| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1898984 = | 169 (0.460) | 1234 (3.580) +CGACTCGG |
275/284 | -0.0 | 84.4% | intergenic (‑6762/‑1835) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1899275 | 313 (0.860) | intergenic (‑7053/‑1544) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 2681 total aligned reads displayed.
CGATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898838‑1899134 | caacggtgatggtctggccgttggacagagtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAt < 1:5829588‑M1/5‑1 (MQ=255) ggtgatggtcgggccgttggaccgggtaaccgtgaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTg > 2:4207783‑M1/143‑151 (MQ=255) tgatggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGt > 1:633202‑M1/141‑151 (MQ=255) natggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTc < 1:2043867‑M1/12‑1 (MQ=255) ggtctggccgttggacagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgcccagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGa < 1:3485022‑M1/15‑1 (MQ=255) ctggccgttggacagagtaaccggtaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑Gcc > 1:4858449‑M1/134‑151 (MQ=255) tggccgttggacagagtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCg < 2:7045785‑M1/19‑1 (MQ=255) ggccgttgggcggggtgacggttagcggcgtcggagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcgcgccgccttcggtgaccgacgggctggccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCgg > 1:5715396‑M1/132‑151 (MQ=255) gttggacagggtcacggttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTc > 2:1701911‑M1/128‑151 (MQ=255) acagggtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGtt < 1:3586180‑M1/29‑1 (MQ=255) gtaaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgacggtcgggggggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCgggg > 2:5920859‑M1/118‑151 (MQ=255) taaccgttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGtt < 1:1572778‑M1/29‑1 (MQ=255) ggttaccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGt < 1:288828‑M1/39‑1 (MQ=255) gttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCg > 1:4168828‑M1/112‑133 (MQ=255) gttaccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGtt > 2:5141722‑M1/112‑151 (MQ=255) taccggcgtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgt > 1:5415328‑M1/110‑110 (MQ=255) taccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTcggggtccgctgc < 2:234031‑M1/42‑7 (MQ=255) taccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGc < 1:73021‑M1/42‑1 (MQ=255) accggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCt < 1:3675477‑M1/43‑1 (MQ=255) ccggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTc < 1:2172752‑M1/44‑1 (MQ=255) cggcgtctgagcagggttgctcagtgtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGCCAGTTGCTCg > 1:6412327‑M1/107‑151 (MQ=255) cggcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGc < 1:1835209‑M1/21‑1 (MQ=255) gcgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGaa > 1:996677‑M1/105‑151 (MQ=255) cgtctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGaaa < 2:2264195‑M1/48‑1 (MQ=255) agcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCg < 1:894189‑M1/54‑1 (MQ=255) agggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcgggggcggcggcgaccgagtcgTTGCTCGAGGCACCT‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCa < 1:4360445‑M1/57‑1 (MQ=255) ggttgctcagggtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGGCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGt < 1:6548481‑M1/59‑1 (MQ=255) ttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGccagcgg < 1:4722484‑M1/61‑4 (MQ=255) tgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCa > 1:2392121‑M1/90‑126 (MQ=255) tgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCgccagcggc < 1:7050996‑M1/62‑5 (MQ=255) tgctcagggtcacggtgtaagtgggcacgcggccgtcggttacgcttggcggggtggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGc > 2:2888572‑M1/90‑151 (MQ=255) gctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCg > 2:1898621‑M1/89‑151 (MQ=255) tcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGAt > 2:1588915‑M1/81‑151 (MQ=255) tcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAt < 1:1430627‑M1/71‑1 (MQ=255) tCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGAt < 1:5273399/151‑1 (MQ=11) cggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCt > 2:4080598‑M1/78‑90 (MQ=255) tgtaggtgatcacgccgccttcggtgacggtcggggtggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGAc > 2:3006796‑M1/75‑151 (MQ=255) aggtgatcacgccgccttcggttaccgtcggcctggccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCt > 2:4726824‑M1/72‑151 (MQ=255) aagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCt < 1:300004‑M1/80‑1 (MQ=255) ggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTg > 1:4074557‑M1/71‑151 (MQ=255) gtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGt < 2:4465522‑M1/35‑1 (MQ=255) tgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGAc > 1:1002344‑M1/69‑151 (MQ=255) gcggTGGCGGGTCTACGGTCACATTGCGCTTGCTGGCTAGGCTTGCTGTGACGGCATCGATGGTGTCATTGATGTCCGCCGGG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGCCGGTTGCTGGGGGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGag < 2:4623273/149‑2 (MQ=255) atcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACgg < 2:4901880‑M1/85‑1 (MQ=255) tcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTtc > 2:5386741‑M1/66‑131 (MQ=255) cacgccgccttcggtgactgtcgggctggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTc > 2:3821804‑M1/65‑151 (MQ=255) acgccgcctgcggtgacggttggggtggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCg > 2:329699‑M1/64‑151 (MQ=255) gccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggccgcggtggtgcggtcgaccgagtcgTTGATCGTGGCCTGA‑GCCGGCGTGTGGTTCGGGGTGAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAg > 1:5972288‑M1/62‑151 (MQ=255) gccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCg < 2:907120‑M1/93‑1 (MQ=255) ttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCgttg < 2:2746230‑M1/96‑1 (MQ=255) tcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCgg > 2:3118199‑M1/55‑86 (MQ=255) tcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCgttgt > 1:3795246‑M1/55‑151 (MQ=255) ggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCcgttgttg < 2:6243029‑M1/99‑2 (MQ=255) ggTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGGTGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTta 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gtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGa < 2:5805888‑M1/46‑1 (MQ=255) gtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAAtt > 2:6795201‑M1/28‑77 (MQ=255) cgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCgg < 2:3957238‑M1/26‑1 (MQ=255) aCGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAAt < 2:757860/151‑1 (MQ=25) cggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATc < 1:2522002‑M1/128‑1 (MQ=255) ggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCa < 2:6471732‑M1/129‑1 (MQ=255) gtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTgg < 1:1283168‑M1/112‑1 (MQ=255) ggggtggggtcggccgggtggTTGGTCGTGGTGTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTGAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGCCGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCaa > 2:2492223‑M1/22‑151 (MQ=255) ggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCg < 1:6693296‑M1/25‑1 (MQ=255) ggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACg < 1:4489409‑M1/132‑1 (MQ=255) ggtggcgtcggccgagtcgTTGGTCGTGGTCTGG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACg > 2:6697043‑M1/20‑151 (MQ=255) tggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGAc < 1:1136667‑M1/77‑1 (MQ=255) ggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAc > 1:2271174‑M1/17‑68 (MQ=255) ggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCAt > 1:2732781‑M1/17‑125 (MQ=255) gcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCg > 1:3122532‑M1/16‑46 (MQ=255) cgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGcc > 2:6596017‑M1/15‑151 (MQ=255) tcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCt > 2:1296176‑M1/13‑151 (MQ=255) cgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGtt > 2:2147032‑M1/12‑51 (MQ=255) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTgg < 1:4615121‑M1/141‑1 (MQ=255) gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTgg > 1:3936612‑M1/11‑151 (MQ=255) accgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTggg > 2:368559‑M1/10‑151 (MQ=255) cgagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGtt < 2:3432906‑M1/144‑1 (MQ=255) gagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc < 1:6892129‑M1/30‑1 (MQ=255) gagtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTc > 2:6892129‑M1/7‑36 (MQ=255) gtcgTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCt < 1:4262300‑M1/139‑1 (MQ=255) cgTTGATCGTGGTCTGG‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTGCCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTgggttttgcc > 2:358224‑M1/3‑148 (MQ=255) gTTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGAc > 2:5256144‑M1/2‑105 (MQ=255) ttGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCg < 1:6083273/54‑1 (MQ=255) | CGATCGTCACGGTGTCGCCGTTCGACAGGGTTACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGA‑GCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCG > CP009974/1898838‑1899134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |