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Only 100 of 559 total aligned reads displayed.
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cagcaTCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTc > 1:2168123/1‑151 (MQ=255) agcaTCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCg > 1:3775913/1‑151 (MQ=255) ccctcacCGGTGCCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGgcgc < 2:1013781‑M1/144‑1 (MQ=255) cctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGcc < 1:5028365‑M1/145‑1 (MQ=255) caTCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGcc < 2:1322985/151‑1 (MQ=255) 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acCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGCCATCg < 1:1780331‑M1/149‑1 (MQ=255) cGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGCCGCCCTCGACGCGCCGCAGGCCACCGGCGGACTGCTGGACGCGGGCGCCACCGag > 2:4632024/1‑150 (MQ=14) | CCCGGCCGCTCAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCACTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAT > CP009974/1154704‑1155004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |