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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
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ACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAA > 1:4058143/1‑151 ACAGCGGCCGCGGGTCCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAGCCATGGCAACCTCATCCCGCGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAA < 2:6794418/151‑1 AGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGGACACCCTGCTGCGCGGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCCCGCCCACCCTGGTGTTCAAC > 2:726139/1‑151 CGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGCGATCAACCTG > 1:3205466/1‑151 GCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGAT < 2:146670/151‑1 CGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACGCTGCTGCGCACCAAGTGGCTGTCTATCGACTCCATCGCCGCCACCCTGCTGCTCAACCTGATCc > 2:4295233/1‑150 CGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCCGCCTGGTGATCAACCTGATCc > 2:7108960/1‑150 CGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCG > 1:4557256/1‑151 CGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCG < 1:4392611/151‑1 CGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGATGATCAACCTGATCG > 2:6514430/1‑151 GTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCT > 1:7109152/1‑151 TGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTT > 2:1914466/1‑151 GTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTG > 2:6089168/1‑151 GTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTG < 2:4622913/151‑1 TTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGG < 2:3876622/151‑1 TCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGC < 1:2583563/151‑1 TCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCACCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGC > 2:5944674/1‑151 CTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCC < 1:500643/151‑1 CTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCC > 2:3200696/1‑151 CGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGCG > 2:969751/1‑151 CCGGCCATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1901350‑1901506 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGC‑GACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGCG > CP009974/1904110‑1904258 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |