| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1898984 = | 169 (0.460) | 1234 (3.580) +CGACTCGG |
275/284 | -0.0 | 84.4% | intergenic (‑6762/‑1835) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1899275 | 313 (0.860) | intergenic (‑7053/‑1544) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1629 total aligned reads displayed.
GTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACGCTACCAC > CP009974/1899125‑1899425 | ttttACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGAt < 2:5164829/151‑1 (MQ=255) tttACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAcc < 2:1208410‑M2/151‑3 (MQ=255) ttgccggCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTg > 2:1866358/7‑151 (MQ=255) gccggCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTa > 2:479125/5‑151 (MQ=255) cccGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagt < 1:4407685‑M2/151‑7 (MQ=255) ccGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGCCGAccgtgtc < 1:2600626‑M2/151‑8 (MQ=255) cGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcg > 1:5424613‑M2/1‑143 (MQ=255) aaCGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatc < 2:2199718‑M2/151‑15 (MQ=255) aaCGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatc < 1:5189923‑M2/151‑15 (MQ=255) ggTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTCCTCAGGGCCACGGTGTACGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTGGACCGTATCGCGCACCTgc > 2:1490221/1‑150 (MQ=255) tGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggt > 1:4096173‑M2/1‑132 (MQ=255) tGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAAc < 2:4614074/151‑1 (MQ=255) tGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctg < 2:6800177‑M2/151‑23 (MQ=255) gTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgag > 2:2070828‑M2/1‑127 (MQ=255) cTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGGTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagcc > 1:4858449‑M2/1‑125 (MQ=255) ggcgtGGGACGGGGTGGCGGTGACCGGCTTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGGCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTGAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggc > 2:5286592‑M2/3‑122 (MQ=255) gCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggc > 2:2909681‑M2/1‑122 (MQ=255) ccGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCg > 2:4047250/1‑151 (MQ=255) ccGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcg < 2:5387720‑M2/151‑31 (MQ=255) ttGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcg < 1:2241752‑M2/151‑34 (MQ=255) tGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACGGTCGGCGTGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgg > 1:5807710‑M2/1‑117 (MQ=255) tGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccgg > 1:326536‑M2/1‑117 (MQ=255) gACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtg < 2:6036381‑M2/132‑18 (MQ=255) cAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGc > 1:3833675/1‑151 (MQ=255) aGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgt > 1:3623803‑M2/1‑112 (MQ=255) gTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGACCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcgggg < 1:2009563‑M2/151‑43 (MQ=255) tAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggt > 2:3578661‑M2/1‑108 (MQ=255) cacggTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTc > 1:7198780/5‑151 (MQ=255) aaCCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtc < 2:876690‑M2/151‑45 (MQ=255) ccGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCCCGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcag > 2:2489870‑M2/1‑105 (MQ=255) ggTTAGCGGCGGCTGGGCGGGGTGGCGCAGGGACGCGGTGTAGGTGATCGCGCCGCCTGCGGGGACGCTTGGCGGGGCGGTGAGGGTCGCAGTGGTGGTGGCGCTTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCAcc < 2:4199964/150‑1 (MQ=255) ttACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttg > 2:3890222‑M2/1‑102 (MQ=255) ccGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccga < 1:3730727‑M2/103‑5 (MQ=255) cGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcg < 1:5328802‑M2/151‑54 (MQ=255) cGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGc > 2:3671633/1‑151 (MQ=255) gCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGccc < 1:1908193/151‑1 (MQ=255) cTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCTAccgagtcgttg < 2:741107‑M2/103‑12 (MQ=255) gAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCcaccac < 1:5015997/150‑1 (MQ=255) aGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtc > 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ggTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGGGTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcg > 2:7096776‑M2/1‑74 (MQ=255) gcaCGGTGTAGGTGCTCACGCCGCCTTCGGTTGCGCTTGGCGGGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgat > 2:6694034‑M2/2‑72 (MQ=255) aCGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatag > 1:6690542‑M2/1‑70 (MQ=255) cGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggt > 1:6417161‑M2/1‑69 (MQ=255) ggTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtg > 1:4700314‑M2/1‑68 (MQ=255) gtAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacg < 2:3228731‑M2/151‑87 (MQ=255) gggtgATCACGCCGCCTTCGGTGACGCGTGGGGTGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtgacgct > 2:4976831‑M2/3‑63 (MQ=255) tGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgac > 1:1002344‑M2/1‑60 (MQ=255) tGATCACGCCGCCGTCGGTGACGCTTGGCCAGGCGGGCAGGGTCGCGATCTCGGCGTCGAccgtgtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgac > 1:25151‑M2/1‑60 (MQ=255) gATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgat < 2:6252499‑M2/72‑14 (MQ=255) aTCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGGCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctgacgg > 2:5927695‑M2/1‑58 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gggcGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtca > 2:1765256‑M2/2‑35 (MQ=255) aGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggc < 2:3391065‑M2/100‑71 (MQ=255) ggCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctgacggtcgagccgttgttgtagacgtcattggcc < 2:2612724‑M2/151‑123 (MQ=255) ggCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgc > 1:6042967‑M2/1‑29 (MQ=255) gCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatcgtgacgctgacggtcgagccgttgttgtagacgtcatcggccg < 2:6894724‑M2/151‑124 (MQ=255) aGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctgacggtcgagccgttgttgtagacgtcat < 2:5524210‑M2/139‑118 (MQ=255) aGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtct < 1:757439‑M2/151‑130 (MQ=255) ggTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctgg < 1:7045031‑M2/151‑132 (MQ=255) ggTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccactggcgttctcgatagcgacgctgacggtcgcgccgttgttgtagccgccattggccggggtctgg < 2:6388476‑M2/151‑132 (MQ=255) ggTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgagcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgatctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattgcccggggtctgg < 2:3049808‑M2/151‑132 (MQ=255) gTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtca < 2:5664390‑M2/64‑46 (MQ=255) cgcgGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggc > 1:1740074‑M2/1‑17 (MQ=255) gcgGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtcattggccggggtctggaaat > 1:6522990‑M2/1‑16 (MQ=255) gcgGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtcattggccggggtctggaaat > 1:6804473‑M2/1‑16 (MQ=255) cagtggtggtgTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGAc > 1:5541858/3‑151 (MQ=255) ggtggtggtGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgag > 1:3561304‑M2/1‑14 (MQ=255) gtggtgTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaagtcaacgc < 1:6194563‑M2/151‑142 (MQ=255) gggtgTCGAGTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGAc < 2:6605798/150‑1 (MQ=255) ggtgTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaagtcaacgctg < 1:1102859‑M2/151‑144 (MQ=255) ggtgTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACg < 2:2331685/151‑1 (MQ=255) tgtCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattgcccggggtctggaattcaacgctgcc > 1:2835842‑M2/1‑6 (MQ=255) ggtcGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtcattggccggggtctggaaatcaacgctgcc > 2:197514‑M2/2‑6 (MQ=255) gtCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaaatcaacgctgccc > 1:2942908‑M2/1‑5 (MQ=255) tCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctgacggtcgagccgttgttgtagacgtcattggccggggtctggaagttgacgctgccct > 2:647791‑M2/1‑4 (MQ=255) cGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgagccgttgttatagacgtcattggccggggtctggaaatcaacgctgccctg < 1:1358282‑M2/151‑149 (MQ=255) accgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgatagtgacgctgacggtcgagccgttg > 1:4569744‑M2/1‑1 (MQ=255) accgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcggcgttctcgatggtgacgctgacggtcgaaccgttgttgtagacgtcattg > 1:3964618‑M2/1‑1 (MQ=255) | GTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGAAATCTGGCCCCCGTCGATGTAGGGTGTGTCGTTTGCCGGAACTGCGACGTTGACGCTACCAC > CP009974/1899125‑1899425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |