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Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
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aaGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctg < 2:4562278‑M1/151‑123 (MQ=255) gCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggt > 1:5069065‑M1/1‑27 (MQ=255) gACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtga > 1:827378‑M1/1‑25 (MQ=255) gACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcataccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtga > 2:181221‑M1/1‑25 (MQ=255) cTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatc < 2:2317733‑M1/151‑129 (MQ=255) tACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatca < 1:4334442‑M1/151‑130 (MQ=255) aCAGCGGCCGCGGGTCCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcagccatggcaacctcatcccgcgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaa < 2:6794418‑M1/151‑131 (MQ=255) cGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctg < 1:3838621‑M1/151‑135 (MQ=255) cGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctg > 1:4511592‑M1/1‑17 (MQ=255) cGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggcgatcaacctg > 1:3205466‑M1/1‑17 (MQ=255) ggCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctga < 1:5958896‑M1/151‑136 (MQ=255) ccGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatc < 2:1670828‑M1/151‑138 (MQ=255) cgcgTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcg < 2:1139678‑M1/151‑139 (MQ=255) cgcgTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctgatgatcaacctgatcg > 2:6514430‑M1/1‑13 (MQ=255) gcgTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgc < 1:4086420‑M1/151‑140 (MQ=255) 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cttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggcc > 2:3200696‑M1/1‑5 (MQ=255) cgcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccgcg > 2:969751‑M1/1‑2 (MQ=255) | TGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGTGCGGATTCCACGCTGACTCGGACACCCATTCCACGCGCATCCGGACAGTGATTCCACGCTGATCCGGACACTCATTCCACGAGCATCCGGACACCGACTCCACGGTCATCCGGACACTTTTCTGGCAGGCAGCCACGCAGGATTTATT > CP009974/1901357‑1901655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |