| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1155977 = | 3 (0.010) | 314 (1.560) +GGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCC |
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| ? | CP009974 | = 1158685 | 290 (1.060) | intergenic (+2208/‑13075) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC | |||||
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
AACAGCGTGACGCTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1156065‑1155977‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < CP009974/1158685‑1158536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gcCAGGGTGATGGTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCT < 2:5387323/149‑1 tgatggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACATCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGG < 1:4654929/145‑1 gatggTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGC < 2:1715213/146‑1 ggTGAAGGTGCCAGCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTT < 1:5305324/149‑1 GAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTG > 1:3243990/1‑151 AAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGT > 2:4776866/1‑151 AAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGT < 1:3029663/151‑1 AGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTC < 2:1014425/151‑1 GTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGC < 1:1578720/151‑1 GCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGAT > 1:1774056/1‑111 GCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCG > 1:741006/1‑151 ATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCCGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCG > 1:4028260/1‑151 ATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCG > 1:803737/1‑151 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< 2:1249982/151‑1 GGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGC > 1:1961903/1‑151 GGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGACTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGC > 2:3873960/1‑151 GTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCG < 2:903390/151‑1 TGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGC < 1:1018847/151‑1 CCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGG < 1:3334222/151‑1 CGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGT > 1:2941939/1‑151 gtgGCGAGGATGTTTCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACGAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAA < 2:4206230/148‑1 GAGGATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTA > 2:3651968/1‑151 GATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTG > 2:311747/1‑151 GATGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTG < 1:2852041/151‑1 TGTTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTACGGTTATTGGC > 1:4765596/1‑151 TTGCCTGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGG < 2:275646/151‑1 ctgccaCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGA > 1:942208/7‑151 CGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGA < 1:3451649/151‑1 tGCCACGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAG > 1:1855743/2‑151 GCCGCGTCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGn < 1:3861799/151‑2 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< 1:3312094/151‑1 TCACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGC > 1:1375323/1‑151 ACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCT > 1:2978081/1‑151 ACGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAACGTTATTGGCGGTGGAGGCGGTGCCT > 2:3539889/1‑151 CGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTG > 1:2279716/1‑151 CGCACCTGCACGGTAGAGCCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTG < 2:2223413/151‑1 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GCTGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCTCTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCG < 2:5219415/151‑1 TGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTC > 1:3586527/1‑151 TGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCAT > 1:3791142/1‑120 TGAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCAT < 2:3791142/120‑1 GAGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCT > 1:3749160/1‑151 AGCTGGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTc > 1:5095728/1‑150 GGCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTG > 2:1554199/1‑151 GCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGT < 2:4016111/151‑1 GCTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGAGTGTTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGT < 2:1100197/151‑1 CTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTG < 1:5239774/151‑1 CTGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTG < 2:2279350/151‑1 TGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGG < 1:4351204/151‑1 TGCCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGG < 1:1510111/151‑1 gCGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGGCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCG < 2:797233/150‑1 CGGGAGCGCCGAGCACCTGATTGGTGGGGGGGTCTGGTGGCGGTGTGTCGCCGCCGTGGATGTGCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGTGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCCGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGG < 2:1644458/151‑1 CGGCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGT > 2:1941456/1‑88 GGCAGCGCCGCTCACCCGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGG < 2:2967808/151‑1 GCAGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTGATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCCTCTGCGGCGGTGACGTGCCGCACGGCGCCGTCTACCTGTCGCCGGT > 2:4848965/1‑151 AGCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCG > 1:2481893/1‑151 GCGCCGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGA < 1:2783747/151‑1 CGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTGAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGTCGGGTCTAGGGT > 1:5402377/1‑151 CGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT > 2:4472426/1‑151 CGATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGACGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCATGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < 1:2127406/151‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACAGCGTGACGCTGAAGGTGCCATCTGCAGCGACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1156065‑1155977‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATCACCAGATTGGTCGGGGCCTCCGGTGGCGTTGTGTCGCCGCCGTCGATGTCCGGCGCGGTAAGGTTATTGGCGGTGGAGGCGTTGCCTGCCGCATCGGTGGCCGTCACTTGCAGCACTTCGCCGTCTACCTGTGGCGGGTCGAGGGT < CP009974/1158685‑1158536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |