New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009974 | = 1897294 | NA (NA) | 1076 (4.090) | 231/290 | 0.0 | 98.6% | intergenic (‑5072/‑3525) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
? | CP009974 | 1897952 = | 16 (0.060) | intergenic (‑5730/‑2867) | RPPX_08470/RPPX_08480 | tryptophan synthase subunit beta/hypothetical protein |
Only 100 of 1214 total aligned reads displayed.
GGGGCGGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTtcggt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1897145‑1897294 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTC > CP009974/1897952‑1898106 GGGGCGGTTGCAGTGGCCGAACCGTTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTT > 1:4523450/1‑151 GGGGCGGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACAACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAAGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTT < 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GCGGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGGGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGG > 1:4250173/1‑151 agctaCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTC > 1:2785607/6‑151 gctaCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCA < 1:3016764/147‑1 taCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACC > 2:4648233/3‑151 TGCAGTAGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACC < 2:4164656/151‑1 AGTAGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGAA > 2:3161899/1‑151 gtgGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAG < 2:101050/148‑1 gtaGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGAAG > 1:2411135/4‑151 GTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAcg < 2:480297/151‑3 gGCCGAGCCGGGGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGG < 2:3292804/150‑1 gGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACAGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGG > 2:1474311/2‑151 CGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGACGGG < 1:2049519/151‑1 GCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGACGGGG > 2:1223247/1‑151 GCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACAACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGACGGGG > 2:2798862/1‑151 GAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGG > 2:2606820/1‑151 ACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCg < 1:3948021/151‑2 cctGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAG < 1:3437231/148‑1 CGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGACGGGGTGGCAGT > 1:2711371/1‑151 GGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTC > 1:1004255/1‑151 GTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCA < 1:2900118/151‑1 GGTGCTGTTGGCTGCCACAACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGACGGGGTCGCAGTCAGC > 1:1759423/1‑151 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< 2:684780/151‑7 CAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCGCCGACGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCATCGAGGGTGTCGGTGACatccact > 2:5171118/1‑144 AGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCG < 1:3769430/151‑1 GCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGA > 2:5427214/1‑151 CTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGCACCGAA > 2:3003961/1‑151 TTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCACCGCCTTCGGTCACCGACGGGGTCGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTGACTTGAACCGAAG < 1:3136015/151‑1 GTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCA > 2:1588326/1‑151 ACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCgttgcc > 2:1328931/1‑145 AGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCGGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCCGCACCGCCCAactc < 1:3379723/151‑5 AGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTATTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGC > 1:4444765/1‑85 TGGTTGTTGATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCA > 2:4080872/1‑151 GTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCGTTGCCGCCCAGTTGCAGGTTC < 2:2260062/151‑1 gTCGGCAGGGCGTGTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCGTCGGTCACCGAAGGGGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCGTTGCCGCCCAGTTGCAGGTTCTCga < 2:3804186/150‑3 ATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCGTTGCCGCCCAGTTGCAGGTTCTCga > 1:4150515/1‑149 ATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGACGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTCGCGGTCAGCTTCGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCGTTGCCGCCCAGTTGCAGGTTCTCga > 1:3544169/1‑149 ATCGGCAGACCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAA < 1:5148723/151‑1 TCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCTCCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGCTGTGACCGT > 2:4243434/1‑151 TTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTA > 1:3047695/1‑151 TGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTAT < 2:3654335/151‑1 GGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCC > 2:2912987/1‑151 GTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCA > 1:2308678/1‑151 TCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTGCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGCCGAGCGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGCTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGGCTATATCCAC > 2:187507/1‑151 CAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACA < 2:389531/151‑1 AGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAG < 2:3386958/151‑1 ATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACG < 1:1182493/151‑1 GTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGA > 2:1127860/1‑151 TAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGC < 2:4875924/151‑1 CCTTCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGC > 1:1697345/1‑151 GGGGCGGTTGCAGTCGCCGAACCGGTGGTGCTGTTGGCTGCCACGACGACGGTGGTGCCGTCGGTCAGCTTGAAGTACAGCTCCGAGTGGTTGTTGATCGGCAGGCCGTCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTtcggt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1897145‑1897294 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGGTCACCGAAGGGGTGGCAGTCAGCTTGGCCACGACTTCGTCGAGGGTGTCGGTCACTTGAACCGAAGCAGCACCACCCAGTTCCAGGTTCTCAAAGGTGTGACCGTCTATATCCACAGCGGACGTGATGCCCAGACTGATCTGGCCTGCGTC > CP009974/1897952‑1898106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |