| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1154348 = | NA (NA) | 209 (1.020) +GCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCC |
121/226 | 0.4 | 50.5% | coding (1048/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1155597 | 272 (1.000) | coding (2297/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGCCGCCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCGCCGGGCTCGCCGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1154483‑1154348‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTACCATCCGGATT < CP009974/1155597‑1155452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCGCCGGCCGCGCCGCGGCCGGTGCAGGggcc > 2:4654929/1‑147 GTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGAGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCACCGCCGCCACCGGTGCCAATCAGGTTGCCGCCAGCATCGCGCACCTGCACGGCAGCGCCGGGCTCCCCGCGGCCGCTGAAGGCGCCGCCAGCGGC > 2:4054123/1‑151 GCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGGGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCG > 2:2627434/1‑151 CCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGT < 1:1416915/151‑1 CTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTC > 2:1184796/1‑151 TGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCG < 1:4979015/151‑1 ggAGGCGACAGGGTGAGGCTGAGCAGGCCCTCGGCGCCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTT < 2:401287/149‑1 AGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGC < 1:1037838/151‑1 GGCGACAGGGTGAGGGTGAACAGGCCAGGGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCt < 2:1286366/151‑2 GCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCtc < 2:2978111/151‑3 GCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCtc < 2:1667600/151‑3 CGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCG < 2:623030/151‑1 AGGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCG < 1:1275137/151‑1 GGGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGG > 1:2656670/1‑151 GGTGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGC > 1:727255/1‑151 TGAGGCTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAG < 1:823870/151‑1 CTGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTGGCTCGGGCGGCAGCAGGg > 1:3085251/1‑150 TGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTC > 1:1825560/1‑151 TGAACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTC > 1:3269704/1‑151 AACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAGGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAG > 2:2852041/1‑151 AACAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAG > 2:2117193/1‑151 CAGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCC > 1:603780/1‑151 AGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCG < 1:2850491/151‑1 AGGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCG > 1:3183709/1‑151 GGCCATCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGA > 1:2483854/1‑151 caTCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGT < 1:539300/149‑1 cTCGGCACCGTCGACACCGGCGCTGATCAGGGTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGCCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTG < 2:4829973/150‑1 aTCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTG < 1:1770182/150‑1 aTCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTG > 1:943406/2‑151 TCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGAAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGA < 1:1168110/151‑1 GGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACC < 2:1469714/151‑1 CACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGA > 1:3978757/1‑151 ACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATTGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGTGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAG > 1:4171831/1‑151 CGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCC < 1:281923/151‑1 CGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCGCGGCCGGCAGCGGTTCAGCCGAGGTGGCCGAGCC > 1:2564052/1‑151 ccgctctCCGGTGCCGATCAGGGTGCCGGCAGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCCGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCTAGGTGACCGAGCCC < 2:1561784/144‑1 ACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCCGCCGAGGTGACCGAGCCCG > 2:838345/1‑151 CGACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGG < 1:4450402/151‑1 GACACCGGTGCCGATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTGGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGT > 2:4191003/1‑151 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GATCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTG < 2:1881099/151‑1 TCAGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCC < 1:1563759/151‑1 TCAGGTTGGCGGCAGCATCGCACACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCC > 1:2758203/1‑151 AGGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCag > 1:845016/1‑149 GGTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCagg > 1:4468088/1‑148 GTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCG < 2:712344/151‑1 GTTGGCGGCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCG > 2:3267127/1‑151 tggcggCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGC > 1:2369376/7‑151 tggcggCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGC > 1:2754218/7‑151 gcggCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGT > 2:2329700/5‑151 ggGCATCGCGCGCCTGCACGGTGGCGCCGGGCTCGCCGCGGCCGGGGAAGGGGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCGGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGT < 2:2375016/149‑1 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CTGCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGC < 1:5421892/151‑1 GCACGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAA > 2:2576428/1‑151 CGGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGT < 1:366338/151‑1 GGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTG < 1:4722285/151‑1 GGTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTG > 2:4162861/1‑151 GTAGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGC < 2:1910267/151‑1 AGCACCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTG > 2:1291573/1‑151 caCCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCC > 2:736749/3‑151 caCCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCC < 2:5292451/149‑1 cCCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGTGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTCGCGATACGTTGCCAGCGGCGGCGGCGATGCGTACTTGCAATGTGCTatcg > 2:2818112/2‑147 CCGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCgt > 1:4948022/1‑149 CGGGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGACAAAGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTC < 1:4624283/151‑1 GGCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGGCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGt > 2:2192633/1‑150 GCTCGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGtt < 2:4933965/151‑3 CGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGttcac > 1:2289573/1‑146 CGCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGGTcac > 1:1483215/1‑148 GCCGCGGCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGttcacg > 1:2622228/1‑145 CCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCACGGGCGGCAGCAGGGCAGCCGAGGGGACCGAGCTCGGTTGCGCTACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGGGACTTGCAAGTTGCTGCCGCCGGTGACGGCAGGGT > 1:967195/1‑151 ACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGG > 1:3881472/1‑151 GCCATCGGGCAAGGCCGGGCCCGTCGGTTGCGGGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGtg < 2:2760172/151‑3 GCCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGtg > 1:3722235/1‑149 CCATCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGA > 2:3522004/1‑151 TCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGG > 1:2044912/1‑151 TCGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGG > 1:4376151/1‑151 CGGCCGAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGT < 2:1346730/151‑1 CGGCCAAGGCCAGGTCCGTCGGTTGCTCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGGCCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCAGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCGTCGTTCACGGCAGGGTCCAGGGTGATGGTGAAGGT < 2:886794/151‑1 GGCGAAGGCCAGGTCGGTCGGTTGCGCGGGCGGCGGGAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTA < 2:3881975/151‑1 GGTCGGTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAGGGTACTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTACCATCCGGATT < 1:4709426/151‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCACCGACGACACCGGTGCCGATCAGGTTGCCGCCAGCATCGCGCACCTGCACGGTAGCGCCGGGCTCGCCGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1154483‑1154348‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCGGTTGCGCGGGCGGCAGCAGGTCAGCCGAGGTGACCGAGCCCGGTTGCGATACGTTGCCGGCGGCGTCGGTGAGGGTGACTTGCAAGGTGCTGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTACCATCCGGATT < CP009974/1155597‑1155452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |