| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1154348 = | NA (NA) | 209 (1.020) +GCCGGTGAAGGTGACGCCATCGGCCAAGGCCAGGTCC |
121/226 | 0.4 | 50.5% | coding (1048/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1155597 | 272 (1.000) | coding (2297/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 647 total aligned reads displayed.
GGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATT > CP009974/1155448‑1155747 | gctgcagATGGCACCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCgacggacc > 1:2636741/7‑150 (MQ=25) aaTCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCgactgacc < 2:1364083/151‑2 (MQ=255) aaTCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACcgacc < 1:4709447‑M2/151‑6 (MQ=255) gcagATGGCACCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTgg < 1:561802/148‑1 (MQ=25) gcagATGGCACCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTgg < 1:1419055/148‑1 (MQ=21) gaggATGGCAGCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTgg < 2:4052325/149‑1 (MQ=21) cGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGc < 2:4911790/151‑1 (MQ=255) ggATGGCACCTTCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGcc < 2:1019476/151‑1 (MQ=25) agATGGCACCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGCCGGACCTGGcc > 2:67464/2‑151 (MQ=25) aTGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGcctt < 1:3850498/151‑3 (MQ=255) tGGCACCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTg < 2:4292145/151‑1 (MQ=25) ggcaCCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTGGCCTTgg < 1:1314183/148‑1 (MQ=25) tACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTCCCGCCGCCCGCGCAACCGACcgacctggccttcgcc < 2:3881975‑M2/151‑17 (MQ=255) caCCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACGGACCTGGCCTTGGcc < 1:1020632/150‑1 (MQ=25) aCCTTCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCg > 1:2470513/1‑151 (MQ=25) ttCACCGTCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATg < 2:2146022/151‑1 (MQ=25) tCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATgg > 1:2607579/1‑151 (MQ=255) tCACCATCACCCTGGACCCTGCCGTGAACGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatgg > 2:3522004‑M2/1‑130 (MQ=255) gcGCCATGACCTGGGACCCGGCCATCGCCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCGCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATgg < 2:5077190/150‑1 (MQ=25) cATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTc < 1:2763928/151‑1 (MQ=37) tGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCAc > 2:2070461/1‑151 (MQ=255) aaCCCGGCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCg < 1:2934035/151‑1 (MQ=255) ggCCATCACCGATGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTcgc > 2:1723259/1‑151 (MQ=255) cgtgaacGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCgcggc < 1:2534831/145‑1 (MQ=38) tCACCGATGGCAGTACCCTGCAACTCACCCTCTCCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGa < 2:2986806/151‑1 (MQ=37) gaatgacggCAGCACCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAg < 1:4396117/144‑1 (MQ=21) gaacGACGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTCTCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCCACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCCTGCCCTTCCCCCGTCgcggcggg > 2:2913255/4‑149 (MQ=25) aatgacggCAGCACCTTGCAGGCCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGc < 2:4860164/145‑1 (MQ=21) aacgacggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGc > 1:5037044/7‑151 (MQ=37) gacggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCg < 2:3777042/148‑1 (MQ=37) gacggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCg < 1:1519715/148‑1 (MQ=37) aTGGCGGTACCCGGCAAGTCACCCCCGCCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCCGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCgg < 2:866705/151‑1 (MQ=25) cggCAGCACCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCggt < 1:4958186/150‑2 (MQ=25) cgatagcacattGCAAGTACGCATCGCCGCCGCCGCTGGCAACGTATCGCGACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCACCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggg > 2:2818112‑M2/5‑99 (MQ=255) ggCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcg > 1:3194279/1‑150 (MQ=37) ggCAGCACCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCggtg < 1:3449518/151‑3 (MQ=25) ggCAGCACCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCggtg > 1:3664524/1‑149 (MQ=21) gcagcaCCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCggtgc < 1:5241113/151‑4 (MQ=21) gcagcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgc < 1:706802/151‑3 (MQ=37) gcagcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgc < 1:3280433/151‑3 (MQ=37) gcagcaCCTGGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGTCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgc < 2:4988688/151‑3 (MQ=37) agcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgcta > 2:4786214/1‑147 (MQ=37) agcaCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgcta > 1:2232933/1‑147 (MQ=37) gcaCCTTGCAGGTCACCCTCGCCGATGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCggtgctac > 1:4147964/1‑145 (MQ=21) aCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccg > 1:3130256‑M2/1‑92 (MQ=255) aCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgccgccg > 1:5172028/1‑144 (MQ=37) aCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGcgccaccg > 1:4198752/1‑144 (MQ=25) aCCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCGCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGCCACCTTCACCGGGCGCGGCGATCCCGGcgctcccg > 2:1301515/1‑144 (MQ=255) tCACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcg > 1:2512317‑M2/1‑82 (MQ=255) cACCCTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgc > 2:246260‑M2/1‑81 (MQ=255) cTCACCGACGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcacgtgcgcgatg < 2:2274388‑M2/151‑75 (MQ=255) atgccgccggCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgc > 1:4076994‑M1/3‑121 (MQ=255) aCGCCGCTGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgc > 2:2329700‑M2/1‑70 (MQ=255) tgccgcccGCAGCGTATCCCGGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCGGACTTGCTGCCGCCCGCACAGCCGACTGACGTGGCCCTGGCCGATGGCGGCGCCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgcc < 2:5319653‑M1/150‑32 (MQ=255) gccgctGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgcca > 1:2369376‑M2/1‑68 (MQ=255) ccgccgGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaa < 2:788290‑M1/151‑34 (MQ=255) cgctgGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaac > 2:3267127‑M2/1‑66 (MQ=255) ccgGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacct < 1:902568‑M1/151‑37 (MQ=255) cgGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctg > 1:335365‑M1/1‑114 (MQ=255) gCACCGTCTCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgat < 2:3333076‑M1/151‑40 (MQ=255) gCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgat < 1:1713007‑M1/151‑40 (MQ=255) cAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatc < 2:1884973‑M2/151‑92 (MQ=255) cAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatc > 2:180810‑M1/1‑111 (MQ=255) cGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCTGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGTCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgtgcgatgctgccgccaaccttatcggc > 1:1903128‑M1/1‑108 (MQ=255) tCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccg > 1:3892482‑M2/1‑53 (MQ=255) cccagccgggctCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccgg > 1:4810883‑M1/6‑103 (MQ=255) cAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtg < 1:597063‑M2/151‑102 (MQ=255) ccGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggcattggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgctgccgccgccaccctgatcggcaccgctctcg < 2:5230899‑M2/151‑105 (MQ=255) cGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgt < 1:765281‑M2/151‑106 (MQ=255) ggCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcg < 1:281923‑M2/151‑108 (MQ=255) cTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggt < 2:3089102‑M1/151‑59 (MQ=255) cTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggt < 1:4554600‑M1/151‑59 (MQ=255) cTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgacgctcccgccaacctgaccgacaccgctgtcgtcgcc > 1:3577498‑M1/1‑93 (MQ=255) tCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtg > 1:3978757‑M2/1‑41 (MQ=255) ggTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgcc < 1:1081566‑M1/151‑62 (MQ=255) gTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccg < 1:1207993‑M1/151‑63 (MQ=255) cACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgat < 2:3664524‑M1/151‑65 (MQ=255) acttcggCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatg > 2:4004566‑M1/4‑86 (MQ=255) aCCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatg < 1:539300‑M2/151‑117 (MQ=255) ccGCGGCTGACCTGCGGCCGCCCGAGCAACCGACggagctggccgtggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatgg > 2:417521‑M2/1‑34 (MQ=255) ttcGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaccctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgctcgc > 2:4652420‑M1/2‑84 (MQ=255) gccgactTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGCTGGCGTCACCTTCGCCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgggcgggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgt < 2:1261342‑M1/148‑72 (MQ=255) cgccttgctgccgcccGCACAACCGACTGACTGGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttc < 2:2745821‑M1/146‑74 (MQ=255) gACCTGCTGCCGCCCGAGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttca > 1:1825979‑M2/1‑26 (MQ=255) acttgctgccgcCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcag > 1:963136‑M1/4‑76 (MQ=255) ttgctgccGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcc < 1:1654999‑M1/150‑78 (MQ=255) gctgcCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctc < 1:4320327‑M1/151‑80 (MQ=255) ccgcccgaGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccc > 1:4456965‑M2/1‑17 (MQ=255) cgcccgaGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccct > 2:1156090‑M2/1‑16 (MQ=255) gcccgcACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctg > 1:2129795‑M1/1‑66 (MQ=255) gcccgcACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctg < 1:2021715‑M1/151‑86 (MQ=255) cccgaGCAACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctct < 2:2527783‑M2/151‑138 (MQ=255) gagcaaCCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgc < 2:1667600‑M2/149‑141 (MQ=255) agcaACCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcatcaccctggcgcc < 2:3489771‑M2/150‑142 (MQ=255) aaCCGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgc > 2:576483‑M2/1‑7 (MQ=255) cGACggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgccca < 1:824685‑M2/151‑148 (MQ=255) gactgactTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcacctccccag > 1:2994748‑M1/1‑54 (MQ=255) cggacctggccttggccgatggcgtcaccttccccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggc > 2:2627434‑M2/1‑1 (MQ=255) cggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggc > 1:1361007‑M2/1‑1 (MQ=255) cggacctggccttggccgatggcgtcaccttcaccggccgcggcgagcccggtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggc < 2:1534993‑M2/151‑151 (MQ=255) | GGTCAATCCGGATGGTACCTTCGCCATCACCTTGAACCCGGCCATCACCGATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATT > CP009974/1155448‑1155747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |