| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009974 | 1157207 = | 0 (0.000) | 269 (1.880) | 73/164 | 1.3 | 100% | intergenic (+730/‑14553) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
| ? | CP009974 | = 1158025 | NA (NA) | intergenic (+1548/‑13735) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC | |||||
Only 100 of 628 total aligned reads displayed.
GGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1157313‑1157207‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcgttgccgcttgggtcggtctgcaccaggctcaactgctcgcctggctgagcggccggggcgagATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGCCTCA < CP009974/1158025‑1157878 GGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGA < 1:3756280/151‑1 GCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGAT < 1:2448462/151‑1 CGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCAC < 1:2351603/151‑1 CGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCAC < 2:604513/151‑1 CGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCAC < 1:882218/151‑1 CGGGGGTCAAGGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCAC < 2:2693461/151‑1 GTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGAGCACGG > 2:4594036/1‑151 TCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACGGTGCC > 2:1698823/1‑151 CAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACGGTGCCA > 2:1395144/1‑151 CAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACGGTGCCA > 1:4606689/1‑151 CAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCA > 2:4027159/1‑151 AATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGCCATTGGCTCCCACAACACCCGTGCCGATCACGGTGCCAt < 1:1920421/151‑2 TGGTACGTCGTGCTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTG < 1:678703/151‑1 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AGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCTGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCtgtgc > 1:5173206/1‑146 GGCTCAATTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCC < 2:905524/151‑1 GGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCTGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCtgtgcc < 1:1745129/151‑7 CAATTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCA > 1:812731/1‑151 CAATTGCTCGCCCGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCA > 1:4917711/1‑151 GCTCGCCTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCC > 2:4730552/1‑151 CTCGCCTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCA > 2:1076480/1‑151 ggCTGGTTGTGCGGCTGCGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCCCCGGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACT < 2:2226607/149‑1 CTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGT > 2:4498711/1‑151 CTGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGT < 1:4399070/151‑1 TGGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTA < 1:4090654/151‑1 GGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACCGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACGGTAA > 2:1179573/1‑151 GGCTGTGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAA > 2:5183691/1‑151 ctgtGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATA < 2:2942327/147‑1 tgtGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATAT < 2:3348366/148‑1 gtGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATT > 2:395851/3‑151 gtGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATT < 2:700283/149‑1 tGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTG < 1:35069/150‑1 GGCTGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTT > 2:802972/1‑151 tGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACg > 2:1757023/2‑150 tGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGCTCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACT < 2:3272821/150‑1 tGGGGCGAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCTGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGACCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACT < 2:4292025/150‑1 GAGGTCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCTCCCACGACGCCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGTTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAACATTGGTTACGGCCTCA > 2:253992/1‑151 GGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1157313‑1157207‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcgttgccgcttgggtcggtctgcaccaggctcaactgctcgcctggctgagcggccggggcgagATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCACACCCGTGCCGATCACGGTGCCACTGGCATCGCGCACTTCGACAGTGGCACCCGGCTCGCCGCGACCGCTCAGGGCCAGGCCGTCAGCGCCAACTGTAATATTGGTTACTGCCTCA < CP009974/1158025‑1157878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |