

         ttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTtct                                                                                                          >  1:1844584/1‑140 (MQ=40)

           actcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTcc                                                                                                        >  1:948214/1‑140 (MQ=255)

           actcccggtGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTcc                                                                                                        <  2:1862158/140‑1 (MQ=255)

            ctcccgttGCTCCTGTTTCCCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGATCCTGTTTGTCCTGTTGCTCCTGTTTCCCCCGTTGCTCCAGTTTCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTccc                                                                                                       <  1:1242176/140‑1 (MQ=14)

            ctccccgtGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCGGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTccc                                                                                                       <  1:904849/140‑1 (MQ=255)

                  ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt                                                                                                 >  1:1934863/1‑140 (MQ=255)

                     cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa                                                                                              <  2:78408/140‑1 (MQ=255)

                         aGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTgg                                                                                          >  2:2442125/1‑140 (MQ=255)

                         aGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTgg                                                                                          >  2:2045436/1‑140 (MQ=255)

                           tttCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCt                                                                                        <  2:1844584/140‑1 (MQ=255)

                           tttCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCt                                                                                        <  2:1569056/140‑1 (MQ=255)

                           tttCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGGTGGTCCTGTAGCTCCTGGTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCt                                                                                        <  1:2047943/140‑1 (MQ=255)

                              ccccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTGCTGTAGATCCTGTGTCACCGTGTGCACCAGTTACTCCATTTGGTACTGTTGATCCTGGTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCGGTGGGTCCGGTGGCTCCg                                                                                     >  2:555789/1‑140 (MQ=14)

                                ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTTCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTAGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  2:2193131/140‑1 (MQ=255)

                                ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  1:1063266/140‑1 (MQ=255)

                                ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  2:370090/140‑1 (MQ=255)

                                ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  1:277670/140‑1 (MQ=255)

                                ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGGGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGGTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  1:763367/140‑1 (MQ=255)

                                   gTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGa                                                                                <  1:1409698/140‑1 (MQ=255)

                                            gTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGa                                                                       <  2:1934863/140‑1 (MQ=255)

                                            gTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGa                                                                       >  1:1866936/1‑140 (MQ=255)

                                             ttGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      <  1:801677/140‑1 (MQ=255)

                                             ttGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      <  1:1536369/140‑1 (MQ=255)

                                                  cccGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa                                                                 <  1:2045436/140‑1 (MQ=40)

                                                  cccGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa                                                                 <  1:2442125/140‑1 (MQ=40)

                                                    cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   >  2:1124429/1‑120 (MQ=255)

                                                    cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  1:1124429/120‑1 (MQ=255)

                                                    cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   <  1:238433/120‑1 (MQ=255)

                                                    cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt                                                                                   >  2:238433/1‑120 (MQ=255)

                                                    cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATg                                                               <  2:2008178/140‑1 (MQ=40)

                                                    cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCCGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTCCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATg                                                               <  1:1423179/140‑1 (MQ=255)

                                                      ttGCTGCTGTTGGTCCTGTAGCTCCGGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGGGGGTCCTGTTGTTCCTGTTGATCCTTTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGTTCCTGTTGATCCCGATGGa                                                             <  1:1269288/140‑1 (MQ=11)

                                                      ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa                                                             >  1:598574/1‑140 (MQ=39)

                                                        gCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGGTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGAcc                                                           <  1:1713333/140‑1 (MQ=37)

                                                          tCCCGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCCGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTg                                                         <  1:945726/140‑1 (MQ=25)

                                                           ccTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGa                                                                                >  1:2230256/1‑116 (MQ=35)

                                                           ccTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGa                                                                                <  2:2230256/116‑1 (MQ=35)

                                                              gTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTAGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGa                                                     >  2:2333425/1‑140 (MQ=21)

                                                               ttGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATc                                                                              <  2:137920/114‑1 (MQ=35)

                                                               ttGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATc                                                                              >  1:137920/1‑114 (MQ=35)

                                                                   tCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTg                                                >  1:950775/1‑140 (MQ=34)

                                                                      tGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGttt                                             >  1:1204382/1‑140 (MQ=34)

                                                                      tGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGttt                                             >  1:849926/1‑140 (MQ=34)

                                                                       gTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATACTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTtc                                            >  1:1653726/1‑140 (MQ=21)

                                                                        tAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGGTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGGTTCTGCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTtct                                           >  1:1089412/1‑140 (MQ=255)

                                                                            tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg                                       <  1:669792/140‑1 (MQ=34)

                                                                            tCCTGTGTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg                                       <  1:1304591/140‑1 (MQ=21)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      <  2:676908/108‑1 (MQ=35)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      >  2:194518/1‑108 (MQ=35)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      <  1:194518/108‑1 (MQ=35)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      >  1:676908/1‑108 (MQ=35)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt                                      >  2:2515754/1‑140 (MQ=34)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt                                      >  1:2291006/1‑140 (MQ=34)

                                                                             ccTGTTTCCCCGGGTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGGTGTTCCCGATGGACCTGTTGCTCCTGTTTCTCCCGt                                      >  2:1288736/1‑140 (MQ=255)

                                                                                gttcgcccGG‑TGCACCAGTGACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt                                  <  1:791265/135‑1 (MQ=11)

                                                                                gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      >  1:133166/1‑105 (MQ=32)

                                                                                gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt                                                                      <  2:133166/105‑1 (MQ=32)

                                                                                gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGc                                   >  2:1344351/1‑140 (MQ=32)

                                                                                 tttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt                                  <  1:391582/140‑1 (MQ=17)

                                                                                 tgtCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt                                  <  1:598841/138‑1 (MQ=17)

                                                                                  ttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt                                  <  2:461131/139‑1 (MQ=32)

                                                                                  ttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt                                  >  1:461131/1‑139 (MQ=32)

                                                                                    ccccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCa                               <  2:1497543/140‑1 (MQ=32)

                                                                                    ccccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCa                               <  2:1089503/140‑1 (MQ=32)

                                                                                    ccccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCa                               <  2:1811472/140‑1 (MQ=32)

                                                                                      ccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGt                             <  2:1653726/140‑1 (MQ=32)

                                                                                         gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTAc                          >  2:1819433/1‑140 (MQ=32)

                                                                                         gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTAc                          <  2:195378/140‑1 (MQ=32)

                                                                                           tGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTc                        >  2:1322464/1‑140 (MQ=32)

                                                                                             cACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCa                      >  1:491761/1‑140 (MQ=32)

                                                                                              aCCAGGTACGCCAGTGGCTCCTGTTGAGCCGGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCAGGCGCTCCAGTGGCTCCGGGTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAg                     <  2:2430710/140‑1 (MQ=11)

                                                                                                  gTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGc                 >  2:789116/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                  gTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGc                 >  1:1864088/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                   ttACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCt                >  2:2139033/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                       tCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCgg            >  1:1535337/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                       tCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGGTGCTCCAGTTACTCCAGGTGCTCCgg            >  1:1791291/1‑140 (MQ=21)

                                                                                                        ccAGTGGCTCCTGTTGATGCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTGGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGt           <  2:739726/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                        ccAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGt           <  2:339612/140‑1 (MQ=34)

                                                                                                           gTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGa        >  1:1757404/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTTGCTCCGGTTGATCATGTTGATCACGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGATGGTCCAGTTAATCCAGATGCTCCGGTTGAt       >  1:993216/1‑140 (MQ=11)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGt                                                        >  1:1901896/1‑91 (MQ=33)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGt                                                        <  2:1901896/91‑1 (MQ=33)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       >  1:983722/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       >  1:983964/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       >  1:2350500/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       <  1:2224229/140‑1 (MQ=34)

                                                                                                            tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGGTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       >  1:1642208/1‑140 (MQ=21)

                                                                                                            tGGCTCCTGGTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       <  1:420647/140‑1 (MQ=21)

                                                                                                            gggCTCCTGTTGATCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt       <  2:17757/139‑1 (MQ=21)

                                                                                                             ggCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATc      <  2:593851/140‑1 (MQ=34)

                                                                                                                 cctgttgatcctgttgatcctgttgatCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGt  >  1:720686/1‑140 (MQ=34)

                                                                                                                 cctgttgatcctgttgatcctgttgatCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGt  >  1:1384092/1‑140 (MQ=34)

TTACTCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGT  >  NZ_CP034943/2071520‑2071772

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 11 ≤` `ATCG/ATCG` `< 25 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.