New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
ATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGT > CP009974/1155498‑1155798 | tGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCCACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCCCCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGc > 2:1272804/1‑151 (MQ=37) tGGCAGTACCCTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACCTGGCCTTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGc > 1:5408053/1‑151 (MQ=255) cggCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCCGACTTGCTGCCGCCAACGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGc > 1:3884829/2‑151 (MQ=255) 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ggCGTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatg < 1:3757344‑M1/151‑120 (MQ=255) gTCACCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgacggtgccgatggcctgttccgcctcaccctgtcgccgtcccaggccaatggcgacgcacccgatctgc > 2:3312737‑M1/1‑29 (MQ=255) aCCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccactggtgaagcactcgatgtgcgcc > 2:4340028‑M1/1‑26 (MQ=255) aCCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtc < 1:2304971‑M1/151‑126 (MQ=255) aCCTTCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcacccgatgtgcgtc > 2:2097522‑M1/1‑26 (MQ=255) ttCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgcc > 2:1775911‑M1/1‑23 (MQ=255) tCACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggt < 1:1243536‑M1/151‑130 (MQ=255) cACCGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtg > 2:4700387‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCGGCCGCGGCGAGCGCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttccgcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtgg < 1:2565631‑M1/151‑132 (MQ=255) cGGCCGCGGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggat < 2:148985‑M1/151‑134 (MQ=255) gccgcggcGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgc > 1:3239056‑M1/3‑16 (MQ=255) ccgcggCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgcc < 1:5283769‑M1/150‑137 (MQ=255) cgcgGCGAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccg < 1:1514131‑M1/151‑138 (MQ=255) cggcgCGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgcc < 2:1371375‑M1/151‑140 (MQ=255) cggcgAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgcc > 1:4881930‑M1/1‑12 (MQ=255) cggcgAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgcc < 1:3946535‑M1/151‑140 (MQ=255) cggcgAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgcc > 1:347342‑M1/1‑12 (MQ=255) gcgAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccgg < 2:5253906‑M1/151‑142 (MQ=255) cgAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggt < 1:3630944‑M1/151‑143 (MQ=255) gAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggta > 1:3526191‑M1/1‑8 (MQ=255) gAGCCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggggaagcactcgagatgcggctggtggatgccgccgata > 1:3083968‑M1/1‑8 (MQ=255) ggcCCGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggtaa < 2:237513‑M1/150‑145 (MQ=255) cccGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggtaaca < 1:5223396‑M1/151‑147 (MQ=255) ccGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggtaacag < 2:2133442‑M1/151‑148 (MQ=255) cGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggtaacagc > 2:1147474‑M1/1‑3 (MQ=255) cGGtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggtaacagc > 1:4993339‑M1/1‑3 (MQ=255) gtgctaccgtgcaggtgcgcgatgctgccgccaacctgatcggcaccggtgtcgtcggtgccgatggcctgttcagcctcaccctgtcgcctgcccaggccaatggtgaagcactcgatgtgcgtctggtggatgccgccggtaacagctc < 2:1700536‑M1/151‑151 (MQ=255) | ATGGCAGCACCTTGCAAGTCACCCTCACCGACGCCGCCGGCAACGTATCGCAACCGGGCTCGGTCACCTCGGCTGACCTGCTGCCGCCCGCGCAACCGACTGACTTGGCCCTGGCCGATGGCGTCACCTTCACCGGTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGT > CP009974/1155498‑1155798 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |