| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 884033 = | 115 (0.420) | 185 (0.910) +CCCAACCACCGATTTGTGCGCAACCGCCGATTTGTGTC |
119/224 | 0.4 | 68.2% | intergenic (+81/+252) | RPPX_03845/RPPX_03850 | FAD‑binding protein/general secretion pathway protein GspN |
| ? | CP009974 | = 884084 | 116 (0.430) | intergenic (+132/+201) | RPPX_03845/RPPX_03850 | FAD‑binding protein/general secretion pathway protein GspN | |||||
Only 100 of 557 total aligned reads displayed.
AGGGGTGCCGGAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGCGCACAAATCGGTGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCAAGCAACGCGCCGCCTGCTTCG > CP009974/883883‑884182 | attcgcgggcaagcccgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcac < 2:1088588‑M1/3‑1 (MQ=255) attcgcgggcaagcccgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcac < 1:4273962‑M1/3‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTAGAcaca > 2:4309852/1‑151 (MQ=255) cgggcaagcccgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcacaaatc > 2:780747‑M1/144‑151 (MQ=255) ggAAGACGCGCTACAGGCTGCGGCCTACTCGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGGGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCgg < 2:5432160/151‑1 (MQ=255) gAAGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggt < 1:865703/151‑1 (MQ=255) aaGACGCGCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCggtg > 2:3406569/1‑151 (MQ=255) aagcccgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcacaaatcggtgg < 1:2688351‑M1/13‑1 (MQ=255) gcccggtcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcacaaatcggtggtt > 2:4501027‑M1/137‑151 (MQ=255) gcccgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggcacaaatcggtggtt < 1:578623‑M1/15‑1 (MQ=255) cgcgCTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTg > 1:4722267/1‑151 (MQ=255) gcgcTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTgg < 2:914475/151‑1 (MQ=255) cgctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGa < 1:3518147‑M1/18‑1 (MQ=255) gctcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGac < 1:4982051‑M1/19‑1 (MQ=255) cTAAAGGCTGCAGCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGaca < 1:4281121/151‑1 (MQ=255) tcctacactgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGacac < 2:2610378‑M1/21‑1 (MQ=255) cgtggatgggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATc > 2:4277068‑M1/126‑151 (MQ=255) tgatcggggatggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATcggc > 1:5380110‑M1/123‑151 (MQ=255) ggatcggggatggacacaactcggcggttggacacgaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATcggc > 2:2534886‑M1/123‑151 (MQ=255) gatcggggatggacacagctcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATcggcg > 1:3486451‑M1/122‑151 (MQ=255) tcggggatggacacgactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGt > 2:3351054‑M1/120‑151 (MQ=255) gCCTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGt < 2:2920432/151‑1 (MQ=255) ccTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATaggcggat > 2:4582181/1‑149 (MQ=255) ccTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGtt > 2:189007/1‑151 (MQ=255) cTACTGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGGCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTg > 2:4081665/1‑151 (MQ=255) ggatggagacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTggg > 2:665329‑M1/116‑151 (MQ=255) tGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGca < 1:1617448/151‑1 (MQ=255) tGGCGGGCCAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGca > 1:2937186/1‑151 (MQ=255) ggacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGcaca > 1:307874‑M1/112‑151 (MQ=255) gacacaactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACaa < 1:49634‑M1/41‑1 (MQ=255) ccAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCg < 1:3032563/151‑1 (MQ=255) caactcggcggttggacacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgggcacaaatcggtggttggacacaaatcggcggttgcgcacaaatcggtggttgggCACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCg < 1:5086901‑M1/45‑1 (MQ=255) cAACGGGACTGCCGACGACGAGTGATCGTGATTGCCTGATCTGCCGTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACTGATCGGGGATGGACACAACTCGGCGGTTGGACACAAATCGGTGGTTGGACACAAATCGGCGGTTGGGCACAAATCgg > 1:621254/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |