| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
GACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155527‑1155648‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCGACGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGCAACGTATC < CP009974/1155745‑1155653 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gatGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCG > 2:3952882/4‑151 atGCCGCCGGCAACGTATCCCAGCCGGGCTCGGTCACTTCGGCCGACTTGCTGCCGCCCGCACAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGC > 1:4076994/3‑151 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ggcCGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATG > 1:2158771/4‑151 ggcCGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATG < 1:299842/148‑1 cCGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCGGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCC < 2:4147964/150‑1 cCGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCCCCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCC < 2:2112377/150‑1 CGCGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCG < 2:1792023/151‑1 CGGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCC > 1:347342/1‑151 GGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCG < 1:336689/151‑1 GGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGACTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCG < 1:130576/151‑1 GGCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGCGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTCTCGCCTGCCCAGGCCCATGGTGAAGCACTGGATGTGCCTCTGGCGGACGCCGCCG > 2:3285578/1‑151 GCGAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGG < 2:5253906/151‑1 GAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGta < 1:802850/151‑3 GAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGta < 2:2797608/151‑3 GAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGta > 1:1437249/1‑149 GAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGta > 1:3526191/1‑149 GAGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGta > 1:2200714/1‑149 AGCCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGACGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCACGGGCGAAGCACTCGACGTGGGTCTGCGGGATGCCGCCGGGAA > 2:3808853/1‑151 cgCGGGGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGTAACa < 2:3147787/149‑2 CCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGTAACa < 2:4998222/151‑2 CCCGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAACGGTGAAGCACTCGATGTGCGCCTGGTGGATGCCGCCGGtacca > 2:1111607/1‑146 CGGTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGTAACagc < 1:1522309/151‑4 GTGCTACCGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGCCAACCTGATCGGCACCGGTGTCGTCGGTGCCGATGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCCATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGTAACagctc > 2:592507/1‑146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155527‑1155648‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCGACGGCCTGTTCAGCCTCACCCTGTCGCCTGCCCAGGCCAATGGTGAAGCACTCGATGTGCGTCTGGTGGATGCCGCCGGCAACGTATC < CP009974/1155745‑1155653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |